Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479053
- Subject:
- XM_011540366.2
- Aligned Length:
- 2213
- Identities:
- 1930
- Gaps:
- 262
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCAGCTTCACATTCCGGATATCTTTATGTTGGGGAAAATGTTTCAAAGGTACAAAACTCAAAACATGAACA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACAATATATATTACCAATCTTCAAACCTGGTTTGCCTAGAACTGGAATACAGTTGCCTGCGACATATTTTAGAA 148
Query 1 --------------------ATGG--AACTTGAAAATG-------ATTATTGCTTGAATGATTACAACAT---- 41
|||| ||| .||||| | ||| |||.||||||.|.|||||
Sbjct 149 GAACTAGAAAAGTCAAAGTAATGGATAAC-AGAAAA-GAGCCTCCATT----CTTCAATGATGATAACATGGGA 216
Query 42 ---------TTCAGA---------------AGGGTGGA------CCTTGAAGC--TA----------GTTTTG- 72
|.|||| |...|||| |.|||||.| || ||||||
Sbjct 217 CCATTTTACTACAGACTTCATTTCTGTGATACCATGGAGCTCTTCATTGAAACATTAACTGGAACATGTTTTGA 290
Query 73 GCTATGCGTGGCGGACCTAT------------------------AAATACTAGAAG------AGTTCCTACAGA 116
|||..|.||..| ||||.| |||.|.|.|||| ||||||||||||
Sbjct 291 GCTGAGAGTTTC--ACCTTTTGAAACTGTTATTTCTGTGAAAGCAAAAATTCGAAGATTGGAAGTTCCTACAGA 362
Query 117 CGATCCACTTAGGACGATGGCAGAGTACTTGGATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCA 190
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 CGATCCACTTAGGAAGATGGCAGAGTACTTGGATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCA 436
Query 191 AACAAGTTACATTTTTGGTATACCAAGAAGGAGATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGC 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 437 AACAAGTTACATTTTTGGTATACCAAGAAGGAGATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGC 510
Query 265 ACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAAAATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACA 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 ACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAAAATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACA 584
Query 339 TCGTATGAGTGGTGGTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTGAGCCTTCTTCTTCTGGGC 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 585 TCGTATGAGTGGTGGTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTGAGCCTTCTTCTTCTGGGC 658
Query 413 AACAGATAATTGAAAATTCAATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTC 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 659 AACAGATAATTGAAAATTCAATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTC 732
Query 487 AGCAAAAAGCCTAAGAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCAC 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 733 AGCAAAAAGCCTAAGAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCAC 806
Query 561 TGCACCATCTCGCCACCGATTGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAATG 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 TGCACCATCTCGCCACCGATTGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAATG 880
Query 635 CATATCCGCCCGAAATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCTGCTGAGAGATACATATCT 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 CATATCCGCCCGAAATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCTGCTGAGAGATACATATCT 954
Query 709 TCTATCACTGGTGAATTTCTTAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGT 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 TCTATCACTGGTGAATTTCTTAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGT 1028
Query 783 CAAACTACCTCCTCAGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTGACTCTGTTCTCCATCTTG 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 CAAACTACCTCCTCAGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTGACTCTGTTCTCCATCTTG 1102
Query 857 GATCATCCCTGCCTAGGCAAACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCT 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103 GATCATCCCTGCCTAGGCAAACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCT 1176
Query 931 TCAGAAGAATGTGTAACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTCATTTGCAGAAGGAAATGC 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 TCAGAAGAATGTGTAACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTCATTTGCAGAAGGAAATGC 1250
Query 1005 TGATGAACAGAGCAGCGGCTTAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAG 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 TGATGAACAGAGCAGCGGCTTAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAG 1324
Query 1079 GGTTGAAAGCTCCAGAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAATCAGTAGAGACTTCAGTT 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325 GGTTGAAAGCTCCAGAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAATCAGTAGAGACTTCAGTT 1398
Query 1153 CTTAACTACCGGGAATTAAGTCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCT 1226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399 CTTAACTACCGGGAATTAAGTCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCT 1472
Query 1227 ACATAATTCTCTGGTGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCTACAGCCTTCTTCTTCTC 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473 ACATAATTCTCTGGTGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCTACAGCCTTCTTCTTCTC 1546
Query 1301 AGTCACTGGATGTTCAAAACATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGAT 1374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 AGTCACTGGATGTTCAAAACATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGAT 1620
Query 1375 TCGCTTGGGAAAAGATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAATGACTAACAAGGCTTC 1448
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 TCACTTGGGAAAAGATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAATGACTAACAAGGCTTC 1694
Query 1449 CAAAGAGCCTGTTGGTTGTGTAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGAT 1522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695 CAAAGAGCCTGTTGGTTGTGTAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGAT 1768
Query 1523 TACAGAGCACACGTGGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCTCCAGCATTTTCAG 1596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769 TACAGAGCACACGTGGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCTCCAGCATTTTCAG 1842
Query 1597 GAAGAAAACTTTAGGAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTCTACCCATGGTGTTGGAAT 1670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 GAAGAAAACTTTAGGAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTCTACCCATGGTGTTGGAAT 1916
Query 1671 GAATGGAAATAATGCAGCAGCAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCC 1744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 GAATGGAAATAATGCAGCAGCAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCC 1990
Query 1745 CTCTTCAGACAAAGAAGAAAACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGCTAC 1818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1991 CTCTTCAGACAAAGAAGAAAACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGCTAC 2064
Query 1819 GAATGCAGATGTGGAAACAACTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAA 1892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065 GAATGCAGATGTGGAAACAACTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAA 2138
Query 1893 GAGTGCAGGGAGGAGATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAAATC 1959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2139 GAGTGCAGGGAGGAGATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAAATC 2205