Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479702
- Subject:
- XM_006513925.3
- Aligned Length:
- 1115
- Identities:
- 815
- Gaps:
- 238
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGGGAAGGTGACGCCATCTGGGCCCCACCCATCCTTCCTCACAGCACCCTCGGCACCTTAAGCCACCACCC 74
Query 1 ----------------------ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCC 52
|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 75 TGAGCTACATTTTGGAGGGAAGATGGAATCTAAGGTCTCGGAAGGTGGCCTGAACGTAACCCTGACCATCCGCC 148
Query 53 TGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAG 126
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 149 TACTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACAGTAAAGAAGATGCGTGAAGAG 222
Query 127 AGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGC 200
|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 223 AGTGGCGCCAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGAATCGTTACAATCACAGGCCCAACTGACGC 296
Query 201 CATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTG 274
||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATCTTCAAGGCCTTTGCTATGATCGCGTACAAGTTTGAGGAGGACATCATTAATTCCATGAGCAACAGCCCTG 370
Query 275 CCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAAGGA 348
|||||||||||||.||||||||.|||.|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 CCACCAGCAAGCCTCCAGTGACACTGCGACTAGTGGTCCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAAGGT 444
Query 349 GGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTC 422
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCTCCAAGATCAAGGAGATCCGGGAGTCCACAGGTGCTCAGGTCCAGGTGGCAGGTGACATGCTGCCCAACTC 518
Query 423 CACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCA 496
|||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 519 CACAGAGCGGGCAGTGACTATCTCAGGGACCCCAGACGCCATCATCCAGTGTGTGAAACAGATCTGTGTGGTCA 592
Query 497 TGCTGG-------------------------------------------------------------------- 502
||||||
Sbjct 593 TGCTGGAGTCCCCACCGAAAGGTGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTTGCA 666
Query 503 -------AGGCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGAT---TTGACCAAGCTCCACCAGTT 566
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGTGGTCAGGCCTACACAATCCAGGGACAGTACGCCATCCCCCACCCAGATCAGTTGACCAAGCTCCACCAGTT 740
Query 567 GGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTAC 640
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCC------------------- 795
Query 641 ACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCAT 714
||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 796 -----------------------------------------GGTCTGGATGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCAT 828
Query 715 GAGCTCACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACA 788
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 829 GAGCTCACCATTCCCAATGATCTTATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGCACCAAAATCAATGAAATCCGACA 902
Query 789 GATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGA 862
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 903 GATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAATGCCACTGAAGGGTCGTCAGAGCGCCAGATTACCATCACAGGGA 976
Query 863 CCCCGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGG--GCA 934
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||| |||
Sbjct 977 CCCCAGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCTAGGCTGACGTCTGAGGTCACCGGGATGGGTGCA 1050
Query 935 CGCTG 939
|.|
Sbjct 1051 CTC-- 1053