Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479180
- Subject:
- XM_017022201.1
- Aligned Length:
- 1262
- Identities:
- 1113
- Gaps:
- 145
Alignment
Query 1 ATGGATGAAAGGAACCGACAGACTTTAAGAAAGAAAGGCCTTAATGGTTGTGAGAGCCCTGATGCTGACGATTA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTTTGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATTCAGCAAACTAAATGAAG-------ATAGTGATTTTATTTTC 141
||||.| |||
Sbjct 1 --------------------------------------------ATGATGCGGAATCATA-------------- 16
Query 142 AAA-CGAGGCCCTCCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATG 214
||| || |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 17 AAATCG-----CACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATG 85
Query 215 CTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCA 288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 86 CTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCA 159
Query 289 AGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTAC 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 160 AGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTAC 233
Query 363 TGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGA 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 234 TGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGA 307
Query 437 ATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATG 510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 308 ATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATG 381
Query 511 CCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGT 584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 CCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGT 455
Query 585 CATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTAAACACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAAC 658
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456 CATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTAAATACCCAGAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAAC 529
Query 659 CTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCG 732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 CTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCG 603
Query 733 ACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAAT 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 604 ACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAAT 677
Query 807 GCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTG 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 678 GCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTG 751
Query 881 GAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATT 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 752 GAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATT 825
Query 955 TCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCC 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 826 TCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCC 899
Query 1029 GCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACA 1102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 GCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACA 973
Query 1103 GTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATT 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 974 GTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATT 1047
Query 1177 GTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 GTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGT 1121
Query 1251 GACC 1254
||||
Sbjct 1122 GACC 1125