Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478794
• Subject: NM_001142605.1
• Aligned Length: 2916
• Identities: 2810
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGGATACCGACTTATATGATGAGTTTGGGAATTATATTGGACCAGAGCTTGATTCTGATGAAGATGATGATGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATTGGGTAGAGAGACCAAAGATCTTGATGAGATGGATGATGATGACGACGACGATGACGTAGGAGATCATGACG  148
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------ATGGATGATGATGACGACGACGATGACGTAGGAGATCATGACG  43

Query  149  ATGACCACCCTGGGATGGAGGTGGTGCTGCATGAGGACAAGAAGTACTACCCAACAGCCGAGGAGGTGTATGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   44  ATGACCACCCTGGGATGGAGGTGGTGCTGCATGAGGACAAGAAGTACTACCCAACAGCCGAGGAGGTGTATGGT  117

Query  223  CCTGAGGTGGAGACCATAGTTCAAGAGGAAGACACTCAGCCTCTCACAGAACCCATTATTAAGCCAGTGAAAAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  CCTGAGGTGGAGACCATAGTTCAAGAGGAAGACACTCAGCCTCTCACAGAACCCATTATTAAGCCAGTGAAAAC  191

Query  297  CAAGAAATTCACTCTGATGGAGCAGACATTACCTGTTACGGTGTATGAGATGGATTTCTTGGCGGATCTGATGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  CAAGAAATTCACTCTGATGGAGCAGACATTACCTGTTACGGTGTATGAGATGGATTTCTTGGCGGATCTGATGG  265

Query  371  ATAACTCAGAGCTCATCAGAAATGTGACCCTTTGTGGACATCTCCACCATGGCAAGACATGTTTTGTGGATTGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  ATAACTCAGAGCTCATCAGAAATGTGACCCTTTGTGGACATCTCCACCATGGCAAGACATGTTTTGTGGATTGT  339

Query  445  TTAATTGAACAGACTCACCCGGAAATCAGAAAGCGCTATGACCAAGATCTGTGCTATACTGACATCCTCTTCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  TTAATTGAACAGACTCACCCGGAAATCAGAAAGCGCTATGACCAAGATCTGTGCTATACTGACATCCTCTTCAC  413

Query  519  AGAGCAAGAGAGAGGTGTAGGCATCAAAAGCACTCCTGTGACAGTGGTCTTGCCAGACACCAAAGGAAAATCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  AGAGCAAGAGAGAGGTGTAGGCATCAAAAGCACTCCTGTGACAGTGGTCTTGCCAGACACCAAAGGAAAATCTT  487

Query  593  ATCTCTTCAATATCATGGACACTCCAGGACATGTGAATTTCTCTGATGAGGTCACAGCTGGCTTGCGCATCTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  ATCTCTTCAATATCATGGACACTCCAGGACATGTGAATTTCTCTGATGAGGTCACAGCTGGCTTGCGCATCTCA  561

Query  667  GATGGAGTGGTCCTTTTCATTGATGCTGCTGAGGGGGTGATGCTGAACACAGAGCGGCTGATCAAGCATGCGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  GATGGAGTGGTCCTTTTCATTGATGCTGCTGAGGGGGTGATGCTGAACACAGAGCGGCTGATCAAGCATGCGGT  635

Query  741  GCAGGAGAGGCTGGCAGTCACTGTGTGCATCAACAAGATTGACCGGCTGATCCTGGAGCTGAAGCTGCCTCCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  GCAGGAGAGGCTGGCAGTCACTGTGTGCATCAACAAGATTGACCGGCTGATCCTGGAGCTGAAGCTGCCTCCAA  709

Query  815  CTGATGCTTATTACAAGCTGCGCCACATTGTGGATGAGGTCAATGGATTAATAAGCATGTATTCCACTGATGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  CTGATGCTTATTACAAGCTGCGCCACATTGTGGATGAGGTCAATGGATTAATAAGCATGTATTCCACTGATGAG  783

Query  889  AACCTGATCCTTTCCCCACTCCTGGGTAACGTCTGCTTCTCCAGCTCCCAGTACAGCATCTGCTTCACGCTGGT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  784  AACCTGATCCTTTCCCCACTCCTGGGTAACGTCTGCTTCTCCAGCTCCCAGTACAGCATCTGCTTCACGCTGGG  857

Query  963  CTCCTTTGCCAAGATCTATGCCGACACCTTTGGTGACATTAATTACCAAGAATTTGCTAAAAGACTCTGGGGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  CTCCTTTGCCAAGATCTATGCCGACACCTTTGGTGACATTAATTACCAAGAATTTGCTAAAAGACTCTGGGGTG  931

Query 1037  ACATCTACTTCAACCCTAAGACGCGAAAGTTCACCAAAAAGGCCCCAACTAGCAGCTCCCAGAGAAGTTTCGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  ACATCTACTTCAACCCTAAGACGCGAAAGTTCACCAAAAAGGCCCCAACTAGCAGCTCCCAGAGAAGTTTCGTG  1005

Query 1111  GAGTTTATCTTGGAGCCTCTTTATAAGATCCTCGCCCAGGTTGTAGGTGACGTGGACACCAGCCTCCCACGGAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  GAGTTTATCTTGGAGCCTCTTTATAAGATCCTCGCCCAGGTTGTAGGTGACGTGGACACCAGCCTCCCACGGAC  1079

Query 1185  CCTAGACGAGCTTGGCATCCACCTGACGAAGGAGGAGCTGAAGCTGAACATCCGCCCCTTGCTCAGGCTGGTCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  CCTAGACGAGCTTGGCATCCACCTGACGAAGGAGGAGCTGAAGCTGAACATCCGCCCCTTGCTCAGGCTGGTCT  1153

Query 1259  GCAAAAAGTTCTTTGGCGAGTTCACAGGCTTTGTGGACATGTGTGTGCAGCATATCCCTTCTCCAAAGGTGGGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  GCAAAAAGTTCTTTGGCGAGTTCACAGGCTTTGTGGACATGTGTGTGCAGCATATCCCTTCTCCAAAGGTGGGC  1227

Query 1333  GCCAAGCCCAAGATTGAGCACACCTACACCGGTGGTGTGGACTCCGACCTCGGCGAGGCTATGAGTGACTGTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228  GCCAAGCCCAAGATTGAGCACACCTACACCGGTGGTGTGGACTCCGACCTCGGCGAGGCTATGAGTGACTGTGA  1301

Query 1407  CCCTGATGGCCCCCTGATGTGCCACACTACTAAGATGTACAGCACAGATGATGGAGTCCAGTTTCACGCCTTTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302  CCCTGATGGCCCCCTGATGTGCCACACTACTAAGATGTACAGCACAGATGATGGAGTCCAGTTTCACGCCTTTG  1375

Query 1481  GCCGGGTGCTGAGTGGCACCATTCATGCTGGGCAGCCTGTGAAGGTACTGGGGGAGAACTACACCCTGGAGGAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376  GCCGGGTGCTGAGTGGCACCATTCATGCTGGGCAGCCTGTGAAGGTACTGGGGGAGAACTACACCCTGGAGGAT  1449

Query 1555  GAGGAAGACTCCCAGATATGCACCGTGGGCCGCCTTTGGATCTCTGTGGCCAGGTACCACATCGAGGTGAACCG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450  GAGGAAGACTCCCAGATATGCACCGTGGGCCGCCTTTGGATCTCTGTGGCCAGGTACCACATCGAGGTGAACCG  1523

Query 1629  TGTTCCTGCTGGCAACTGGGTTCTGATTGAAGGTGTTGATCAACCAATTGTGAAGACAGCAACCATAACCGAAC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524  TGTTCCTGCTGGCAACTGGGTTCTGATTGAAGGTGTTGATCAACCAATTGTGAAGACAGCAACCATAACCGAAC  1597

Query 1703  CCCGAGGCAATGAGGAGGCTCAGATTTTCCGACCCTTGAAGTTCAATACCACATCTGTTATCAAGATTGCTGTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598  CCCGAGGCAATGAGGAGGCTCAGATTTTCCGACCCTTGAAGTTCAATACCACATCTGTTATCAAGATTGCTGTG  1671

Query 1777  GAGCCAGTCAACCCCTCAGAGCTGCCCAAGATGCTTGATGGCCTGCGCAAGGTCAACAAGAGCTATCCATCCCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672  GAGCCAGTCAACCCCTCAGAGCTGCCCAAGATGCTTGATGGCCTGCGCAAGGTCAACAAGAGCTATCCATCCCT  1745

Query 1851  CACCACCAAGGTGGAGGAGTCTGGCGAGCATGTGATCCTGGGCACTGGGGAGCTCTACCTGGACTGTGTGATGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746  CACCACCAAGGTGGAGGAGTCTGGCGAGCATGTGATCCTGGGCACTGGGGAGCTCTACCTGGACTGTGTGATGC  1819

Query 1925  ATGATTTGCGGAAGATGTACTCAGAGATAGACATCAAGGTGGCTGACCCAGTTGTCACGTTTTGTGAGACGGTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1820  ATGATTTGCGGAAGATGTACTCAGAGATAGACATCAAGGTGGCTGACCCAGTTGTCACGTTTTGTGAGACGGTG  1893

Query 1999  GTGGAAACATCCTCCCTCAAGTGCTTTGCTGAAACGCCTAATAAGAAGAACAAGATCACCATGATTGCTGAGCC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1894  GTGGAAACATCCTCCCTCAAGTGCTTTGCTGAAACGCCTAATAAGAAGAACAAGATCACCATGATTGCTGAGCC  1967

Query 2073  TCTTGAGAAGGGCCTGGCAGAGGACATAGAGAATGAGGTGGTCCAGATTACGTGGAACAGGAAGAAGCTGGGAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968  TCTTGAGAAGGGCCTGGCAGAGGACATAGAGAATGAGGTGGTCCAGATTACGTGGAACAGGAAGAAGCTGGGAG  2041

Query 2147  AGTTCTTCCAGACCAAGTACGATTGGGATCTGCTGGCTGCCCGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGATGCGACT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042  AGTTCTTCCAGACCAAGTACGATTGGGATCTGCTGGCTGCCCGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGATGCGACT  2115

Query 2221  GGCCCCAACATTCTGGTGGATGATACTCTGCCCTCTGAGGTGGACAAGGCTCTTCTTGGTTCAGTGAAGGACAG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2116  GGCCCCAACATTCTGGTGGATGATACTCTGCCCTCTGAGGTGGACAAGGCTCTTCTTGGTTCAGTGAAGGACAG  2189

Query 2295  CATCGTTCAAGGTTTCCAGTGGGGAACCAGGGAGGGCCCCCTCTGTGATGAATTGATTCGGAATGTCAAGTTTA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2190  CATCGTTCAAGGTTTCCAGTGGGGAACCAGGGAGGGCCCCCTCTGTGATGAATTGATTCGGAATGTCAAGTTTA  2263

Query 2369  AGATCCTGGATGCGGTGGTTGCCCAGGAGCCCCTGCACCGGGGCGGGGGCCAGATCATCCCCACAGCCAGGAGA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2264  AGATCCTGGATGCGGTGGTTGCCCAGGAGCCCCTGCACCGGGGCGGGGGCCAGATCATCCCCACAGCCAGGAGA  2337

Query 2443  GTCGTCTACTCTGCCTTCCTCATGGCTACTCCTCGTCTGATGGAGCCTTACTACTTTGTAGAGGTCCAGGCCCC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338  GTCGTCTACTCTGCCTTCCTCATGGCTACTCCTCGTCTGATGGAGCCTTACTACTTTGTAGAGGTCCAGGCCCC  2411

Query 2517  TGCAGATTGCGTCTCTGCAGTTTATACCGTCCTGGCCAGGCGCAGGGGGCACGTGACTCAGGATGCACCCATCC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2412  TGCAGATTGCGTCTCTGCAGTTTATACCGTCCTGGCCAGGCGCAGGGGGCACGTGACTCAGGATGCACCCATCC  2485

Query 2591  CAGGCTCCCCTCTGTACACCATCAAAGCTTTTATCCCGGCCATCGACTCTTTTGGCTTTGAGACTGATCTCCGG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2486  CAGGCTCCCCTCTGTACACCATCAAAGCTTTTATCCCGGCCATCGACTCTTTTGGCTTTGAGACTGATCTCCGG  2559

Query 2665  ACTCACACCCAGGGACAAGCCTTTTCTCTGTCTGTCTTCCACCACTGGCAGATTGTGCCTGGTGATCCCCTGGA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2560  ACTCACACCCAGGGACAAGCCTTTTCTCTGTCTGTCTTCCACCACTGGCAGATTGTGCCTGGTGATCCCCTGGA  2633

Query 2739  CAAGAGCATTGTCATCCGCCCCTTGGAGCCACAGCCAGCTCCTCACCTGGCCCGGGAATTCATGATCAAAACCC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2634  CAAGAGCATTGTCATCCGCCCCTTGGAGCCACAGCCAGCTCCTCACCTGGCCCGGGAATTCATGATCAAAACCC  2707

Query 2813  GCCGTAGGAAGGGCCTCAGTGAAGATGTGAGCATCAGCAAATTCTTCGATGATCCTATGTTGCTGGAACTTGCC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2708  GCCGTAGGAAGGGCCTCAGTGAAGATGTGAGCATCAGCAAATTCTTCGATGATCCTATGTTGCTGGAACTTGCC  2781

Query 2887  AAACAGGATGTTGTGCTCAATTACCCCATG  2916
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2782  AAACAGGATGTTGTGCTCAATTACCCCATG  2811