Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478986
• Subject: NM_001313971.1
• Aligned Length: 951
• Identities: 758
• Gaps: 42

Alignment

Query   1  ATGCTGGTCACCTTGGGACTGCTCACCTCCTTCTTCTCGTTCCTGTATATGGTAGCTCCATCCATCAGGAAGTT  74
           ||||||.|.|.|||||.||||||.||.||||||.||||..||.|||||.||..|||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCTGTTTATCTTGGTACTGCTTACGTCCTTCCTCTCCATCTTGTATCTGACAGCTCCATCCATCAGGAAGTT  74

Query  75  CTTTGCTGGTGGAGTGTGTAGAACAAATGTGCAGCTTCCTGGCAAGGTAGTGGTGATCACTGGCGCCAACACGG  148
           |||||||||||||||.||||.|||||||||.|||.|.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct  75  CTTTGCTGGTGGAGTTTGTACAACAAATGTCCAGATCCCAGGGAAGGTAGTGGTCATCACAGGTGCCAACACAG  148

Query 149  GCATTGGCAAGGAGACGGCCAGAGAGCTCGCTAGCCGAGGAGCCCGAGTCTATATTGCCTGCAGAGATGTACTG  222
           ||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|..|||||||.|||||.||.|||||.|||.|||||||.|||
Sbjct 149  GCATTGGCAAGGAGACAGCCAGAGAGCTTGCTCGAAGAGGAGCACGAGTATACATTGCTTGCCGAGATGTGCTG  222

Query 223  AAGGGGGAGTCTGCTGCCAGTGAAATCCGAGTGGATACAAAGAACTCCCAGGTGCTGGTGCGGAAATTGGACCT  296
           |||||.|||||||||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223  AAGGGAGAGTCTGCTGCTAGTGAAATCCGAGCAGATACCAAGAACTCCCAGGTGCTAGTGCGGAAATTGGACCT  296

Query 297  ATCCGACACCAAATCTATCCGAGCCTTTGCTGAGGGCTTTCTGGCAGAGGAAAAGCAGCTCCATATTCTGATCA  370
           .||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||.||.|||                            
Sbjct 297  GTCTGACACCAAATCCATCCGAGCCTTTGCTGAACGCTTCCTAGCA----------------------------  342

Query 371  ACAATGCGGGAGTAATGATGTGTCCATATTCCAAGACAGCTGATGGCTTTGAAACCCACCTGGGAGTCAACCAC  444
                   |||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||
Sbjct 343  --------GGAGTGATGATGTGCCCATATTCTAAGACAACAGATGGCTTTGAGACCCACTTTGGAGTCAACCAC  408

Query 445  CTGGGCCACTTCCTCCTCACCTACCTGCTCCTGGAGCAGCTAAAGGTGTCTGCCCCTGCACGGGTGGTTAATGT  518
           |||||.|||||.||.||.||.||||||||..|||||..|||.||||.||||||.||.|||||||||||.||..|
Sbjct 409  CTGGGACACTTTCTTCTTACATACCTGCTGTTGGAGAGGCTGAAGGAGTCTGCTCCCGCACGGGTGGTCAACCT  482

Query 519  GTCCTCGGTGGCTCACCACATTGGCAAGATTCCCTTCCACGACCTCCAGAGCGAGAAGCGCTACAGCAGGGGTT  592
           .|||||..|.|||||||..|||||||||||.|..|||||.||||||||..||.||||.||.|||.||||.|.||
Sbjct 483  TTCCTCAATAGCTCACCTGATTGGCAAGATCCGTTTCCATGACCTCCAAGGCCAGAAACGATACTGCAGTGCTT  556

Query 593  TTGCCTATTGCCACAGCAAGCTGGCCAATGTGCTTTTTACTCGTGAGCTGGCCAAGAGGCTCCAAGGCACCGGG  666
           ||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||.|||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.||.
Sbjct 557  TTGCCTATGGCCACAGCAAGCTGGCCAATCTGCTCTTCACTCGAGAACTGGCTAAGCGGCTCCAAGGGACTGGA  630

Query 667  GTCACCACCTACGCAGTGCACCCAGGCGTCGTCCGCTCTGAGCTGGTCCGGCACTCCTCCCTGCTCTGCCTGCT  740
           ||||||.||||.||.||.|||||.|||||.||....||.|||.|...|.||.||||||.||||||.||..||||
Sbjct 631  GTCACCGCCTATGCGGTTCACCCGGGCGTTGTATTGTCAGAGATCACCAGGAACTCCTACCTGCTGTGTTTGCT  704

Query 741  CTGGCGGCTCTTCTCCCCCTTTGTCAAG---ACGGCACGGGAGGGGGCGCAGACCAGCCTGCACTGCGCCCTGG  811
           .||||||||||||||.|||||..|||||   ||..|.|   |||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 705  ATGGCGGCTCTTCTCACCCTTCTTCAAGTCCACTTCTC---AGGGGGCTCAGACCAGCCTGCACTGTGCTCTGG  775

Query 812  CTGAGGGCCTGGAGCCCCTGAGTGGCAAGTACTTCAGTGACTGCAAGAGGACCTGGGTGTCTCCAAGGGCCCGA  885
           |.||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||.||..||||||||||.
Sbjct 776  CGGAGGACCTAGAGCCCCTGAGTGGAAAGTACTTCAGTGACTGCAAGAGGATGTGGGTATCCTCAAGGGCCCGG  849

Query 886  AATAACAAAACAGCTGAGCGCCTATGGAATGTCAGCTGTGAGCTTCTAGGAATCCGGTGGGAG  948
           ||.||.||||||||||||||..|.|||||.||||||||.||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 850  AACAAGAAAACAGCTGAGCGATTGTGGAACGTCAGCTGCGAGCTTCTAGGAATCCAGTGGGAA  912