Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478741
- Subject:
- XM_011245758.2
- Aligned Length:
- 1636
- Identities:
- 1318
- Gaps:
- 170
Alignment
Query 1 ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT 74
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||.||
Sbjct 1 ATGGAAGCAGCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTGTTCCACGACAGGGTCCGCGAGTGCATCAT 74
Query 75 ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT 148
.||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCAATACTTCTGTTTGCAACACTCTACATCCTCTGCCATATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT 148
Query 149 TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT 222
||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct 149 TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACAGTTAACAAGATTGCGCTGGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCGGTC 222
Query 223 GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA 296
||||||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||.||.|||||
Sbjct 223 GCCCTGGGCGCCGTCTTACTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAACGAGGTGCTGCTCTCGTTGCCACGCAACTA 296
Query 297 CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC 370
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 297 CTACATCCAGTGGCTCAATGGCTCCCTCATCCATGGTCTGTGGAACCTCGTTTTCCTCTTCTCCAATCTGTCCC 370
Query 371 TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG 444
||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCGTCTTCCTTATGCCCTTTGCATATTTCTTCACAGAGTCTGAAGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG 444
Query 445 GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC 518
|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCCGGGTCTACGAGACAGTGGTGATGTTGATCCTCCTCACGCTGCTTGTGCTGGGCATGGTGTGGGTGGCATC 518
Query 519 AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT 592
.||||||||.|||||..|||||||||.|||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 519 CGCCATTGTAGACAATGACAAGGCCAGCAGGGAGTCGCTCTACGACTTCTGGGAGTACTACCTCCCCTATCTCT 592
Query 593 ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC 666
||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 ACTCCTGTATCTCCTTCCTCGGAGTTCTGCTGCTTCTGGTGTGCACTCCACTAGGTCTCGCCCGCATGTTCTCT 666
Query 667 GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA 740
||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 667 GTCACTGGGAAGTTGCTGGTCAAGCCCCGGCTACTGGAAGACCTGGAGGAACAGCTGAACTGCTCAGCCTTTGA 740
Query 741 GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTA--------------------------------------------- 769
|||||||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 741 GGAGGCAGCTCTGACTCGAAGAATCTGCAGTGAGTCTAAATCCGCCCTTGCTTGGGTGGTGGTGGCCCGGCCTT 814
Query 770 --------------------------------------------ATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACA 799
||||.||.||||||||||||||..|.||||
Sbjct 815 GGCAAGGACTGAGTATTGGAGGGAAGTATGTCCTGTGCCCTCAGATCCCACCTCCTGCTGGCTGCCACTGGACA 888
Query 800 TGGAGCTGCTACACAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCT---------------------- 851
||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||| ||
Sbjct 889 TGGAACTGCTGCATAGACAGGTCCTGGCTCTGCAGGCACAGAGGGTCCT-CTTGGGTATGTGGCCTGGTAGTTT 961
Query 852 ------GGAG----------------------------------------------------AAGAGGCGGAAG 867
|||| |||.|.||||||
Sbjct 962 ACCCAAGGAGAGTTGTTCCTTGTCCCAAGTACTTACTAACGACCTCCCACCCACACACAGAAAAGCGTCGGAAG 1035
Query 868 GCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGT 941
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GCGTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCTCTGGCCATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTGT 1109
Query 942 TCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGGTACCT 1015
.|||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||.|.|..
Sbjct 1110 CCTCATCGTGGCTGTCCACATCCTGGAGCTGCTTATTGACGAGGCTGCCATGCCACGGGGCATGCAGGATGCTG 1183
Query 1016 CCTTAGGCCAGGTCTCCTTCTCCAAGCTGGGCTCCTTTGGTGCCGTCATTCAGGTTGTACTCATCTTTTACCTA 1089
||.|||||||||.||||||||||||.|||||.||||||||.|||.||||.||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1184 CCCTAGGCCAGGCCTCCTTCTCCAAACTGGGATCCTTTGGCGCCATCATCCAGGTTGTGCTGATATTTTACCTG 1257
Query 1090 ATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAGATGGCACGACACTGC 1163
||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..|.||||||.||||.||.|||||.|||||..|
Sbjct 1258 ATGGTGTCCTCAGTGGTGGGTTTCTACAGCTCTCCACTCTTTGGAAGCCTGAGGCCTAGGTGGCATGACACATC 1331
Query 1164 CATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTCGAACCC 1237
.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 1332 GATGACACAGATCATTGGGAACTGTGTCTGCCTCCTGGTCCTCAGCTCAGCACTTCCTGTCTTCTCTAGAACTC 1405
Query 1238 TGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAATTTCTACATTGTGTTC 1311
|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1406 TTGGCCTGACACGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTAGGCAATTTCTACATCGTGTTC 1479
Query 1312 CTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGCAGCTGTGCGGGCAGA 1385
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1480 CTCTACAACGCAGCCTTTGCTGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACGGCAGCTGTGAGGGCAGA 1553
Query 1386 GCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGGCATCTAGGAAGACCC 1459
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||.|||.||||||||||..|
Sbjct 1554 GCTGATCCGAGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCACTGCCTGTCTCTGGGTTTCCCCGGGCTTCTAGGAAGAAGC 1627
Query 1460 AGCACCAG 1467
||||.||.
Sbjct 1628 AGCATCAA 1635