Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479180
- Subject:
- NM_001291191.1
- Aligned Length:
- 1504
- Identities:
- 1101
- Gaps:
- 278
Alignment
Query 1 ---------------------------------ATGGATGAAAGGAACCGACAG---ACTTTAAGAAA--GAAA 36
||||||||.|||||||||||| |||||.|.||| ||||
Sbjct 1 ATGGGGCGAAAGAAGATACAAATCACACGCATAATGGATGAGAGGAACCGACAGGTTACTTTTACAAAGCGAAA 74
Query 37 G------------------GCCTTAATG------GT------TGTG--------AGAGCCCTGAT--------- 63
| |||| ||| || |||| |.|||.||.||
Sbjct 75 GTTTGGATTGATGAAGAAAGCCT--ATGAACTCAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAA 146
Query 64 ------------GCTG-------ACG------ATTACTTTGAGCACAGTC-----------CACT--------- 92
|||| ||| .|.||.|.|| ||.|||| ||||
Sbjct 147 CAGCTCTAATAAGCTGTTTCAGTACGCTAGCACTGACATGGA-CAAAGTCCTTCTCAAATACACTGAGTATAAC 219
Query 93 -----------------------CTCG---------GAGG------------------ACAGA----------- 105
|||| |||| |||||
Sbjct 220 GAGCCTCATGAAAGCAGGACGAACTCGGATATCGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAG 293
Query 106 ---------------TTCA-----GCAAACT--AAAT---GAAGA---------------TAGTG----ATTTT 135
|||| ||.|||| |.|| ||||| ||.|| ||||.
Sbjct 294 CCCAGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTG 367
Query 136 ATTTTCAA-ACGAGG--------------CCCTCCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGT 194
|| || |.||.| |.|.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 368 AT----AATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGCTTGCCACCTCAGAACTTCTCAATGTCTGTCACAGT 437
Query 195 TCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCA 268
.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 438 CCCTGTGACCAGCCCTAATGCTTTGTCGTACACTAACCCAGGGAGTTCACTCGTGTCACCGTCTTTGGCAGCCA 511
Query 269 GCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCT 342
|||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.|.|.||||..||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 512 GCTCAACATTAGCAGATTCGAGCATGCTGTCTCCACCCCCAGCCACGCTACATAGAAATGTGTCCCCAGGAGCT 585
Query 343 CCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGC 416
||.|||||||||||||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 586 CCGCAGAGACCACCAAGTACCGGCAGTGCAAGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACGGTGCCAAATGGAGC 659
Query 417 TGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAA 490
|||||..|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 660 TGGAAATAGTCCTGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGGGCCTCTCCAAATTTGATTGGAAATACTGGTGCAA 733
Query 491 ATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGG 564
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||.||
Sbjct 734 ATAGTTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCGCCACCAGGTGGTGGCAGTCTTGGAATGAACAGTCGG 807
Query 565 AAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTAAACACCCAAAGGATCAG 638
|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||.||
Sbjct 808 AAACCAGATCTACGAGTTGTCATTCCCCCATCAAGCAAGGGCATGATGCCCCCACTTAATGCCCAAAGGATAAG 881
Query 639 TAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGAC 712
.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 882 CAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCCACGCCTGTAGTGTCTGTGACAACTCCGAGCTTGCCTCCACAGGGAC 955
Query 713 TTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAA 786
|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 956 TAGTGTACTCAGCAATGCCGACAGCCTACAACACTGATTACTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCTGCCCTGCAA 1029
Query 787 GGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGC 860
|||||.|..||.||.|||||||||||.|||||.||||..||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1030 GGCTTTACTTCCCCTGGAATGCTGTCTCTGGGGCAGGCTTCAGCCTGGCAGCAGCACCATCTAGGACAAGCAGC 1103
Query 861 CCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCA 934
||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1104 CCTCAGCTCTCTGGTGGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCAAATTTGTCCATTAACACCAACCAGAACATCA 1177
Query 935 GCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAG 1008
.|||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1178 ACATTAAGTCAGAGCCAATTTCACCTCCCCGTGATAGAATGACCCCATCAGGCTTCCAACAGCAGCAGCAGCA- 1250
Query 1009 CAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAAT 1082
|||||.||.||||||.|.|||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1251 --------------------GCCACAACAGCAGCCACCGCCACAACCTCCACAGCCCCAACCCCGGCAGGAAAT 1304
Query 1083 GGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGG 1156
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1305 GGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCCAGCAGCTCCTATGATGGCAGTGACCGGGAGGATCCACGGG 1378
Query 1157 GCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGA 1230
|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1379 GTGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCTCCAAATACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAACGC 1452
Query 1231 ATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC 1254
||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1453 ATGAGGATGGACACATGGGTGACC 1476