Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479053
• Subject: XM_024448260.1
• Aligned Length: 1977
• Identities: 1826
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGGAACTTGAAAATGATTATTGCTTGAATGATTACAACATTTCAGAAGGGTGGACCTTGAAGCTAGTTTTGGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TATGCGTGGCGGACCTATAAATACTAGAAGAGTTCCTACAGACGATCCACTTAGGACGATGGCAGAGTACTTGG  148
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------ATGGCAGAGTACTTGG  16

Query  149  ATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCAAACAAGTTACATTTTTGGTATACCAAGAAGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   17  ATTCCAGTCGAGTTGAGGTCTGGGAGAAGACCTCCTGCAGCAAACAAGTTACATTTTTGGTATACCAAGAAGGA  90

Query  223  GATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGCACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   91  GATCAATTGAATTTCTTTCCTGCAGTAGATAGGGGAGATGGCACTTTAACACCGTTATCTGACTCTTCAAAGAA  164

Query  297  AATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACATCGTATG------------------AGTGGTG  352
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||
Sbjct  165  AATAGATTTTCATTTGCATGTCCTACGGAGAAAAGGAGAACATCGTATGAGTTATTGTTTTCTTTGCAGTGGTG  238

Query  353  GTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTGAGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAA  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  239  GTTCTATGTATAATTCAGATACAGATGAGGATGAAGAAACTGAGCCTTCTTCTTCTGGGCAACAGATAATTGAA  312

Query  427  AATTCAATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTCAGCAAAAAGCCTAA  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  313  AATTCAATAACTATGAATAAGATGAAGCTGCTGAAGGCTAAGATGAAGAACATGAATCTCAGCAAAAAGCCTAA  386

Query  501  GAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCC  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  387  GAAAGCTGTCAAGATAAAACCTCACCCACCTGTAGCTCCTCGACCTTCTAGTGGTTCCACTGCACCATCTCGCC  460

Query  575  ACCGATTGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAATGCATATCCGCCCGAA  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  461  ACCGATTGTTAAGGGTCCTCCCCAACATTGGTCAATCTTGTTCACCTGCTTTTGGGAATGCATATCCGCCCGAA  534

Query  649  ATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCTGCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  535  ATCTCCAGGAATGGAATTTCAAGTTTGGCAACTCAACTCTCTGCTGAGAGATACATATCTTCTATCACTGGTGA  608

Query  723  ATTTCTTAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGTCAAACTACCTCCTC  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  609  ATTTCTTAAGGAAGATAATAGCTGGGAGAATAACACACTGTCTCACTTCAGTAGCAACGTCAAACTACCTCCTC  682

Query  797  AGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTGACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCT  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  683  AGATACCCCATTTGGAGTTGGGAAATGACCAGGAGCTTGCTGACTCTGTTCTCCATCTTGGATCATCCCTGCCT  756

Query  871  AGGCAAACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCTTCAGAAGAATGTGT  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  757  AGGCAAACAAAACATTTTTTAGGAAACTTGCCATCTAGTAATGGGAACATTGTCTTACCTTCAGAAGAATGTGT  830

Query  945  AACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTCATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCA  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  831  AACCGAACAATCACTTCTACCTAAAGTGGGCTCACTGGCTTCATTTGCAGAAGGAAATGCTGATGAACAGAGCA  904

Query 1019  GCGGCTTAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAGGGTTGAAAGCTCCA  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  905  GCGGCTTAGAAGGTGCGTGCAAAGTGAATCTGGAGTTGCTACTCACTAATGCTGACAAAGGGTTGAAAGCTCCA  978

Query 1093  GAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAATCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGA  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  979  GAGCAGCATCTCAAGCATGTTGCAGGAGTGCTGAATGGGGAATCAGTAGAGACTTCAGTTCTTAACTACCGGGA  1052

Query 1167  ATTAAGTCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCTACATAATTCTCTGG  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053  ATTAAGTCCTCACAAGAATAGACTCTTGTCACCTCTTCGCTGTTCTGCACCAATGTCGCTACATAATTCTCTGG  1126

Query 1241  TGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCTACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTT  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127  TGAAACCAGAGAGACAGTCCAAATGTTTTGAGTTTGGGAAGCTACAGCCTTCTTCTTCTCAGTCACTGGATGTT  1200

Query 1315  CAAAACATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGATTCGCTTGGGAAAAG  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1201  CAAAACATAACTGATTCTTCTTTCTCTAGGACTACTTGCTTTCAAGGTGTTAAAGTTGATTCACTTGGGAAAAG  1274

Query 1389  ATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAATGACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTG  1462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275  ATCTGATGTTATTTCCAAAGTTGAGGCTCGGGATATCACAGAAATGACTAACAAGGCTTCCAAAGAGCCTGTTG  1348

Query 1463  GTTGTGTAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACACGT  1536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349  GTTGTGTAAATAATATCAGTTTTCTTGCCTCACTGGCCGGGAGCACAAGCAGAAATAGATTACAGAGCACACGT  1422

Query 1537  GGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCTCCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAG  1610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423  GGGGCAGGCAGGCTTCAGAACTCTGGAACTGGGCTGTCTACAAACCTCCAGCATTTTCAGGAAGAAAACTTTAG  1496

Query 1611  GAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTCTACCCATGGTGTTGGAATGAATGGAAATAATG  1684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497  GAAAAGTTCTCCCCAGTTAGAACATACAGGAGTTTTTTTGTCTACCCATGGTGTTGGAATGAATGGAAATAATG  1570

Query 1685  CAGCAGCAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAG  1758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571  CAGCAGCAGGGAAAAGCGTAGGAGAATGTACTACTCATCACCTCCCACCTGTGAAAGCCCCTCTTCAGACAAAG  1644

Query 1759  AAGAAAACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGCTACGAATGCAGATGTGG  1832
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1645  AAGAAAACAACAAATCATTGTTTTCTTTGTGGAAAGAAAACAGGACTGGCTAGTAGCTACGAATGCAGATGTGG  1718

Query 1833  AAACAACTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGA  1906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1719  AAACAACTTCTGTGCATCTCATCGTTATGCAGAAACTCATGGCTGTACCTATGATTACAAGAGTGCAGGGAGGA  1792

Query 1907  GATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAAATC  1959
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793  GATACTTGCACGAGGCAAATCCTGTGGTTAATGCACCAAAGCTTCCAAAAATC  1845