Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479053
• Subject: XM_017016938.2
• Aligned Length: 2045
• Identities: 1930
• Gaps: 94

Alignment

Query    1  ATGG--AACTTGAAAATG-------ATTATTGCTTGAATGATTACAACAT-------------TTCAGA-----  47
            ||||  ||| .||||| |       |||    |||.||||||.|.|||||             |.||||     
Sbjct    1  ATGGATAAC-AGAAAA-GAGCCTCCATT----CTTCAATGATGATAACATGGGACCATTTTACTACAGACTTCA  68

Query   48  ----------AGGGTGGA------CCTTGAAGC--TA----------GTTTTG-GCTATGCGTGGCGGACCTAT  92
                      |...||||      |.|||||.|  ||          |||||| |||..|.||..|  ||||.|
Sbjct   69  TTTCTGTGATACCATGGAGCTCTTCATTGAAACATTAACTGGAACATGTTTTGAGCTGAGAGTTTC--ACCTTT  140

Query   93  ------------------------AAATACTAGAAG------AGTTCCTACAGACGATCCACTTAGGACGATGG  136
                                    |||.|.|.||||      ||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  141  TGAAACTGTTATTTCTGTGAAAGCAAAAATTCGAAGATTGGAAGTTCCTACAGACGATCCACTTAGGAAGATGG  214

Query  137  CAGAGTACTTGGATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCAAACAAGTTACATTTTTGGTA  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  CAGAGTACTTGGATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCAAACAAGTTACATTTTTGGTA  288

Query  211  TACCAAGAAGGAGATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGCACTTTAACACCGTTATCTGA  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  TACCAAGAAGGAGATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGCACTTTAACACCGTTATCTGA  362

Query  285  CTCTTCAAAGAAAATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACATCGTATGAGTGGTGGTTCTA  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  CTCTTCAAAGAAAATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACATCGTATGAGTGGTGGTTCTA  436

Query  359  TGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTGAGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAAAATTCA  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  TGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTGAGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAAAATTCA  510

Query  433  ATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTCAGCAAAAAGCCTAAGAAAGC  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  ATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTCAGCAAAAAGCCTAAGAAAGC  584

Query  507  TGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCCACCGAT  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  TGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCCACCGAT  658

Query  581  TGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAATGCATATCCGCCCGAAATCTCC  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  TGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAATGCATATCCGCCCGAAATCTCC  732

Query  655  AGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCTGCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGAATTTCT  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  AGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCTGCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGAATTTCT  806

Query  729  TAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGTCAAACTACCTCCTCAGATAC  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  TAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGTCAAACTACCTCCTCAGATAC  880

Query  803  CCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTGACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCTAGGCAA  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  CCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTGACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCTAGGCAA  954

Query  877  ACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCTTCAGAAGAATGTGTAACCGA  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  ACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCTTCAGAAGAATGTGTAACCGA  1028

Query  951  ACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTCATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCAGCGGCT  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  ACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTCATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCAGCGGCT  1102

Query 1025  TAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAGGGTTGAAAGCTCCAGAGCAG  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103  TAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAGGGTTGAAAGCTCCAGAGCAG  1176

Query 1099  CATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAATCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGAATTAAG  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177  CATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAATCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGAATTAAG  1250

Query 1173  TCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCTACATAATTCTCTGGTGAAAC  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251  TCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCTACATAATTCTCTGGTGAAAC  1324

Query 1247  CAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCTACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTTCAAAAC  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  CAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCTACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTTCAAAAC  1398

Query 1321  ATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGATTCGCTTGGGAAAAGATCTGA  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1399  ATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGATTCACTTGGGAAAAGATCTGA  1472

Query 1395  TGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAATGACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTGGTTGTG  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473  TGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAATGACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTGGTTGTG  1546

Query 1469  TAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACACGTGGGGCA  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547  TAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACACGTGGGGCA  1620

Query 1543  GGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCTCCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAGGAAAAG  1616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621  GGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCTCCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAGGAAAAG  1694

Query 1617  TTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTCTACCCATGGTGTTGGAATGAATGGAAATAATGCAGCAG  1690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1695  TTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTCTACCCATGGTGTTGGAATGAATGGAAATAATGCAGCAG  1768

Query 1691  CAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAGAAGAAA  1764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769  CAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAGAAGAAA  1842

Query 1765  ACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGCTACGAATGCAGATGTGGAAACAA  1838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843  ACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGCTACGAATGCAGATGTGGAAACAA  1916

Query 1839  CTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGAGATACT  1912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917  CTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGAGATACT  1990

Query 1913  TGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAAATC  1959
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1991  TGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAAATC  2037