Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478886
• Subject: NM_134469.4
• Aligned Length: 1259
• Identities: 905
• Gaps: 202

Alignment

Query    1  ATGCCCCTGTCCCGCTGGTTGAGATCTGTGGGGGTCTTCCTGCTGCCAGCCCCCTACTGGGCACCCCGGGAGAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTGGCTGGGTTCCCTACGGCGGCCCTCCCTGGTGCACGGGTACCCAGTCCTGGCCTGGCACAGTGCCCGCTGCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGTGCCAAGCGTGGACAGAGGAACCTCGAGCCCTTTGCTCCTCCCTCAGAATGAACGGAGACCAGAATTCAGAT  222
                                                              |||||.||..|||||||.|..|||
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGAATGGGAACCAGAAATTGGAT  24

Query  223  GTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGAGAT  296
            |.||||..|||||||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||.|.|||.|
Sbjct   25  GCTTATAACCAAGAAAAGCAGAATTTCATCCAGCACTTCTCCCAGATCGTCAAGGTGCTGACTGAGAAGGAGCT  98

Query  297  GGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCAAGT  370
            |||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||
Sbjct   99  GGGACACCCAGAGATAGGGGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTAGAGTACAATGCCTTAGGAGGCAAGT  172

Query  371  ATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGTCTC  444
            |.||||||||||||||.||||||..|||.||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||.|||||.
Sbjct  173  ACAACCGGGGTTTGACCGTGGTACAAGCCTTCCAGGAGCTGGTGGAGCCGAAGAAACAGGATGCTGAGAGTCTT  246

Query  445  CAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCATGGA  518
            |||||||||..|||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct  247  CAGCGGGCCCTGACAGTGGGCTGGTGTGTAGAACTGCTCCAGGCTTTCTTCCTTGTGTCAGATGACATCATGGA  320

Query  519  TTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATGATG  592
            .||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.||.|
Sbjct  321  CTCTTCCCTCACTCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCAGGCATAGGCTTGGATGCCATCAACGACG  394

Query  593  CTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAACCTG  666
            ||...||.||||||||.|..|||||.||..||||||||.||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  395  CTCTGCTTCTGGAAGCCTCCATCTATCGTTTGCTGAAGTTCTACTGCAGGGAGCAGCCCTACTACCTGAACCTG  468

Query  667  ATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCAGGG  740
            .|.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|.|||||.||||||||
Sbjct  469  CTGGAGCTCTTTCTGCAGAGTTCCTATCAGACAGAGATCGGGCAGACTCTAGACCTCATGACAGCACCCCAGGG  542

Query  741  CAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACTCCT  814
            |.||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  543  CCATGTGGATCTTGGTAGATACACTGAAAAGAGGTACAAATCGATTGTCAAGTACAAGACGGCTTTCTACTCTT  616

Query  815  TCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAGAAG  888
            |||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||..||||
Sbjct  617  TCTACCTGCCTATTGCGGCCGCCATGTACATGGCAGGCATTGATGGGGAGAAGGAACACGCCAATGCCCTGAAG  690

Query  889  ATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATTCAGGATGATTACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGTGAC  962
            ||||||.||||||||||.||||||||.|||.|.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  691  ATCCTGATGGAGATGGGCGAGTTCTTCCAGGTCCAGGACGACTACCTTGATCTCTTTGGAGACCCCAGTGTGAC  764

Query  963  CGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGGCTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCACTC  1036
            .||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.|||
Sbjct  765  GGGAAAGGTCGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGGCTGGTGGTTCAGTGTCTGCTACGAGCCTCTC  838

Query 1037  CAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGAGGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCGCTA  1110
            |..|||||..|||||||.|..||||.|||||.|||||||||||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.
Sbjct  839  CTCAACAGCGCCAGATCTTAGAGGAGAATTATGGGCAGAAGGACCCAGAAAAAGTGGCTCGGGTGAAAGCACTG  912

Query 1111  TATGAGGAGCTGGATCTGCCAG-CAGTGTTCTTGCAA-TATGAGGAAGACAGTTACAGCCACATTATGGCTCTC  1182
            |||||||.|||||||||| ||| |.|..||||| ||| |||||||||||||||||||.||.|.|.|.|..||||
Sbjct  913  TATGAGGCGCTGGATCTG-CAGTCTGCTTTCTT-CAAGTATGAGGAAGACAGTTACAACCGCCTCAAGAGTCTC  984

Query 1183  ATTGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGGCTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAGAAA  1256
            ||.||.||||.|.|.||.||||||||||||.||.||||..|||..|||||...|||.||||||||.||||||||
Sbjct  985  ATAGAGCAGTGCTCTGCGCCCCTGCCCCCATCCATCTTCATGGAACTTGCAAACAAGATCTACAAACGGAGAAA  1058

Query 1257  G  1257
            |
Sbjct 1059  G  1059