Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479282
- Subject:
- XR_001748904.2
- Aligned Length:
- 2532
- Identities:
- 2047
- Gaps:
- 482
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GCTCCGGGCTCGCCCCCGCCGCTCGGGGCAGGCGCGCCGATGGCGTTTCTGAGGTGACGCCGCCCACACCGGGC 74
Query 1 -------------------------ATGAACCCTCCGGCAGCCTTCCTTGCCGGGCGCCAGAACATCGGGTCAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTCTCCGGGGGCGGAGGAAACACCTATGAACCCTCCGGCAGCCTTCCTTGCCGGGCGCCAGAACATCGGGTCAG 148
Query 50 AAGTTGAGATTTCCACTATCGAGAAACAACGGAAGGAGCTGCAGTTGCTCATTGGAGAATTAAAAGATCGAGAT 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGTTGAGATTTCCACTATCGAGAAACAACGGAAGGAGCTGCAGTTGCTCATTGGAGAATTAAAAGATCGAGAT 222
Query 124 AAAGAGCTCAATGACATGGTTGCAGTGCACCAGCAACAGCTTCTTTCATGGGAAGAGGATCGGCAGAAAGTGTT 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAGAGCTCAATGACATGGTTGCAGTGCACCAGCAACAGCTTCTTTCATGGGAAGAGGATCGGCAGAAAGTGTT 296
Query 198 GACACTGGAAGAACGTTGCAGCAAATTAGAAGGTGAACTACATAAAAGAACTGAAATAATCAGGTAGACT--CC 269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||| |.
Sbjct 297 GACACTGGAAGAACGTTGCAGCAAATTAGAAGGTGAACTACATAAAAGAACTGAAATAATCAGGT-CACTCACG 369
Query 270 AAGAAGGTAAAAGCTCTTGAATCACAATCAAATGGAATGCCAAACAGCTCTCCAAAAGACCCAACTACAGCTTC 343
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 AAGAAGGTAAAAGCTCTTGAATC-CAATCAAATGGAATGCCAAACAGCTCTCCAAAAGACCCAACTACAGCTTC 442
Query 344 AGGAAATGGCTCAAAAGGCAACGCATTCTTCTCTTCTCTCTGAAGACCTTGAGGCTAGAAACGAAACTCTCAGC 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 AGGAAATGGCTCAAAAGGCAACGCATTCTTCTCTTCTCTCTGAAGACCTTGAGGCTAGAAACGAAACTCTCAGC 516
Query 418 AACACGTTAGTGGAACTTTCTGCCCAGGTAGGACAGCTACAAGCTCGAGAACAAGCTCTTACGACAATGATAAA 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 AACACGTTAGTGGAACTTTCTGCCCAGGTAGGACAGCTACAAGCTCGAGAACAAGCTCTTACGACAATGATAAA 590
Query 492 GCTAAAGGACAAAGATATTATTGAGGCAGTTAATCACATTGCAGATTGTTCGGGTAAATTTAAAATGCTAGAGC 565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 GCTAAAGGACAAAGATATTATTGAGGCAGTTAATCACATTGCAGATTGTTCGGGTAAATTTAAAATGCTAGAGC 664
Query 566 ATGCCCTACGTGATGCCAAGATGGCGGAGACTTGTATTGTGAAAGAAAAGCAAGATTATAAGCAGAAATTGAAG 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 ATGCCCTACGTGATGCCAAGATGGCGGAGACTTGTATTGTGAAAGAAAAGCAAGATTATAAGCAGAAATTGAAG 738
Query 640 GCACTTAAGATTGAAGTCAACAAACTAAAAGAGGACCTCAATGAAAAGACGACAGAAAATAATGAGCAACGAGA 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GCACTTAAGATTGAAGTCAACAAACTAAAAGAGGACCTCAATGAAAAGACGACAGAAAATAATGAGCAACGAGA 812
Query 714 AGAGATCATTCGCCTCAAGCAAGAGAAAAGTTGCCTGCACGATGAATTGCTTTTTACTGTAGAGAGAGAAAAGA 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 AGAGATCATTCGCCTCAAGCAAGAGAAAAGTTGCCTGCACGATGAATTGCTTTTTACTGTAGAGAGAGAAAAGA 886
Query 788 GGAAAGATGAATTGCTTAATATTGCGAAGTCAAAGCAAGAACGCACAAATTCAGAACTGCACAATCTGAGACAG 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 GGAAAGATGAATTGCTTAATATTGCGAAGTCAAAGCAAGAACGCACAAATTCAGAACTGCACAATCTGAGACAG 960
Query 862 ATTTATGTAAAACAACAGAGTGATCTGCAGTTTCTTAATTTCAATGTGGAAAATTCTCAGGAATTAATACAGAT 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATTTATGTAAAACAACAGAGTGATCTGCAGTTTCTTAATTTCAATGTGGAAAATTCTCAGGAATTAATACAGAT 1034
Query 936 GTATGACTCAAAGATGGAGGAATCAAAGGCTCTGGACTCCAGCAGAGACATGTGTTTATCAGACCTTGAAAATA 1009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 GTATGACTCAAAGATGGAGGAATCAAAGGCTCTGGACTCCAGCAGAGACATGTGTTTATCAGACCTTGAAAATA 1108
Query 1010 ACCACCCAAAAGTCGATATTAAGAGGGAAAAAAATCAGAAGTCACTGTTTAAGGACCAGAAATTTGAAGCCATG 1083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 ACCACCCAAAAGTCGATATTAAGAGGGAAAAAAATCAGAAGTCACTGTTTAAGGACCAGAAATTTGAAGCCATG 1182
Query 1084 TTGGTTCAGCAAAATAGGTCAGACAAGAGCTCTTGCGATGAATGCAAAGAGAAGAAACAACAGATCGATACTGT 1157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 TTGGTTCAGCAAAATAGGTCAGACAAGAGCTCTTGCGATGAATGCAAAGAGAAGAAACAACAGATCGATACTGT 1256
Query 1158 GTTTGGGGAGAAAAGTGTAATTAAGCTGTCATCCATATTCACCAAAGACTTAGTAGAGAAACACAACCTCCCTT 1231
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 GTTTGGGGAGAAAAGTGTAATTACGCTGTCATCCATATTCACCAAAGACTTAGTAGAGAAACACAACCTCCCTT 1330
Query 1232 GGTCTCTGGGAGGAAAAACCCAGATTGAACCCGAAAACAAAATTACATTGTGCAAGATCCACACAAAATCACCA 1305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 GGTCTCTGGGAGGAAAAACCCAGATTGAACCCGAAAACAAAATTACATTGTGCAAGATCCACACAAAATCACCA 1404
Query 1306 AAATGTCATGGCACTGGGGTTCAGAACGAAGGAAAACAACCCTCAGAAACACCCACTTTATCTGATGAGAAGCA 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 AAATGTCATGGCACTGGGGTTCAGAACGAAGGAAAACAACCCTCAGAAACACCCACTTTATCTGATGAGAAGCA 1478
Query 1380 GTGGCATGATGTCAGTGTTTACCTGGGCCTGACCAACTGTCCAAGTTCAAAACATCCAGAAAAGCTGGATGTAG 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479 GTGGCATGATGTCAGTGTTTACCTGGGCCTGACCAACTGTCCAAGTTCAAAACATCCAGAAAAGCTGGATGTAG 1552
Query 1454 AATGTCAAGATCAGATGGAAAGGTCCGAAATCTCATGCTGCCAGAAAAATGAAGCCTGTCTGGGCGAAAGTGGC 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 AATGTCAAGATCAGATGGAAAGGTCCGAAATCTCATGCTGCCAGAAAAATGAAGCCTGTCTGGGCGAAAGTGGC 1626
Query 1528 ATGTGTGACTCCAAGTGCTGCCACCCGAGTAACTTCATAATTGAAGCCCCAGGCCACATGTCTGACGTGGAGTG 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 ATGTGTGACTCCAAGTGCTGCCACCCGAGTAACTTCATAATTGAAGCCCCAGGCCACATGTCTGACGTGGAGTG 1700
Query 1602 GATGAGTATTTTCAAGCCTTCCAAAATGCAGAGAATTGTCCGCCTCAAATCTGGGTGCACCTGTTCAGAAAGCA 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 GATGAGTATTTTCAAGCCTTCCAAAATGCAGAGAATTGTCCGCCTCAAATCTGGGTGCACCTGTTCAGAAAGCA 1774
Query 1676 TCTGTGGCACACAACATGACTCCCCGGCAAGTGAGCTAATTGCCATCCAAGATTCCCACTCTTTGGGTTCTTCA 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775 TCTGTGGCACACAACATGACTCCCCGGCAAGTGAGCTAATTGCCATCCAAGATTCCCACTCTTTGGGTTCTTCA 1848
Query 1750 AAATCTGCCTTGAGAGAAGATGAGACGGAGTCCTCTTCCAATAAAAAGAACTCACCTACGAGTTTGTTAATCTA 1823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849 AAATCTGCCTTGAGAGAAGATGAGACGGAGTCCTCTTCCAATAAAAAGAACTCACCTACGAGTTTGTTAATCTA 1922
Query 1824 CAAAGATGCACCAGCATTCAATGAAAAGGCTTCAATTGTGTTACCCTCCCAGGATGATTTCTCGCCCACGAGCA 1897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923 CAAAGATGCACCAGCATTCAATGAAAAGGCTTCAATTGTGTTACCCTCCCAGGATGATTTCTCGCCCACGAGCA 1996
Query 1898 AGCTCCAGCGTTTGCTGGCGGAATCTCGTCAGATGGTGACGGACCTGGAGCTGAGCACACTGCTGCCCATCAGC 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997 AGCTCCAGCGTTTGCTGGCGGAATCTCGTCAGATGGTGACGGACCTGGAGCTGAGCACACTGCTGCCCATCAGC 2070
Query 1972 CATGAGAATCTCACTGGCAGTGCCACAAATAAGTCAGAGGTCCCAGAAGAGTCAGCTCAAAAAAATACCTTTGT 2045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2071 CATGAGAATCTCACTGGCAGTGCCACAAATAAGTCAGAGGTCCCAGAAGAGTCAGCTCAAAAAAATACCTTTGT 2144
Query 2046 CAGTTAT------------------------------------------------------------------- 2052
|||||||
Sbjct 2145 CAGTTATTGAAGGAAACAAAAGGCAACTTCAGTATTCATCGTGATCACGAATTTCTCATCTATGTGGAAGGCAG 2218
Query 2053 -------------------------------------------------------------------------- 2052
Sbjct 2219 AAAGCAGACACCAATACTGAATGAATACTTAACCGTAAAACTGAAAGAGGATTCTAGTTCTTCATAAACGGCAC 2292
Query 2053 -------------------------------------------------------------------------- 2052
Sbjct 2293 TTAATTCCAGCTGGGAGCAGAACTAGAAAGTTAATTTTTAAACATCTACACTTCATTTTCAAGTTAACCATTTT 2366
Query 2053 -------------------------------------------------------------------------- 2052
Sbjct 2367 TGTGCTGAAGAAATATTTTCATGTGAGTAAAATAAGGAAGGAACGTTCATCACTTTAAACTGAACCTGGCAAGT 2440
Query 2053 -------------------------------------------------------------------------- 2052
Sbjct 2441 TAATTTCCTCAGGAATGGGGATGTATTTTTTTAAGCATTGCAGATATCAAAGTTCTATTGTGCTGAATAAATGC 2514
Query 2053 ---------------- 2052
Sbjct 2515 CCCTTTGTTAACAGGT 2530