Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479180
• Subject: XM_017322011.1
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1123
• Gaps: 282

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGCGAAAGAAGATACAAATCACACGCATAATGGATGAGAGGAACCGACAGGTTACTTTTACAAAGCGAAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GTTTGGATTGATGAAGAAAGCCTATGAACTCAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148

Query    1  -----------------------------------ATGG-----------------------------------  4
                                               ||||                                   
Sbjct  149  GCTCTAATAAGCTGTTTCAGTACGCTAGCACTGACATGGACAAAGTCCTTCTCAAATACACTGAGTATAACGAG  222

Query    5  ----ATGAAAG--GAACCGAC-------------AGACTTTAAGAAAGAAAGGCCTTAATGGTTGTGAGAGCCC  59
                |||||||  |.||..||             ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCATGAAAGCAGGACGAACTCGGATATCGTTGAGACGTTAAGAAAGAAAGGCCTTAATGGTTGTGAGAGCCC  296

Query   60  TGATGCTGACGATTACTTTGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATTCAGCAAACTAAATGAAGATAGTGATT  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATGCTGACGATTACTTTGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATTCAGCAAACTAAATGAAGATAGTGATT  370

Query  134  TTATTTTCAAACGAGGCCCTCCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGC  207
            |||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  TTATTTTCAAACGAGGCCCTCCTGGCTTGCCACCTCAGAACTTCTCAATGTCTGTCACAGTCCCTGTGACCAGC  444

Query  208  CCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAAC  281
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct  445  CCTAATGCTTTGTCGTACACTAACCCAGGGAGTTCACTCGTGTCACCGTCTTTGGCAGCCAGCTCAACATTAGC  518

Query  282  AGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCAC  355
            ||||||.||||||||.||||||||.|.|.||||..||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct  519  AGATTCGAGCATGCTGTCTCCACCCCCAGCCACGCTACATAGAAATGTGTCCCCAGGAGCTCCGCAGAGACCAC  592

Query  356  CAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCA  429
            |||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..|||||.
Sbjct  593  CAAGTACCGGCAGTGCAAGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACGGTGCCAAATGGAGCTGGAAATAGTCCT  666

Query  430  GTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAA  503
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  GTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGGGCCTCTCCAAATTTGATTGGAAATACTGGTGCAAATAGTTTAGGCAA  740

Query  504  AGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTC  577
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  741  AGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCGCCACCAGGTGGTGGCAGTCTTGGAATGAACAGTCGGAAACCAGATCTAC  814

Query  578  GAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCAC------------------------TAAACACC  627
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||                        |.||..||
Sbjct  815  GAGTTGTCATTCCCCCATCAAGCAAGGGCATGATGCCCCCACTTTCGGAGGAAGAGGAATTGGAGTTGAATGCC  888

Query  628  CAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCC  701
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  889  CAAAGGATAAGCAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCCACGCCTGTAGTGTCTGTGACAACTCCGAGCTTGCC  962

Query  702  TCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGT  775
            |||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCACAGGGACTAGTGTACTCAGCAATGCCGACAGCCTACAACACTGATTACTCACTGACCAGCGCTGACCTGT  1036

Query  776  CAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTA  849
            |.|||||.||||||||.|..||.||.|||||||||||.|||||.||||..||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  CTGCCCTGCAAGGCTTTACTTCCCCTGGAATGCTGTCTCTGGGGCAGGCTTCAGCCTGGCAGCAGCACCATCTA  1110

Query  850  GGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAA  923
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111  GGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTGGTGGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCAAATTTGTCCATTAACACCAA  1184

Query  924  CCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGC  997
            |||.|||||||.|||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1185  CCAGAACATCAACATTAAGTCAGAGCCAATTTCACCTCCCCGTGATAGAATGACCCCATCAGGCTTCCAACAGC  1258

Query  998  AGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCC  1071
            ||||||||||                     |||||.||.||||||.|.|||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1259  AGCAGCAGCA---------------------GCCACAACAGCAGCCACCGCCACAACCTCCACAGCCCCAACCC  1311

Query 1072  CGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGA  1145
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1312  CGGCAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCCAGCAGCTCCTATGATGGCAGTGACCGGGA  1385

Query 1146  GGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTT  1219
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386  GGATCCACGGGGTGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCTCCAAATACTGAGGACAGAGAAAGCCCTT  1459

Query 1220  CTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC  1254
            |||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1460  CTGTAAAACGCATGAGGATGGACACATGGGTGACC  1494