Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478886
• Subject: NM_001253751.1
• Aligned Length: 1262
• Identities: 1080
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  ATGCCCCTGTCCCGCTGGTTGAGATCTGTGGGGGTCTTCCTGCTGCCAGCCCCCTACTGGGCACCCCGGGAGAG  74
            ||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCCTGTCCTGCTGGCTGAGATCTCTGGGGGTCTTCCTGCTGCCAGCCCCCTGCTGGGCACCCCGGGAGAG  74

Query   75  GTGGCTGGGTTCCCTACGGCGGCCCTCCCTGGTGCACGGGTACCCAGTCCT---GGCCTGGCACAGTGCCCGCT  145
            ||||||.||||.|||||..||.||||||||||...|.||||..||||||||   ||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGGCTTGGTTTCCTACAACGACCCTCCCTGGCATATGGGTGTCCAGTCCTGGGGGCCTGGCACAGTGCCCGCT  148

Query  146  GCTGGTGCCAAGCGTGGACAGAGGAACCTCGAGCCCTTTGCTCCTCCCTCAGAATGAACGGAGACCAGAATTCA  219
            |.||||||||||.||||||||||||.||||||||..||.|||||||..||||||||||.||..|||||||.|..
Sbjct  149  GGTGGTGCCAAGTGTGGACAGAGGAGCCTCGAGCATTTAGCTCCTCTGTCAGAATGAATGGGAACCAGAAATTG  222

Query  220  GATGTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGA  293
            ||||.||||..|||||||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||.|.||
Sbjct  223  GATGCTTATAACCAAGAAAAGCAGAATTTCATCCAGCACTTCTCCCAGATCGTCAAGGTGCTGACTGAGAAGGA  296

Query  294  GATGGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCA  367
            |.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  297  GCTGGGACACCCAGAGATAGGGGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTAGAGTACAATGCCTTAGGAGGCA  370

Query  368  AGTATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGT  441
            ||||.||||||||||||||.||||||..|||.||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||.|||
Sbjct  371  AGTACAACCGGGGTTTGACCGTGGTACAAGCCTTCCAGGAGCTGGTGGAGCCGAAGAAACAGGATGCTGAGAGT  444

Query  442  CTCCAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCAT  515
            ||.|||||||||..|||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  445  CTTCAGCGGGCCCTGACAGTGGGCTGGTGTGTAGAACTGCTCCAGGCTTTCTTCCTTGTGTCAGATGACATCAT  518

Query  516  GGATTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATG  589
            |||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|
Sbjct  519  GGACTCTTCCCTCACTCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCAGGCATAGGCTTGGATGCCATCAACG  592

Query  590  ATGCTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAAC  663
            |.|||...||.||||||||.|..|||||.||..||||||||.||||.|||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  ACGCTCTGCTTCTGGAAGCCTCCATCTATCGTTTGCTGAAGTTCTACTGCAGGGAGCAGCCCTACTACCTGAAC  666

Query  664  CTGATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCA  737
            |||.|.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|.|||||.|||||
Sbjct  667  CTGCTGGAGCTCTTTCTGCAGAGTTCCTATCAGACAGAGATCGGGCAGACTCTAGACCTCATGACAGCACCCCA  740

Query  738  GGGCAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACT  811
            ||||.||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GGGCCATGTGGATCTTGGTAGATACACTGAAAAGAGGTACAAATCGATTGTCAAGTACAAGACGGCTTTCTACT  814

Query  812  CCTTCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAG  885
            |.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||..|
Sbjct  815  CTTTCTACCTGCCTATTGCGGCCGCCATGTACATGGCAGGCATTGATGGGGAGAAGGAACACGCCAATGCCCTG  888

Query  886  AAGATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATTCAGGATGATTACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGT  959
            |||||||||.||||||||||.||||||||.|||.|.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  AAGATCCTGATGGAGATGGGCGAGTTCTTCCAGGTCCAGGACGACTACCTTGATCTCTTTGGAGACCCCAGTGT  962

Query  960  GACCGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGGCTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCA  1033
            |||.||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.
Sbjct  963  GACGGGAAAGGTCGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGGCTGGTGGTTCAGTGTCTGCTACGAGCCT  1036

Query 1034  CTCCAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGAGGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCG  1107
            ||||..|||||..|||||||.|..||||.|||||.|||||||||||..|.||.||||||||.||||||||.||.
Sbjct 1037  CTCCTCAACAGCGCCAGATCTTAGAGGAGAATTATGGGCAGAAGGACCCAGAAAAAGTGGCTCGGGTGAAAGCA  1110

Query 1108  CTATATGAGGAGCTGGATCTGCCAG-CAGTGTTCTTGCAA-TATGAGGAAGACAGTTACAGCCACATTATGGCT  1179
            ||.|||||||.|||||||||| ||| |.|..||||| ||| |||||||||||||||||||.||.|.|.|.|..|
Sbjct 1111  CTGTATGAGGCGCTGGATCTG-CAGTCTGCTTTCTT-CAAGTATGAGGAAGACAGTTACAACCGCCTCAAGAGT  1182

Query 1180  CTCATTGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGGCTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAG  1253
            |||||.||.||||.|.|.||.||||||||||||.||.||||..|||..|||||...|||.||||||||.|||||
Sbjct 1183  CTCATAGAGCAGTGCTCTGCGCCCCTGCCCCCATCCATCTTCATGGAACTTGCAAACAAGATCTACAAACGGAG  1256

Query 1254  AAAG  1257
            ||||
Sbjct 1257  AAAG  1260