Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479180
- Subject:
- NM_001291195.1
- Aligned Length:
- 1491
- Identities:
- 1123
- Gaps:
- 258
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGGCGAAAGAAGATACAAATCACACGCATAATGGATGAGAGGAACCGACAGGTTACTTTTACAAAGCGAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTTTGGATTGATGAAGAAAGCCTATGAACTCAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA 148
Query 1 -----------------------------------ATGG----------------------------------- 4
||||
Sbjct 149 GCTCTAATAAGCTGTTTCAGTACGCTAGCACTGACATGGACAAAGTCCTTCTCAAATACACTGAGTATAACGAG 222
Query 5 ----ATGAAAG--GAACCGAC-------------AGACTTTAAGAAAGAAAGGCCTTAATGGTTGTGAGAGCCC 59
||||||| |.||..|| ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTCATGAAAGCAGGACGAACTCGGATATCGTTGAGACGTTAAGAAAGAAAGGCCTTAATGGTTGTGAGAGCCC 296
Query 60 TGATGCTGACGATTACTTTGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATTCAGCAAACTAAATGAAGATAGTGATT 133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGATGCTGACGATTACTTTGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATTCAGCAAACTAAATGAAGATAGTGATT 370
Query 134 TTATTTTCAAACGAGGCCCTCCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGC 207
|||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 371 TTATTTTCAAACGAGGCCCTCCTGGCTTGCCACCTCAGAACTTCTCAATGTCTGTCACAGTCCCTGTGACCAGC 444
Query 208 CCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAAC 281
||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 445 CCTAATGCTTTGTCGTACACTAACCCAGGGAGTTCACTCGTGTCACCGTCTTTGGCAGCCAGCTCAACATTAGC 518
Query 282 AGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCAC 355
||||||.||||||||.||||||||.|.|.||||..||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 519 AGATTCGAGCATGCTGTCTCCACCCCCAGCCACGCTACATAGAAATGTGTCCCCAGGAGCTCCGCAGAGACCAC 592
Query 356 CAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCA 429
|||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..|||||.
Sbjct 593 CAAGTACCGGCAGTGCAAGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACGGTGCCAAATGGAGCTGGAAATAGTCCT 666
Query 430 GTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAA 503
||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 GTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGGGCCTCTCCAAATTTGATTGGAAATACTGGTGCAAATAGTTTAGGCAA 740
Query 504 AGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTC 577
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct 741 AGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCGCCACCAGGTGGTGGCAGTCTTGGAATGAACAGTCGGAAACCAGATCTAC 814
Query 578 GAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTAAACACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCC 651
||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 815 GAGTTGTCATTCCCCCATCAAGCAAGGGCATGATGCCCCCACTTAATGCCCAAAGGATAAGCAGTTCTCAAGCC 888
Query 652 ACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGC 725
||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 889 ACTCAACCTCTTGCCACGCCTGTAGTGTCTGTGACAACTCCGAGCTTGCCTCCACAGGGACTAGTGTACTCAGC 962
Query 726 AATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGC 799
|||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|..||.|
Sbjct 963 AATGCCGACAGCCTACAACACTGATTACTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCTGCCCTGCAAGGCTTTACTTCCC 1036
Query 800 CAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTT 873
|.|||||||||||.|||||.||||..||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 CTGGAATGCTGTCTCTGGGGCAGGCTTCAGCCTGGCAGCAGCACCATCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTG 1110
Query 874 GTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGA 947
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||.|||.|||||.||
Sbjct 1111 GTGGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCAAATTTGTCCATTAACACCAACCAGAACATCAACATTAAGTCAGA 1184
Query 948 ACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC 1021
.||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1185 GCCAATTTCACCTCCCCGTGATAGAATGACCCCATCAGGCTTCCAACAGCAGCAGCAGCA-------------- 1244
Query 1022 AGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCT 1095
|||||.||.||||||.|.|||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1245 -------GCCACAACAGCAGCCACCGCCACAACCTCCACAGCCCCAACCCCGGCAGGAAATGGGGCGCTCCCCT 1311
Query 1096 GTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTC 1169
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1312 GTGGACAGTCTGAGCAGCTCCAGCAGCTCCTATGATGGCAGTGACCGGGAGGATCCACGGGGTGACTTCCATTC 1385
Query 1170 TCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACG 1243
|||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.
Sbjct 1386 TCCAATTGTGCTTGGCCGACCTCCAAATACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAACGCATGAGGATGGACA 1459
Query 1244 CGTGGGTGACC 1254
|.|||||||||
Sbjct 1460 CATGGGTGACC 1470