Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479282
• Subject: XM_011538856.2
• Aligned Length: 2054
• Identities: 2044
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  ATGAACCCTCCGGCAGCCTTCCTTGCCGGGCGCCAGAACATCGGGTCAGAAGTTGAGATTTCCACTATCGAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCCTCCGGCAGCCTTCCTTGCCGGGCGCCAGAACATCGGGTCAGAAGTTGAGATTTCCACTATCGAGAA  74

Query   75  ACAACGGAAGGAGCTGCAGTTGCTCATTGGAGAATTAAAAGATCGAGATAAAGAGCTCAATGACATGGTTGCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAACGGAAGGAGCTGCAGTTGCTCATTGGAGAATTAAAAGATCGAGATAAAGAGCTCAATGACATGGTTGCAG  148

Query  149  TGCACCAGCAACAGCTTCTTTCATGGGAAGAGGATCGGCAGAAAGTGTTGACACTGGAAGAACGTTGCAGCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCACCAGCAACAGCTTCTTTCATGGGAAGAGGATCGGCAGAAAGTGTTGACACTGGAAGAACGTTGCAGCAAA  222

Query  223  TTAGAAGGTGAACTACATAAAAGAACTGAAATAATCAGGTAGACT--CCAAGAAGGTAAAAGCTCTTGAATCAC  294
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .|||  |.||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  223  TTAGAAGGTGAACTACATAAAAGAACTGAAATAATCAGGT-CACTCACGAAGAAGGTAAAAGCTCTTGAATC-C  294

Query  295  AATCAAATGGAATGCCAAACAGCTCTCCAAAAGACCCAACTACAGCTTCAGGAAATGGCTCAAAAGGCAACGCA  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  AATCAAATGGAATGCCAAACAGCTCTCCAAAAGACCCAACTACAGCTTCAGGAAATGGCTCAAAAGGCAACGCA  368

Query  369  TTCTTCTCTTCTCTCTGAAGACCTTGAGGCTAGAAACGAAACTCTCAGCAACACGTTAGTGGAACTTTCTGCCC  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  TTCTTCTCTTCTCTCTGAAGACCTTGAGGCTAGAAACGAAACTCTCAGCAACACGTTAGTGGAACTTTCTGCCC  442

Query  443  AGGTAGGACAGCTACAAGCTCGAGAACAAGCTCTTACGACAATGATAAAGCTAAAGGACAAAGATATTATTGAG  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  AGGTAGGACAGCTACAAGCTCGAGAACAAGCTCTTACGACAATGATAAAGCTAAAGGACAAAGATATTATTGAG  516

Query  517  GCAGTTAATCACATTGCAGATTGTTCGGGTAAATTTAAAATGCTAGAGCATGCCCTACGTGATGCCAAGATGGC  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GCAGTTAATCACATTGCAGATTGTTCGGGTAAATTTAAAATGCTAGAGCATGCCCTACGTGATGCCAAGATGGC  590

Query  591  GGAGACTTGTATTGTGAAAGAAAAGCAAGATTATAAGCAGAAATTGAAGGCACTTAAGATTGAAGTCAACAAAC  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  GGAGACTTGTATTGTGAAAGAAAAGCAAGATTATAAGCAGAAATTGAAGGCACTTAAGATTGAAGTCAACAAAC  664

Query  665  TAAAAGAGGACCTCAATGAAAAGACGACAGAAAATAATGAGCAACGAGAAGAGATCATTCGCCTCAAGCAAGAG  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  TAAAAGAGGACCTCAATGAAAAGACGACAGAAAATAATGAGCAACGAGAAGAGATCATTCGCCTCAAGCAAGAG  738

Query  739  AAAAGTTGCCTGCACGATGAATTGCTTTTTACTGTAGAGAGAGAAAAGAGGAAAGATGAATTGCTTAATATTGC  812
            |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  AAAAGTTGCCTGCACGATGAATTGCTTTTTACT---GAGAGAGAAAAGAGGAAAGATGAATTGCTTAATATTGC  809

Query  813  GAAGTCAAAGCAAGAACGCACAAATTCAGAACTGCACAATCTGAGACAGATTTATGTAAAACAACAGAGTGATC  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  GAAGTCAAAGCAAGAACGCACAAATTCAGAACTGCACAATCTGAGACAGATTTATGTAAAACAACAGAGTGATC  883

Query  887  TGCAGTTTCTTAATTTCAATGTGGAAAATTCTCAGGAATTAATACAGATGTATGACTCAAAGATGGAGGAATCA  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  TGCAGTTTCTTAATTTCAATGTGGAAAATTCTCAGGAATTAATACAGATGTATGACTCAAAGATGGAGGAATCA  957

Query  961  AAGGCTCTGGACTCCAGCAGAGACATGTGTTTATCAGACCTTGAAAATAACCACCCAAAAGTCGATATTAAGAG  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  AAGGCTCTGGACTCCAGCAGAGACATGTGTTTATCAGACCTTGAAAATAACCACCCAAAAGTCGATATTAAGAG  1031

Query 1035  GGAAAAAAATCAGAAGTCACTGTTTAAGGACCAGAAATTTGAAGCCATGTTGGTTCAGCAAAATAGGTCAGACA  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  GGAAAAAAATCAGAAGTCACTGTTTAAGGACCAGAAATTTGAAGCCATGTTGGTTCAGCAAAATAGGTCAGACA  1105

Query 1109  AGAGCTCTTGCGATGAATGCAAAGAGAAGAAACAACAGATCGATACTGTGTTTGGGGAGAAAAGTGTAATTAAG  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1106  AGAGCTCTTGCGATGAATGCAAAGAGAAGAAACAACAGATCGATACTGTGTTTGGGGAGAAAAGTGTAATTACG  1179

Query 1183  CTGTCATCCATATTCACCAAAGACTTAGTAGAGAAACACAACCTCCCTTGGTCTCTGGGAGGAAAAACCCAGAT  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  CTGTCATCCATATTCACCAAAGACTTAGTAGAGAAACACAACCTCCCTTGGTCTCTGGGAGGAAAAACCCAGAT  1253

Query 1257  TGAACCCGAAAACAAAATTACATTGTGCAAGATCCACACAAAATCACCAAAATGTCATGGCACTGGGGTTCAGA  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  TGAACCCGAAAACAAAATTACATTGTGCAAGATCCACACAAAATCACCAAAATGTCATGGCACTGGGGTTCAGA  1327

Query 1331  ACGAAGGAAAACAACCCTCAGAAACACCCACTTTATCTGATGAGAAGCAGTGGCATGATGTCAGTGTTTACCTG  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  ACGAAGGAAAACAACCCTCAGAAACACCCACTTTATCTGATGAGAAGCAGTGGCATGATGTCAGTGTTTACCTG  1401

Query 1405  GGCCTGACCAACTGTCCAAGTTCAAAACATCCAGAAAAGCTGGATGTAGAATGTCAAGATCAGATGGAAAGGTC  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  GGCCTGACCAACTGTCCAAGTTCAAAACATCCAGAAAAGCTGGATGTAGAATGTCAAGATCAGATGGAAAGGTC  1475

Query 1479  CGAAATCTCATGCTGCCAGAAAAATGAAGCCTGTCTGGGCGAAAGTGGCATGTGTGACTCCAAGTGCTGCCACC  1552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  CGAAATCTCATGCTGCCAGAAAAATGAAGCCTGTCTGGGCGAAAGTGGCATGTGTGACTCCAAGTGCTGCCACC  1549

Query 1553  CGAGTAACTTCATAATTGAAGCCCCAGGCCACATGTCTGACGTGGAGTGGATGAGTATTTTCAAGCCTTCCAAA  1626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550  CGAGTAACTTCATAATTGAAGCCCCAGGCCACATGTCTGACGTGGAGTGGATGAGTATTTTCAAGCCTTCCAAA  1623

Query 1627  ATGCAGAGAATTGTCCGCCTCAAATCTGGGTGCACCTGTTCAGAAAGCATCTGTGGCACACAACATGACTCCCC  1700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1624  ATGCAGAGAATTGTCCGCCTCAAATCTGGGTGCACCTGTTCAGAAAGCATCTGTGGCACACAACATGACTCCCC  1697

Query 1701  GGCAAGTGAGCTAATTGCCATCCAAGATTCCCACTCTTTGGGTTCTTCAAAATCTGCCTTGAGAGAAGATGAGA  1774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698  GGCAAGTGAGCTAATTGCCATCCAAGATTCCCACTCTTTGGGTTCTTCAAAATCTGCCTTGAGAGAAGATGAGA  1771

Query 1775  CGGAGTCCTCTTCCAATAAAAAGAACTCACCTACGAGTTTGTTAATCTACAAAGATGCACCAGCATTCAATGAA  1848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1772  CGGAGTCCTCTTCCAATAAAAAGAACTCACCTACGAGTTTGTTAATCTACAAAGATGCACCAGCATTCAATGAA  1845

Query 1849  AAGGCTTCAATTGTGTTACCCTCCCAGGATGATTTCTCGCCCACGAGCAAGCTCCAGCGTTTGCTGGCGGAATC  1922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1846  AAGGCTTCAATTGTGTTACCCTCCCAGGATGATTTCTCGCCCACGAGCAAGCTCCAGCGTTTGCTGGCGGAATC  1919

Query 1923  TCGTCAGATGGTGACGGACCTGGAGCTGAGCACACTGCTGCCCATCAGCCATGAGAATCTCACTGGCAGTGCCA  1996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920  TCGTCAGATGGTGACGGACCTGGAGCTGAGCACACTGCTGCCCATCAGCCATGAGAATCTCACTGGCAGTGCCA  1993

Query 1997  CAAATAAGTCAGAGGTCCCAGAAGAGTCAGCTCAAAAAAATACCTTTGTCAGTTAT  2052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994  CAAATAAGTCAGAGGTCCCAGAAGAGTCAGCTCAAAAAAATACCTTTGTCAGTTAT  2049