Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479603
• Subject: XM_011250819.2
• Aligned Length: 2414
• Identities: 2108
• Gaps: 37

Alignment

Query    1  ATGGAGCTGAGGCCCTGGTTGCTATGGGTGGTAGCAGCAACAGGAACCTTGGTCCTGCTAGCAGCTGATGCTCA  74
            |||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||.|||||.||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTGAGATCCTGGTTGCTATGGGTGGTCGCAGCAGCAGGAGCCGTGGTCCTGCTGGCAGCTGATGCTCA  74

Query   75  GGGCCAGAAGGTCTTCACCAACACGTGGGCTGTGCGCATCCCTGGAGGCCCAGCGGTGGCCAACAGTGTGGCAC  148
            .|||||||||.|||||||||||||.|||||.||||.|||.||||||||||||||.|||||..|.||.|||||.|
Sbjct   75  AGGCCAGAAGATCTTCACCAACACCTGGGCCGTGCACATTCCTGGAGGCCCAGCTGTGGCTGATAGGGTGGCGC  148

Query  149  GGAAGCATGGGTTCCTCAACCTGGGCCAGATCTTCGGGGACTATTACCACTTCTGGCATCGAGGAGTGACGAAG  222
            .|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||.||||||.|||
Sbjct  149  AGAAGCATGGCTTCCACAACCTGGGCCAGATCTTCGGTGACTATTACCACTTCTGGCACAGAGCAGTGACAAAG  222

Query  223  CGGTCCCTGTCGCCTCACCGCCCGCGGCACAGCCGGCTGCAGAGGGAGCCTCAAGTACAGTGGCTGGAACAGCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct  223  CGGTCCCTGTCGCCTCACCGCCCGCGGCACAGCCGGCTACAGAGGGAGCCTCAAGTAAAGTGGCTGGAGCAGCA  296

Query  297  GGTGGCAAAGCGACGGACTAAACGGGACGTGTACCAGGAGCCCACAGACCCCAAGTTTCCTCAGCAGTGGTACC  370
            |||.||.||||||.|..|.||..||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  GGTAGCCAAGCGAAGAGCCAAGAGGGACGTGTATCAGGAGCCCACGGACCCCAAGTTCCCCCAGCAGTGGTACC  370

Query  371  TGTCTGGTGTCACTCAGCGGGACCTGAATGTGAAGGCGGCCTGGGCGCAGGGCTACACAGGGCACGGCATTGTG  444
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  TGTCTGGTGTCACTCAGCGAGACCTGAATGTGAAGGAGGCCTGGGCCCAGGGCTTCACAGGCCATGGCATTGTG  444

Query  445  GTCTCCATTCTGGACGATGGCATCGAGAAGAACCACCCGGACTTGGCAGGCAATTATGATCCTGGGGCCAGTTT  518
            ||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.|||.|.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  445  GTCTCCATCCTGGATGACGGCATTGAGAAGAATCATCCCGACCTAGCAGGCAATTATGACCCTGGAGCCAGTTT  518

Query  519  TGATGTCAATGACCAGGACCCTGACCCCCAGCCTCGGTACACACAGATGAATGACAACAGGCACGGCACACGGT  592
            |||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  519  TGACGTGAATGACCAGGACCCCGACCCACAGCCTCGGTACACACAGATGAATGACAACAGGCATGGCACTCGCT  592

Query  593  GTGCGGGGGAAGTGGCTGCGGTGGCCAACAACGGTGTCTGTGGTGTAGGTGTGGCCTACAACGCCCGCATTGG-  665
            ||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||| 
Sbjct  593  GTGCCGGGGAAGTGGCAGCAGTGGCCAACAATGGTGTCTGTGGCGTAGGTGTAGCTTACAATGCCCGAATTGGA  666

Query  666  -----------------------------AGGGGTGCGCATGCTGGATGGCGAGGTGACAGATGCAGTGGAGGC  710
                                         |||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  GCACCCCTTTTCCCACCCCCTCTGCGGCCAGGGGTGCGGATGTTGGATGGCGAGGTGACTGATGCAGTAGAGGC  740

Query  711  ACGCTCGCTGGGCCTGAACCCCAACCACATCCACATCTACAGTGCCAGCTGGGGCCCCGAGGATGACGGCAAGA  784
            |||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  741  ACGTTCGCTGGGCCTGAATCCCAACCACATCCACATCTACAGCGCCAGCTGGGGCCCTGAGGACGACGGCAAGA  814

Query  785  CAGTGGATGGGCCAGCCCGCCTCGCCGAGGAGGCCTTCTTCCGTGGGGTTAGCCAGGGCCGAGGGGGGCTGGGC  858
            |.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  CCGTGGATGGACCAGCCCGGCTCGCTGAGGAGGCCTTCTTTCGGGGAGTTAGCCAGGGCCGAGGAGGGCTGGGC  888

Query  859  TCCATCTTTGTCTGGGCCTCGGGGAACGGGGGCCGGGAACATGACAGCTGCAACTGCGACGGCTACACCAACAG  932
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCATCTTTGTCTGGGCCTCAGGGAATGGGGGCCGGGAACATGACAGCTGCAACTGTGACGGCTACACCAACAG  962

Query  933  TATCTACACGCTGTCCATCAGCAGCGCCACGCAGTTTGGCAACGTGCCGTGGTACAGCGAGGCCTGCTCGTCCA  1006
            .|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  963  CATCTATACACTGTCCATCAGCAGCGCCACACAGTTCGGCAATGTGCCCTGGTACAGTGAGGCCTGCTCCTCCA  1036

Query 1007  CACTGGCCACGACCTACAGCAGTGGCAACCAGAATGAGAAGCAGATCGTGACGACTGACTTGCGGCAGAAGTGC  1080
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1037  CACTGGCCACCACCTACAGCAGCGGCAACCAGAATGAGAAGCAGATCGTGACAACTGACCTGAGGCAGAAGTGC  1110

Query 1081  ACGGAGTCTCACACGGGCACCTCAGCCTCTGCCCCCTTAGCAGCCGGCATCATTGCTCTCACCCTGGAGGCCAA  1154
            ||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACAGAATCTCACACAGGCACCTCGGCTTCTGCCCCCTTGGCAGCTGGTATCATTGCTCTCACCCTGGAGGCCAA  1184

Query 1155  TAAGAACCTCACATGGCGGGACATGCAACACCTGGTGGTACAGACCTCGAAGCCAGCCCACCTCAATGCCAACG  1228
            .|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||..|.|
Sbjct 1185  CAAGAACCTCACCTGGCGGGACATGCAGCACCTGGTAGTGCAGACCTCAAAGCCAGCCCACCTCAACGCTGATG  1258

Query 1229  ACTGGGCCACCAATGGTGTGGGCCGGAAAGTGAGCCACTCATATGGCTACGGGCTTTTGGACGCAGGCGCCATG  1302
            |.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1259  ATTGGGCTACCAACGGCGTGGGCCGGAAAGTGAGCCATTCGTATGGCTACGGGCTGTTGGATGCAGGTGCCATG  1332

Query 1303  GTGGCCCTGGCCCAGAATTGGACCACAGTGGCCCCCCAGCGGAAGTGCATCATCGACATCCTCACCGAGCCCAA  1376
            |||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||..|.||.|||||....||.|||||
Sbjct 1333  GTGGCTCTGGCCCAGAACTGGACAACAGTGGCCCCCCAGCGGAAGTGCATTGTTGAAATCCTGGTGGAACCCAA  1406

Query 1377  AGACATCGGGAAACGGCTCGAGGTGCGGAAGACCGTGACCGCGTGCCTGGGCGAGCCCAACCACATCACTCGGC  1450
            .||||||||.||||||||.||||||||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||..|||
Sbjct 1407  GGACATCGGCAAACGGCTAGAGGTGCGCAAGGCGGTGACAGCATGCCTGGGTGAGCCCAACCACATCACCAGGC  1480

Query 1451  TGGAGCACGCTCAGGCGCGGCTCACCCTGTCCTATAATCGCCGTGGCGACCTGGCCATCCACCTGGTCAGCCCC  1524
            ||||.||||.||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||..||||||||
Sbjct 1481  TGGAACACGTTCAGGCCCGGCTCACCCTGTCTTACAATCGCCGCGGTGACCTGGCTATCCACCTCATCAGCCCC  1554

Query 1525  ATGGGCACCCGCTCCACCCTGCTGGCAGCCAGGCCACATGACTACTCCGCAGATGGGTTTAATGACTGGGCCTT  1598
            |||||||||||||||||||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1555  ATGGGCACCCGCTCCACCCTGTTAGCTGCCAGACCACATGACTACTCTGCTGATGGGTTTAATGATTGGGCTTT  1628

Query 1599  CATGACAACTCATTCCTGGGATGAGGATCCCTCTGGCGAGTGGGTCCTAGAGATTGAAAACACCAGCGAAGCCA  1672
            |||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1629  CATGACAACCCATTCCTGGGATGAGGATCCGGCTGGCGAATGGGTCCTAGAGATTGAAAATACCAGTGAAGCCA  1702

Query 1673  ACAACTATGGGACGCTGACCAAGTTCACCCTCGTACTCTATGGCACCGCCCCTGAGGGGCTGCCCGTACCTCCA  1746
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||..|...|||||||
Sbjct 1703  ACAACTATGGGACGCTGACCAAGTTCACTCTCGTTCTGTATGGCACAGCCCCCGAGGGGCTCTCTACACCTCCA  1776

Query 1747  GAAAGCAGTGGCTGCAAGACCCTCACGTCCAGTCAGGCCTGTGTGGTGTGCGAGGAAGGCTTCTCCCTGCACCA  1820
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|.|||.||||||||
Sbjct 1777  GAAAGCAGCGGCTGCAAGACCCTCACATCCAGCCAGGCCTGCGTGGTGTGTGAGGAAGGTTACTCTCTGCACCA  1850

Query 1821  GAAGAGCTGTGTCCAGCACTGCCCTCCAGGCTTCGCCCCCCAAGTCCTCGATACGCACTATAGCACCGAGAATG  1894
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||..||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 1851  GAAAAGCTGTGTCCAGCACTGCCCACCAGGCTTCATCCCCCAAGTCCTTGATACACACTACAGCACTGAGAATG  1924

Query 1895  ACGTGGAGACCATCCGGGCCAGCGTCTGCGCCCCCTGCCACGCCTCATGTGCCACATGCCAGGGGCCGGCCCTG  1968
            |.|||||||.||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..
Sbjct 1925  ATGTGGAGATCATCCGTGCCAGCGTCTGTACCCCCTGCCACGCCTCATGTGCCACTTGCCAGGGCCCGGCCCCC  1998

Query 1969  ACAGATTGCCTCAGCTGCCCCAGCCACGCCTCCTTGGACCCTGTGGAGCAGACTTGCTCCCGGCAAAGCCAGAG  2042
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACAGACTGCCTCAGCTGCCCCAGCCATGCCTCCCTGGACCCAGTGGAGCAGACCTGCTCCCGGCAAAGCCAGAG  2072

Query 2043  CAGCCGAGAGTCCCCGCCACAGCAGCAGCCACCTCGGCTGCCCCCGGAGGTGGAGGCGGGGCAACGGCTGCGGG  2116
            ||||||.|||||.|.|||.|||||||||||.|||...||||.|||.|||||||||..||.||..|||||||.||
Sbjct 2073  CAGCCGGGAGTCTCGGCCTCAGCAGCAGCCTCCTGCACTGCGCCCTGAGGTGGAGATGGAGCCCCGGCTGCAGG  2146

Query 2117  CAGGGCTGCTGCCCTCACACCTGCCTGAGGTGGTGGCCGGCCTCAGCTGCGCCT--TCATCGTGCTGGTCTTCG  2188
            |.||   |.||.||||.||||||||.|||||..|||||||||||||||  ||||  ||||||||||..||||.|
Sbjct 2147  CTGG---GTTGGCCTCTCACCTGCCCGAGGTCCTGGCCGGCCTCAGCT--GCCTTATCATCGTGCTCATCTTTG  2215

Query 2189  TCACTGTCTTCCTGGTCCTGCAGCTGCGCTCTGGCTTTAGTTTTCGGGGGGTGAAGGTGTACACCATGGACCGT  2262
            .||..|||||||||.|||||||.|.|.|.||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 2216  GCATCGTCTTCCTGTTCCTGCATCGGTGTTCGGGCTTCAGCTTCCGGGGAGTGAAAGTGTACACCATGGACCGC  2289

Query 2263  GGCCTCATCTCCTACAAGGGGCTGCCCCCTGAAGCCTGGCAGGAGGAGTGCCCGTCTGACTCAGAAGAGGACGA  2336
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 2290  GGCCTCATCTCCTACAAGGGGCTGCCCCCTGAAGCCTGGCAGGAGGAGTGCCCATCGGACTCAGAGGAGGACGA  2363

Query 2337  GGGCCGGGGCGAGAGGACCGCCTTTATCAAAGACCAGAGCGCCCTC  2382
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2364  GGGCCGGGGCGAGAGGACCGCCTTCATCAAAGACCAGAGCGCCCTT  2409