Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479180
- Subject:
- XM_006540686.3
- Aligned Length:
- 1515
- Identities:
- 1123
- Gaps:
- 282
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGGCGAAAGAAGATACAAATCACACGCATAATGGATGAGAGGAACCGACAGGTTACTTTTACAAAGCGAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTTTGGATTGATGAAGAAAGCCTATGAACTCAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA 148
Query 1 -----------------------------------ATGG----------------------------------- 4
||||
Sbjct 149 GCTCTAATAAGCTGTTTCAGTACGCTAGCACTGACATGGACAAAGTCCTTCTCAAATACACTGAGTATAACGAG 222
Query 5 ----ATGAAAG--GAACCGAC-------------AGACTTTAAGAAAGAAAGGCCTTAATGGTTGTGAGAGCCC 59
||||||| |.||..|| ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTCATGAAAGCAGGACGAACTCGGATATCGTTGAGACGTTAAGAAAGAAAGGCCTTAATGGTTGTGAGAGCCC 296
Query 60 TGATGCTGACGATTACTTTGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATTCAGCAAACTAAATGAAGATAGTGATT 133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGATGCTGACGATTACTTTGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATTCAGCAAACTAAATGAAGATAGTGATT 370
Query 134 TTATTTTCAAACGAGGCCCTCCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGC 207
|||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 371 TTATTTTCAAACGAGGCCCTCCTGGCTTGCCACCTCAGAACTTCTCAATGTCTGTCACAGTCCCTGTGACCAGC 444
Query 208 CCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAAC 281
||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 445 CCTAATGCTTTGTCGTACACTAACCCAGGGAGTTCACTCGTGTCACCGTCTTTGGCAGCCAGCTCAACATTAGC 518
Query 282 AGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCAC 355
||||||.||||||||.||||||||.|.|.||||..||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 519 AGATTCGAGCATGCTGTCTCCACCCCCAGCCACGCTACATAGAAATGTGTCCCCAGGAGCTCCGCAGAGACCAC 592
Query 356 CAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCA 429
|||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..|||||.
Sbjct 593 CAAGTACCGGCAGTGCAAGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACGGTGCCAAATGGAGCTGGAAATAGTCCT 666
Query 430 GTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAA 503
||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 GTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGGGCCTCTCCAAATTTGATTGGAAATACTGGTGCAAATAGTTTAGGCAA 740
Query 504 AGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTC 577
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct 741 AGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCGCCACCAGGTGGTGGCAGTCTTGGAATGAACAGTCGGAAACCAGATCTAC 814
Query 578 GAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCAC------------------------TAAACACC 627
||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||| |.||..||
Sbjct 815 GAGTTGTCATTCCCCCATCAAGCAAGGGCATGATGCCCCCACTTTCGGAGGAAGAGGAATTGGAGTTGAATGCC 888
Query 628 CAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCC 701
||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 889 CAAAGGATAAGCAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCCACGCCTGTAGTGTCTGTGACAACTCCGAGCTTGCC 962
Query 702 TCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGT 775
|||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCCACAGGGACTAGTGTACTCAGCAATGCCGACAGCCTACAACACTGATTACTCACTGACCAGCGCTGACCTGT 1036
Query 776 CAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTA 849
|.|||||.||||||||.|..||.||.|||||||||||.|||||.||||..||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 CTGCCCTGCAAGGCTTTACTTCCCCTGGAATGCTGTCTCTGGGGCAGGCTTCAGCCTGGCAGCAGCACCATCTA 1110
Query 850 GGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAA 923
|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111 GGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTGGTGGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCAAATTTGTCCATTAACACCAA 1184
Query 924 CCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGC 997
|||.|||||||.|||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1185 CCAGAACATCAACATTAAGTCAGAGCCAATTTCACCTCCCCGTGATAGAATGACCCCATCAGGCTTCCAACAGC 1258
Query 998 AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCC 1071
|||||||||| |||||.||.||||||.|.|||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1259 AGCAGCAGCA---------------------GCCACAACAGCAGCCACCGCCACAACCTCCACAGCCCCAACCC 1311
Query 1072 CGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGA 1145
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1312 CGGCAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCCAGCAGCTCCTATGATGGCAGTGACCGGGA 1385
Query 1146 GGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTT 1219
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 GGATCCACGGGGTGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCTCCAAATACTGAGGACAGAGAAAGCCCTT 1459
Query 1220 CTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC 1254
|||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1460 CTGTAAAACGCATGAGGATGGACACATGGGTGACC 1494