Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479053
• Subject: XM_017016942.1
• Aligned Length: 1977
• Identities: 1882
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGGAACTTGAAAATGATTATTGCTTGAATGATTACAACATTTCAGAAGGGTGGACCTTGAAGCTAGTTTTGGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TATGCGTGGCGGACCTATAAATACTAGAAGAGTTCCTACAGACGATCCACTTAGGACGATGGCAGAGTACTTGG  148
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  -ATGCGTGGCGGACCTATAAATACTAGAAGAGTTCCTACAGACGATCCACTTAGGAAGATGGCAGAGTACTTGG  73

Query  149  ATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCAAACAAGTTACATTTTTGGTATACCAAGAAGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  ATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCAAACAAGTTACATTTTTGGTATACCAAGAAGGA  147

Query  223  GATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGCACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  GATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGCACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAA  221

Query  297  AATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACATCGTATG------------------AGTGGTG  352
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||
Sbjct  222  AATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACATCGTATGAGTTATTGTTTTCTTTGCAGTGGTG  295

Query  353  GTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTGAGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAA  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  GTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTGAGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAA  369

Query  427  AATTCAATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTCAGCAAAAAGCCTAA  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  AATTCAATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTCAGCAAAAAGCCTAA  443

Query  501  GAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCC  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCC  517

Query  575  ACCGATTGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAATGCATATCCGCCCGAA  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  ACCGATTGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAATGCATATCCGCCCGAA  591

Query  649  ATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCTGCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  ATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCTGCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGA  665

Query  723  ATTTCTTAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGTCAAACTACCTCCTC  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  ATTTCTTAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGTCAAACTACCTCCTC  739

Query  797  AGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTGACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCT  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTGACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCT  813

Query  871  AGGCAAACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCTTCAGAAGAATGTGT  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  AGGCAAACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCTTCAGAAGAATGTGT  887

Query  945  AACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTCATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCA  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  AACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTCATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCA  961

Query 1019  GCGGCTTAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAGGGTTGAAAGCTCCA  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  GCGGCTTAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAGGGTTGAAAGCTCCA  1035

Query 1093  GAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAATCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGA  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAATCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGA  1109

Query 1167  ATTAAGTCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCTACATAATTCTCTGG  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  ATTAAGTCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCTACATAATTCTCTGG  1183

Query 1241  TGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCTACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTT  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  TGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCTACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTT  1257

Query 1315  CAAAACATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGATTCGCTTGGGAAAAG  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1258  CAAAACATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGATTCACTTGGGAAAAG  1331

Query 1389  ATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAATGACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTG  1462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  ATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAATGACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTG  1405

Query 1463  GTTGTGTAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACACGT  1536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  GTTGTGTAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACACGT  1479

Query 1537  GGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCTCCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAG  1610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  GGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCTCCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAG  1553

Query 1611  GAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTCTACCCATGGTGTTGGAATGAATGGAAATAATG  1684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  GAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTCTACCCATGGTGTTGGAATGAATGGAAATAATG  1627

Query 1685  CAGCAGCAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAG  1758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  CAGCAGCAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAG  1701

Query 1759  AAGAAAACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGCTACGAATGCAGATGTGG  1832
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  AAGAAAACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGCTACGAATGCAGATGTGG  1775

Query 1833  AAACAACTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGA  1906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  AAACAACTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGA  1849

Query 1907  GATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAAATC  1959
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  GATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAAATC  1902