Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479008
• Subject: NM_178887.4
• Aligned Length: 1385
• Identities: 1186
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGGTCAACGACCGGTGGAAGACCATGGGCGGCGCTGCCCAACTTGAGGACCGGCCGCGCGACAAGCCGCAGCG  74
            ||||||.||||.||||||||||||.|||||.||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGTCCACGAGCGGTGGAAGACCGTGGGCAGCGCGTCCCAACTTGAGGACCGACCGCGCGACAAACCGCAGCG  74

Query   75  GCCGAGCTGCGGCTACGTGCTGTGCACCGTGCTGCTGGCCCTGGCTGTGCTGCTGGCTGTAGCTGTCACCGGTG  148
            ..|.||||||.|.||.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  AGCAAGCTGCAGTTATGTCCTGTGCACGGTGCTCCTGTCCCTTGCGGTGCTGCTGGCGGTGGCTGTCACCGGTG  148

Query  149  CCGTGCTCTTCCTGAACCACGCCCACGCGCCGGGCACGGCGCCCCCACCTGTCGTCAGCACTGGGGCTGCCAGC  222
            ..||.|||||||||||||||.|||||.|.||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||.|||||.|.
Sbjct  149  TGGTTCTCTTCCTGAACCACACCCACACACCAGGCACGGCGCCCCCACCCATCGTCAGCACGGGGACTGCCGGA  222

Query  223  GCCAACAGCGCCGTGGTCACTGTGGAAAGGGCGGACAGCTCGCACCTCAGCATCCTCATTGACCCGCGCTGCCC  296
            ||||||||.|||.|||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  223  GCCAACAGTGCCCTGGTCACTGTGGAGAGGGCTGACAGCTCCCACCTCAGCCTTCTCATCGACCCTCGCTGCCC  296

Query  297  CGACCTCACCGACAGCTTCGCACGCCTGGAGAGCGCCCAGGCCTCGGTGCTGCAGGCGCTGACAGAGCACCAGG  370
            |||||||||.|||||||||||.||||||||..||..|||||||||..|.||.|.|||.||||..||||||||||
Sbjct  297  CGACCTCACTGACAGCTTCGCCCGCCTGGAAGGCATCCAGGCCTCCATCCTTCGGGCACTGAGTGAGCACCAGG  370

Query  371  CCCAGCCACGGCTGGTGGGCGACCAGGAGCAGGAGCTGCTGGACACGCTGGCCGACCAGCTGCCCCGGCTGCTG  444
            |.|||||..||||||..||.|.|      |..||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  CACAGCCGAGGCTGGACGGTGCC------CCCGAGCTGCTGGACGCACTGGCTGACCAGCTGCCCCGGCTGCTA  438

Query  445  GCCCGAGCCTCAGAGCTGCAGACGGA--GTGCATGGGGCTGCGGAAGGGGCATGGCACGCTGGGCCAGGGCCTC  516
            .||||.|||||.|||||||||.|.||  ||||  .||||||||.|||||.||..||..||||||||||||||||
Sbjct  439  ACCCGGGCCTCTGAGCTGCAGGCTGAATGTGC--TGGGCTGCGCAAGGGACACAGCCTGCTGGGCCAGGGCCTC  510

Query  517  AGCGCCCTGCAGAGTGAGCAGGGCCGCCTCATCCAGCTTCTCTCTGAGAGCCAGGGCCACATGGCTCACCTGGT  590
            |||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  511  AGCACCCTGCAGAGTGAACAGGGTCGCCTCATCCAGCTTCTCTCTGAGAGTCAAGGTCACATGGCTCACCTGGT  584

Query  591  GAACTCCGTCAGCGACATCCTGGATGCCCTGCAGAGGGACCGGGGGCTGGGCCGGCCCCGCAACAAGGCCGACC  664
            ||||||.|||||.||..|||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||...||||||.||||
Sbjct  585  GAACTCAGTCAGTGATGTCCTGGAGGCTCTGCAGAGGGAGCGGGGCCTAGGCCGGCCCCGTGTCAAGGCTGACC  658

Query  665  TTCAGAGAGCGCCTGCCCGGGGAACCCGGCCCCGGGGCTGTGCCACTGGCTCCCGGCCCCGAGACTGTCTGGAC  738
            |||||||.||.|||.||||||||.||||||||||.||||||||.|.||||||.|||||.||.|||||.|||||.
Sbjct  659  TTCAGAGGGCCCCTTCCCGGGGAGCCCGGCCCCGAGGCTGTGCTAATGGCTCTCGGCCGCGGGACTGCCTGGAT  732

Query  739  GTCCTCCTAAGCGGACAGCAGGACGATGGCGTCTACTCTGTCTTTCCCACCCACTACCCGGCCGGCTTCCAGGT  812
            ||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  733  GTTCTCCTGAGTGGACAGCAGGATGATGGTGTCTACTCTATCTTCCCCACTCACTACCCAGCTGGCTTCCAGGT  806

Query  813  GTACTGTGACATGCGCACGGACGGCGGCGGCTGGACGGTGTTTCAGCGCCGGGAGGACGGCTCCGTGAACTTCT  886
            .|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct  807  CTACTGTGACATGCGCACTGATGGTGGAGGCTGGACGGTATTTCAGCGCCGGGAAGATGGCTCTGTGAACTTTT  880

Query  887  TCCGGGGCTGGGATGCGTACCGAGACGGCTTTGGCAGGCTCACCGGGGAGCACTGGCTAGGGCTCAAGAGGATC  960
            ||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||||.||||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||.
Sbjct  881  TCCGAGGTTGGGAGGCGTACCGGGAGGGCTTCGGCAAGCTCACAGGAGAGCACTGGCTGGGGCTCAAGCGGATT  954

Query  961  CACGCCCTGACCACACAGGCTGCCTACGAGCTGCACGTGGACCTGGAGGACTTTGAGAATGGCACGGCCTATGC  1034
            |||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  955  CACGCCCTGACCACACAAGCAGCATACGAGCTTCACGTGGACCTAGAAGACTTTGACAACGGCACCGCCTATGC  1028

Query 1035  CCGCTACGGGAGCTTCGGCGTGGGCTTGTTCTCCGTGGACCCTGAGGAAGACGGGTACCCGCTCACCGTGGCTG  1108
            ||.|||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1029  CCACTACGGGAGTTTTGGTGTGGGCTTGTTCTCTGTGGACCCCGAGGAGGATGGGTACCCACTCACGGTGGCTG  1102

Query 1109  ACTATTCCGGCACTGCAGGCGACTCCCTCCTGAAGCACAGCGGCATGAGGTTCACCACCAAGGACCGTGACAGC  1182
            ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1103  ACTACTCCGGCACCGCAGGTGACTCCCTCCTGAAGCACAGTGGCATGAGGTTTACCACCAAGGACCGGGACAGC  1176

Query 1183  GACCATTCAGAGAACAACTGTGCCGCCTTCTACCGCGGTGCCTGGTGGTACCGCAACTGCCACACGTCCAACCT  1256
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1177  GACCACTCGGAGAACAACTGTGCCGCCTTCTACCGAGGAGCCTGGTGGTACCGCAACTGTCACACATCCAACCT  1250

Query 1257  CAATGGGCAGTACCTGCGCGGTGCGCACGCCTCCTATGCCGACGGCGTGGAGTGGTCCTCCTGGACCGGCTGGC  1330
            ||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1251  CAATGGCCAGTACCTGCGTGGTGCACACGCCTCCTACGCAGACGGCGTCGAGTGGTCCTCTTGGACGGGATGGC  1324

Query 1331  AGTACTCACTCAAGTTCTCTGAGATGAAGATCCGGCCGGTCCGGGAGGACCGC  1383
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1325  AGTATTCACTCAAGTTCTCGGAGATGAAGATCCGGCCGGTCCGTGAGGACCGC  1377