Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479075
• Subject: NM_001177323.2
• Aligned Length: 1303
• Identities: 1170
• Gaps: 20

Alignment

Query    1  ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTGGGTGAAGGTTGCCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT  74
            |||||||||.||||||||||||||||   |||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGCGGCCGATATAGCTCGCCA---GGGCGAAGATTGTCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT  71

Query   75  TGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGAG  148
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   72  CGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCAGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGGG  145

Query  149  AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACACCCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCAC  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  146  AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACGCTCATGGATACCCTGTTTAACACCAAGTTTGAAGGGGAGCCAGCGACCCAC  219

Query  223  ACACAGCCGGGTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGGCTAAAGCTCACGAT  296
            ||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.||.|.||.|||||.||
Sbjct  220  ACACAGCCAGGGGTTCAGCTCCAGTCCAATACCTACGACCTCCAGGAGAGCAACGTGGGGTTGAAACTCACAAT  293

Query  297  CGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAAAGAGGACAGCTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATG  370
            .||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  294  TGTGAGCACTGTAGGCTTTGGGGATCAGATCAACAAGGAGGACAGCTACAAGCCCATCGTGGAATTCATTGATG  367

Query  371  CACAATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACACACCTACCATGACTCCCGAATC  444
            |.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct  368  CTCAGTTTGAGGCCTACCTACAAGAGGAGCTGAAGATCCGAAGAGTACTGCACTCCTACCATGACTCCCGAATC  441

Query  445  CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCACGGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  442  CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCGACAGGACATTCGCTTAAGTCTCTGGACCTAGTGACCATGAAGAAGCT  515

Query  519  GGACAGTAAGGTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCCATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCA  592
            |||.|||||||||||||||||.|||.|.||||||||..|||||||||||||.|||||||||||..|||||||||
Sbjct  516  GGATAGTAAGGTGAACATCATTCCCGTTATTGCCAAGTCAGATGCCATTTCTAAGAGTGAGCTGGCAAAGTTCA  589

Query  593  AAATCAAAATCACCAGCGAGCTTGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGGTG  666
            |.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  590  AGATCAAAATCACCAGCGAACTTGTGAGCAATGGAGTCCAGATCTATCAGTTCCCCACAGACGATGAGTCGGTG  663

Query  667  -GCAGAGATCAATGGAACCATGAACGCCCACCTGCCGTTTGCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAG  739
             || ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  664  AGC-GAGATCAATGGAACCATGAATGCCCACCTGCCGTTTGCTGTTGTTGGCAGCACAGAAGAAGTGAAGATAG  736

Query  740  GCAACAAGATGATGAGGGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCCCACTGCGACTTT  813
            ||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  737  GCAACAAGATGATGCGGGCTCGGCAGTATCCTTGGGGGACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCTCACTGCGACTTT  810

Query  814  GTGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGA  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  811  GTGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACGCCCGGCACTATGA  884

Query  888  GCTGTATCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCCTTCAGTTTAC  961
            ..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  885  ATTGTACCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCATTCAGTTTGC  958

Query  962  AGGAGACATATGAGGCCAAAAGGAACGAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATG  1035
            ||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  959  AGGAGACATATGAGGCAAAGAGAAATGAGTTCCTTGGGGAGCTCCAGAAGAAAGAAGAGGAGATGAGGCAGATG  1032

Query 1036  TTCGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAGAGCTGCACGAGAAGTTTGACCG  1109
            ||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1033  TTTGTCCAGAGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAGGAGGCTGAAAAAGAGCTGCATGAGAAATTTGACCG  1106

Query 1110  TCTGAAGAAACTGCACCAGGACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGTGAATG  1183
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||.|||.||||.|
Sbjct 1107  TCTGAAGAAACTGCACCAGGAAGAGAAGAAGAAGCTGGAGGATAAGAAGAAATGTCTGGATGAGGAAATGAACG  1180

Query 1184  CTTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGGGCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTG  1257
            |.||||||||.||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1181  CCTTCAAGCAGAGAAAGGCGGCAGCTGAGCTGCTCCAGTCTCAGGGCTCTCAGGCTGGGGGCTCACAGACTCTG  1254

Query 1258  AAGAGAGACAAAGAGAAGAAAAATAATCCATGGCTGTGTACTGAA  1302
            ||.||.||||||||||||||.||          ||.|.|.     
Sbjct 1255  AAAAGGGACAAAGAGAAGAAGAA----------CTTTTTT-----  1284