Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479630
• Subject: XM_011239370.2
• Aligned Length: 2088
• Identities: 1894
• Gaps: 51

Alignment

Query    1  ATGGAGTTGCAGACTCTACAGGAGGCTCTTAAAGTGGAAATTCAGGTTCACCAGAAACTGGTTGCTCAAATGAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTTGCAGACTCTACAGGAGGCTCTTAAAGTGGAAATTCAGGTTCACCAGAAACTGGTTGCCCAAATGAA  74

Query   75  GCAGGATCCA---------------------CAGAATGCTGACTTAAAGAAACAGCTTCATGAACTCCAAGCCA  127
            ||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGGATCCACAGATATTTTTTCTTTCCAATCAGAATGCTGACTTAAAGAAACAGCTTCATGAACTCCAAGCCA  148

Query  128  AAATCACAGCTTTGAGTGAGAAACAGAAAAGAGTAGTTGAACAGCTACGGAAGAACCTGATAGTAAAGCAAGAA  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  149  AAATCACAGCTTTGAGTGAGAAACAGAAAAGAGTAGTTGAGCAGCTGCGCAAGAACCTGATAGTCAAACAAGAG  222

Query  202  CAACCGGACAAGTTCCAAATACAGCCATTGCCACAATCTGAAAACAAACTACAAACAGCACAGCAGCAACCACT  275
            ||.||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  CAGCCGGACAAGTTCCAGATACAGCCATTGTCACAGTCTGAAAACAAACTACAAACAGCACAGCAGCAGCCACT  296

Query  276  A------------------------CAGCAACTACAACAACAGCAGCAGTACCACCACCACCACGCCCAGCAGT  325
            |                        |||||||..||.||.|||||||||.|.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  ACAGCCACTGCAGCAGCAGCAACCGCAGCAACCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACGCCCAGCAGT  370

Query  326  CAGCTGCAGCCTCTCCCAACCTGACTGCTTCACAGAAGACTGTAACTACAGCTTCTATGATTACCACAAAGACA  399
            ||||.|||||..|.||.|..||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGCAGCAGCACCGCCTAGTCTAACTGCATCACAGAAGACTGTAACTACAGCTTCTATGATTACCACAAAGACA  444

Query  400  CTACCTCTCGTCTTGAAAGCAGCAACTGCGACCATGCCTGCCTCTGTGGTGGGCCAGAGACCTACCATTGCTAT  473
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTACCTCTCGTCTTGAAAGCAGCAACTGCGACCATGCCTGCCTCTGTTGTGGGCCAGAGACCTACCATTGCTAT  518

Query  474  GGTGACCGCCATCAACAGTCAGAAGGCTGTGCTCAGCACTGATGTGCAGAACACACCAGTCAACCTCCAGACGT  547
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTGACCGCCATCAACAGCCAGAAGGCTGTGCTCAGCACTGATGTGCAGAACACACCAGTCAACCTCCAGACGT  592

Query  548  CTAGTAAGGTCACTGGGCCTGGGGCAGAGGCTGTCCAAATTGTGGCAAAAAACACAGTCACTCT---GGTTCAG  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||.
Sbjct  593  CTAGTAAGGTCACTGGGCCTGGGGCAGAGGCTGTCCAAATTGTGGCAAAAAACACAGTCACTCTGCAGGTTCAA  666

Query  619  GCAACACCTCCTCAGCCCATCAAAGTACCACAGTTTATCCCCCCTCCTAGACTCACTCCACGTCCAAACTTTCT  692
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  667  GCAACACCTCCTCAGCCCATCAAAGTACCACAGTTTATCCCTCCTCCTAGACTCACTCCACGCCCAAACTTCCT  740

Query  693  TCCACAGGTTCGACCCAAGCCTGTGGCCCAGAATAACATTCCTATTGCCCCAGCACCACCTCCCATGCTCGCAG  766
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  741  TCCACAGGTTCGACCCAAGCCTGTGGCCCAGAATAACATTCCTATCGCTCCAGCGCCTCCTCCCATGCTTGCAG  814

Query  767  CTCCTCAGCTTATCCAGAGGCCCGTCATGCTGACCAAGTTCACCCCCACAACCCTTCCCACATCCCAGAATTCC  840
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCTCAGCTTATCCAGAGGCCTGTCATGCTGACCAAGTTTACACCCACAACCCTCCCCACATCCCAGAATTCC  888

Query  841  ATCCACCCCGTCCGTGTCGTCAATGGGCAGACTGCAACCATAGCCAAAACGTTCCCCATGGCCCAGCTCACCAG  914
            ||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCCACCCTGTCCGTGTTGTCAATGGACAGACTGCAACCATAGCCAAAACGTTCCCCATGGCCCAGCTCACCAG  962

Query  915  CATTGTGATAGCTACTCCAGGGACCAGACTCGCTGGACCTCAAACTGTACAGCTTAGCAAGCCAAGTCTTGAAA  988
            ||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|
Sbjct  963  CATTGTCATAGCTACTCCAGGGACCAGACTCCCTGGACCTCAGACTGTACAGCTTAGCAAACCAAGCCTGGAGA  1036

Query  989  AACAGACAGTTAAATCTCACACAGAAACAGATGAGAAACAAACAGAGAGCCGCACCATCACCCCACCTGCTGCA  1062
            ||||||||||||||||.|||.|||||.||||.||.||||||.||||||||||.|||.|.|||||||||||||||
Sbjct 1037  AACAGACAGTTAAATCCCACCCAGAAGCAGAGGAAAAACAAGCAGAGAGCCGTACCGTTACCCCACCTGCTGCA  1110

Query 1063  CCCAAACCAAAACGGGAGGAGAACCCTCAGAAACTTGCCTTCATGGTGTCTCTAGGGTTGGTAACACATGACCA  1136
            ||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCAAAACCAAAACGAGAAGAGAACCCTCAGAAACTTGCCTTCATGGTGTCTCTAGGGTTGGTAACACATGACCA  1184

Query 1137  TCTAGAAGAAATCCAAAGCAAGAGGCAAGAGCGAAAAAGAAGAACAACAGCAAATCCGGTCTACAGTGGAGCAG  1210
            |||||||||||||||||||||||||||.||..||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1185  TCTAGAAGAAATCCAAAGCAAGAGGCAGGAAAGAAAGAGAAGAACAACAGCAAACCCGGTGTACAGTGGGGCTG  1258

Query 1211  TCTTTGAGCCAGAGCGTAAGAAGAGTGCAGTGACATACCTAAACAGCACAATGCACCCTGGGACCCGGAAGAGA  1284
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1259  TCTTTGAGCCAGAGCGTAAGAAGAGTGCAGTCACTTACCTTAACAGCACAATGCATCCTGGGACGCGGAAGAGA  1332

Query 1285  GGTCGTCCTCCAAAATACAATGCAGTGCTGGGGTTTGGAGCCCTTACCCCAACATCCCCCCAATCCAGTCATCC  1358
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1333  GGTCGTCCTCCAAAATACAATGCGGTGCTGGGGTTTGGAGCCCTTACCCCAACATCCCCCCCATCCAGTCATCC  1406

Query 1359  TGACTCCCCTGAAAATGAAAAGACAGAGACCACATTCACTTTCCCTGCACCTGTTCAGCCTGTGTCCCTGCCCA  1432
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 1407  CGACTCCCCTGAAAATGAAAAGACAGAGACCACATTCACTTTCCCTGCACCTGTTCAGCCTGTGTCTTTGCCCA  1480

Query 1433  GCCCCACCTCCACAGACGGTGATATTCATGAGGATTTTTGCAGCGTTTGCAGAAAAAGTGGCCAGTTACTGATG  1506
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  GCCCCACCTCCACAGACGGTGATATCCATGAGGATTTTTGCAGTGTTTGCAGAAAAAGTGGCCAGTTGCTGATG  1554

Query 1507  TGCGACACATGTTCCCGTGTATATCATTTGGACTGCTTAGACCCCCCTCTGAAAACAATTCCCAAGGGCATGTG  1580
            ||.|||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTGACACGTGTTCCCGTGTGTATCATCTGGACTGCTTAGAGCCGCCCCTGAAAACAATTCCCAAGGGCATGTG  1628

Query 1581  GATCTGTCCCAGATGTCAGGACCAGATGCTGAAGAAGGAAGAAGCAATTCCATGGCCTGGAACTTTAGCAATTG  1654
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1629  GATCTGTCCCAGATGTCAGGACCAGATGCTAAAGAAGGAAGAAGCAATTCCTTGGCCTGGAACCTTAGCCATTG  1702

Query 1655  TTCATTCCTATATTGCCTACAAAGCAGCAAAAGAAGAAGAGAAACAGAAGTTACTTAAATGGAGTTCAGATTTA  1728
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1703  TTCATTCCTACATCGCCTACAAAGCAGCAAAAGAAGAGGAGAAACAGAAGCTACTTAAGTGGAGTTCAGATTTA  1776

Query 1729  AAACAAGAACGAGAACAACTAGAGCAAAAGGTGAAACAGCTCAGCAATTCCATAAGTAAATGCATGGAAATGAA  1802
            |||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||||.|||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1777  AAACAGGAGCGGGAACAACTGGAGCAGAAGGTCAAAGAGCTCAGCAGTTCTATAAGTAAATGTATGGAGATGAA  1850

Query 1803  GAACACCATCCTGGCCCGGCAGAAGGAGATGCACAGCTCCCTGGAGAAGGTAAAACAGCTGATTCGCCTCATCC  1876
            ||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||.|.|||.||.|||||..|.|
Sbjct 1851  GAGCAGCATCCTGGCGCGGCAGAAGGAGATGCGCAGCTCCCTGGACAAGGTGAAGCGGCTCATCCGCCTTGTGC  1924

Query 1877  ACGGCATCGACCTCTCCAAACCTGTAGACTCTGAGGCCACTGTGGGGGCCATCTCCAATGGCCCGGACTGCACC  1950
            |.|||.|||||||||.||.||||||.|||||.||||||||.|.|||||||.|||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1925  ATGGCGTCGACCTCTGCAGACCTGTGGACTCAGAGGCCACGGCGGGGGCCCTCTCCAATGGCCCAGACTGCACT  1998

Query 1951  CCCCCTGCCAATGCCGCCACCTCCACGCCGGCCCCTTCCCCCTCCTCCCAGAGCTGCACAGCGAACTGTAACCA  2024
            |||||||||||   ||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCCCCTGCCAA---CGCCGCCTCCACACCCGCCCCTTCCCCCTCCTCGCAGAGCTGCACAGCGAACTGTAACCA  2069

Query 2025  GGGGGAAGAGACTAAA  2040
            ||||||||||||||||
Sbjct 2070  GGGGGAAGAGACTAAA  2085