Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479180
• Subject: XM_011521582.2
• Aligned Length: 1526
• Identities: 1225
• Gaps: 277

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGGATGAAAGGAACCGACAG---ACTTT----AAGA----  30
                                             |||||||||||||||||||||   |||||    ||||    
Sbjct    1  ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA  74

Query   31  -------------AAGAAAGGC------CTTAATG------GT---TGTGA-----------------------  53
                         |||||||.|      ||||.||      ||   |||||                       
Sbjct   75  GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148

Query   54  -------------------------GAGCCCTGATGCTGACGA--TTACTT--------------------TG-  79
                                     .|||.|||||...|||.|  || |||                    || 
Sbjct  149  GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTT-CTTCTCAAGTATACAGAATATAATGA  221

Query   80  ----------AGCACAGTCCACT---------------CTC----------GGAGGACAGA-------------  105
                      ||||.|..|.|||               |||          |||..|||||             
Sbjct  222  ACCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAGCC  295

Query  106  -------------TTCA-----GCAAACT--AAAT---GAAGA---------------TAGTG----ATTTTAT  137
                         ||||     ||.||||  |.||   |||||               ||.||    ||||.||
Sbjct  296  CAGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTGAT  369

Query  138  TTTCAA-ACGAGG--------------CCCTCCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTC  196
                || |.||.|              |.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  ----AATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTC  439

Query  197  CAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGC  270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  CAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGC  513

Query  271  TCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCC  344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  TCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCC  587

Query  345  TCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTG  418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  TCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTG  661

Query  419  GAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAAT  492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  GAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAAT  735

Query  493  AGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAA  566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  AGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAA  809

Query  567  ACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTA-------------------  621
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  810  ACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTATCGGAGGAAGAGGAATTGG  883

Query  622  -----AACACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACC  690
                 ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  AGTTGAATACCCAGAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACC  957

Query  691  CCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAG  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  CCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAG  1031

Query  765  CGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGC  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  CGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGC  1105

Query  839  AGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCC  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  AGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCC  1179

Query  913  ATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGG  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  ATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGG  1253

Query  987  CTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGC  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  CTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGC  1327

Query 1061  AGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGC  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  AGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGC  1401

Query 1135  AGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAG  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  AGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAG  1475

Query 1209  AGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  AGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC  1521