Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479180
• Subject: NM_001291196.1
• Aligned Length: 1254
• Identities: 950
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  ATGGATGAAAGGAACCGACAGACTTTAAGAAAGAAAGGCCTTAATGGTTGTGAGAGCCCTGATGCTGACGATTA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTTGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATTCAGCAAACTAAATGAAGATAGTGATTTTATTTTCAAACGAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCCCTCCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCC  222
                                            ||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct    1  --------------------------------ATGTCTGTCACAGTCCCTGTGACCAGCCCTAATGCTTTGTCG  42

Query  223  TACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCT  296
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||
Sbjct   43  TACACTAACCCAGGGAGTTCACTCGTGTCACCGTCTTTGGCAGCCAGCTCAACATTAGCAGATTCGAGCATGCT  116

Query  297  CTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATG  370
            .||||||||.|.|.||||..||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||.||
Sbjct  117  GTCTCCACCCCCAGCCACGCTACATAGAAATGTGTCCCCAGGAGCTCCGCAGAGACCACCAAGTACCGGCAGTG  190

Query  371  CAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTT  444
            ||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..|||||.|||||||||||||||
Sbjct  191  CAAGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACGGTGCCAAATGGAGCTGGAAATAGTCCTGTGGGGAATGGATTT  264

Query  445  GTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAA  518
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  265  GTAAACTCAAGGGCCTCTCCAAATTTGATTGGAAATACTGGTGCAAATAGTTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAA  338

Query  519  GTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCC  592
            |||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  339  GTCTCCCCCGCCACCAGGTGGTGGCAGTCTTGGAATGAACAGTCGGAAACCAGATCTACGAGTTGTCATTCCCC  412

Query  593  CTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTAAACACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCT  666
            |.||||||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  413  CATCAAGCAAGGGCATGATGCCCCCACTTAATGCCCAAAGGATAAGCAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCC  486

Query  667  ACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTA  740
            ||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  487  ACGCCTGTAGTGTCTGTGACAACTCCGAGCTTGCCTCCACAGGGACTAGTGTACTCAGCAATGCCGACAGCCTA  560

Query  741  CAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGC  814
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|..||.||.|||||||||||.|
Sbjct  561  CAACACTGATTACTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCTGCCCTGCAAGGCTTTACTTCCCCTGGAATGCTGTCTC  634

Query  815  TGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAG  888
            ||||.||||..||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  635  TGGGGCAGGCTTCAGCCTGGCAGCAGCACCATCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTGGTGGCTGGAGGGCAG  708

Query  889  TTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCC  962
            ||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||.|||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  709  TTATCTCAGGGTTCAAATTTGTCCATTAACACCAACCAGAACATCAACATTAAGTCAGAGCCAATTTCACCTCC  782

Query  963  TCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCAC  1036
            .||.|||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||                     |||||.||
Sbjct  783  CCGTGATAGAATGACCCCATCAGGCTTCCAACAGCAGCAGCAGCA---------------------GCCACAAC  835

Query 1037  CGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGC  1110
            .||||||.|.|||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  836  AGCAGCCACCGCCACAACCTCCACAGCCCCAACCCCGGCAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGC  909

Query 1111  AGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGG  1184
            |||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  910  AGCTCCAGCAGCTCCTATGATGGCAGTGACCGGGAGGATCCACGGGGTGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGG  983

Query 1185  CCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC  1254
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct  984  CCGACCTCCAAATACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAACGCATGAGGATGGACACATGGGTGACC  1053