Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479117
- Subject:
- XR_001780804.1
- Aligned Length:
- 1482
- Identities:
- 1048
- Gaps:
- 306
Alignment
Query 1 ---------ATGTCT--ATTTCCT-----------TGAGCTCTTTAATTTTGT-----TGCCAAT-TTG---GA 43
|.||.| |||.||| .|.||..|..||.||.|| .||..|| ||| ||
Sbjct 1 TGCGTAATGACGTTTAAATTCCCTGCAGACCCGGAAGTGCAATCGAACTTGGTCGGGGCGCGGATCTTGAGAGA 74
Query 44 TAAA--------CATGGCACAAATCCAGCAGGGAG---GTCCAGA----TGAAAAAGAA----AAGACT----- 93
.||| ||.|||.|| |||||| |.||||| || ||| |.|.||
Sbjct 75 GAAAGTCCGAGCCAGGGCGCA--------AGGGAGTTCGCCCAGAGATCTG-----GAAGGCCACGCCTCCTCG 135
Query 94 -ACC----------GCACTGAA----------------AGATTTATTATCTAGGATAGATTTGGATGAACTAAT 140
||| |||.||.| ||||||..|.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 136 CACCTACCCTCTCAGCATTGCAGCTGGGGACAGAGCTCAGATTTGCTGTCTAGGATCGATTTGGATGAACTCAT 209
Query 141 GAAAAAAGATGAACCGCCTCTTGATTTTCCTGATACCCTGGAAGGATTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGAC 214
||||||.||.|||||.|||.||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 210 GAAAAAGGACGAACCACCTTTTGATTTTCCAGATACACTGGAAGGCTTTGAATATGCTTTTAATGAAAAGGGGC 283
Query 215 AGTTAAGACACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGGGAAGATTTACACAGATGGAACCAGAAA 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 284 AGTTAAGACACATAAAAACTGGGGAACCATTTGTTTTTAACTACCGAGAAGACTTACACAGGTGGAACCAGAAA 357
Query 289 AGATACGAGGCTCTAGGAGAGATCATCACGAAG-TATGTATATGAGCTCCTGGAAAAGGATTGTAATTTGAAAA 361
|||||.||.|||||.||.||||||||||| ||| |||||.||||||||||||||||..||.|||||||||||||
Sbjct 358 AGATATGAAGCTCTGGGCGAGATCATCAC-AAGATATGTTTATGAGCTCCTGGAAAGTGACTGTAATTTGAAAA 430
Query 362 AAGTATCTATTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACA 435
||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 431 AAATCTCTATTCCAGTAGATGCCACTGAGAGTGAACCAAAGAGTTTTATCTTTATGAGTGAGGATGCTTTGACA 504
Query 436 AATCCACAGAAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGGCAGTGGGCTAGAAGACTTAT 509
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 505 AATCCACAGAAACTGATGGTTTTAATTCATGGTAGTGGTGTTGTCAGGGCAGGTCAGTGGGCTAGAAGGCTTAT 578
Query 510 TATAAATGAAGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCGTTTATTAAAAGAGCTGTGGCTGAAGGATATGGAGTAA 583
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||.||||||.||||||||.|
Sbjct 579 TATTAATGAAGATCTGGACAGTGGCACACAGATACCTTTTATTAAGAGAGCTATGGATGAAGGGTATGGAGTCA 652
Query 584 TAGTACTAAATCCCAATGAAAACTATATTGAAGTAGAAAAGCCGAAGATACACGTACAGTCATCA---TCTGAT 654
|.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.|||.||.||...|||||||||| ||||||
Sbjct 653 TCGTCCTGAACCCAAATGAAAACTATATAGAAGTGGAAAAGCAGAAAATGCATAAACAGTCATCATCTTCTGAT 726
Query 655 AGTTCAGATGAACCAGCAGAAAAACGGGAAAGAAAAGATAAAGTTTCTAAAGAAACAAAGAAGCGACGTGATTT 728
.||.|||||||.|||||||..||.||||||||.|.||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 727 GGTACAGATGAGCCAGCAGGGAAGCGGGAAAGGAGAGATAAGGTCTCCAAGGAAACAAAGAAGCGTCGTGATTT 800
Query 729 CTATGAGAAGTATCGTAACCCCCAAAGAGAAAAAGAAATGATGCAATTGTATATCAGAGAAAATGGTTCTCCTG 802
||||||||||||.||.|||||.||||..||.||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 801 CTATGAGAAGTACCGCAACCCTCAAAAGGAGAAAGAAATGATGCAGTTGTTTATCAGGGAAAATGGTTCTCCTG 874
Query 803 AAGAACATGCAATCTATGTTTGGGATCATTTCATAGCTCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTTTTCGTTGCTCAC 876
||||.|||||..|||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 875 AAGAGCATGCGGTCTATGTGTGGGACCATTTCATAGCCCAGGCTGCTGCTGAGAATGTGTTCTTTGTGGCTCAT 948
Query 877 AGCTATGGAGGACTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCCGATGTAAAAAATAAGGTAACTGCTGT 950
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 949 AGCTATGGAGGACTTGCTTTTGTTGAACTGATGATTCAACGAGAAGCAGATGTAAAAAGTAAGGTGACTGCTGT 1022
Query 951 GGCATTGACAGACTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACGATTCGAGAATGGATGAGAGAGA 1024
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1023 GGCATTGACAGACTCTGTTCACAATGTGTGGCATCAAGAAGCTGGCAAAACCATCCGAGAATGGATGAGAGAGA 1096
Query 1025 ACTGTTGTAATTGGGTCTCTAGCTCAGAACCATTAGACACATCAGTGGAGTCCATGCTACCTGATTGCCCCCGG 1098
||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||.|.
Sbjct 1097 ACTGTTGTAACTGGGTCTCCAGCTCAGAACCATTAGATACATCGGTGGAATCCATGCTGCCTGACTGTCCCAGA 1170
Query 1099 GTCTCAGC------------------------------------------------------------------ 1106
||.||.||
Sbjct 1171 GTGTCTGCAGGACGGATTCTTATCATCAAAGTGGGCAATGTCTGCCATACACCATTTTTGTGTAGTAACTGTAT 1244
Query 1107 -------------------------------------------------------------------------- 1106
Sbjct 1245 TCTGAATACATTCTGGATGAAAGAGCATCCATAAGCCTGCATGTATGAGAAACAAGGCTGGAAGACTTTAAGGA 1318
Query 1107 --------AGGCACCGACCGTCACGAGCTAACTTCCTGGAAGAGCTTTCCGTCTATTTTCAAATTCTTTACCGA 1172
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||..|.||
Sbjct 1319 TCCCACCTAGGCACCGACCGTCACGAGCTCACTTCCTGGAAGAGCTTCCCGTCTATCTTCAAGTTCTTCGCGGA 1392
Query 1173 AGCCTCAGAGGCCAAGACCAGCTCCCTGAAGCCGGCTGTGACGCGCCGCTCCCACCGCATCAAGCACGAAGAGC 1246
||||||.||||||||||.
Sbjct 1393 AGCCTCGGAGGCCAAGAG-------------------------------------------------------- 1410
Query 1247 TG 1248
Sbjct 1411 -- 1410