Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479737
• Subject: NM_001243231.2
• Aligned Length: 2001
• Identities: 1869
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  ATGCATCACCAACAGCGAATGGCTGCCTTAGGGACGGACAAAGAGCTGAGTGATTTACTGGATTTCAGTGCGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTTTTCACCTCCTGTGAGCAGTGGGAAAAATGGACCAACTTCTTTGGCAAGTGGACATTTTACTGGCTCAAATG  148
                                         ||||               |||.|||||        ||..|.|||
Sbjct    1  -----------------------------ATGG---------------AAGAGGACA--------GCAGAGATG  22

Query  149  TAGAAGACAGAAGTAGCTCAGGGTCCTGGGGGAATGGAGGACATCCAAGCCCGTCCAGGAACTATGGAGATGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   23  TAGAAGACAGAAGTAGCTCAGGGTCCTGGGGGAATGGAGGACATCCAAGCCCGTCCAGGAACTATGGAGATGGG  96

Query  223  ACTCCCTATGACCACATGACCAGCAGGGACCTTGGGTCACATGACAATCTCTCTCCACCTTTTGTCAATTCCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   97  ACTCCCTATGACCACATGACCAGCAGGGACCTTGGGTCACATGACAATCTCTCTCCACCTTTTGTCAATTCCAG  170

Query  297  AATACAAAGTAAAACAGAAAGGGGCTCATACTCATCTTATGGGAGAGAATCAAACTTACAGGGTTGCCACCAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  171  AATACAAAGTAAAACAGAAAGGGGCTCATACTCATCTTATGGGAGAGAATCAAACTTACAGGGTTGCCACCAGC  244

Query  371  AGAGTCTCCTTGGAGGTGACATGGATATGGGCAACCCAGGAACCCTTTCGCCCACCAAACCTGGTTCCCAGTAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  245  AGAGTCTCCTTGGAGGTGACATGGATATGGGCAACCCAGGAACCCTTTCGCCCACCAAACCTGGTTCCCAGTAC  318

Query  445  TATCAGTATTCTAGCAATAATCCCCGAAGGAGGCCTCTTCACAGTAGTGCCATGGAGGTACAGACAAAGAAAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  319  TATCAGTATTCTAGCAATAATCCCCGAAGGAGGCCTCTTCACAGTAGTGCCATGGAGGTACAGACAAAGAAAGT  392

Query  519  TCGAAAAGTTCCTCCAGGTTTGCCATCTTCAGTCTATGCTCCATCAGCAAGCACTGCCGACTACAATAGGGACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  393  TCGAAAAGTTCCTCCAGGTTTGCCATCTTCAGTCTATGCTCCATCAGCAAGCACTGCCGACTACAATAGGGACT  466

Query  593  CGCCAGGCTATCCTTCCTCCAAACCAGCAACCAGCACTTTCCCTAGCTCCTTCTTCATGCAAGATGGCCATCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  467  CGCCAGGCTATCCTTCCTCCAAACCAGCAACCAGCACTTTCCCTAGCTCCTTCTTCATGCAAGATGGCCATCAC  540

Query  667  AGCAGTGACCCTTGGAGCTCCTCCAGTGGGATGAATCAGCCTGGCTATGCAGGAATGTTGGGCAACTCTTCTCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541  AGCAGTGACCCTTGGAGCTCCTCCAGTGGGATGAATCAGCCTGGCTATGCAGGAATGTTGGGCAACTCTTCTCA  614

Query  741  TATTCCACAGTCCAGCAGCTACTGTAGCCTGCATCCACATGAACGTTTGAGCTATCCATCACACTCCTCAGCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  615  TATTCCACAGTCCAGCAGCTACTGTAGCCTGCATCCACATGAACGTTTGAGCTATCCATCACACTCCTCAGCAG  688

Query  815  ACATCAATTCCAGTCTTCCTCCGATGTCCACTTTCCATCGTAGTGGTACAAACCATTACAGCACCTCTTCCTGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  689  ACATCAATTCCAGTCTTCCTCCGATGTCCACTTTCCATCGTAGTGGTACAAACCATTACAGCACCTCTTCCTGT  762

Query  889  ACGCCTCCTGCCAACGGGACAGACAGTATAATGGCAAATAGAGGAAGCGGGGCAGCCGGCAGCTCCCAGACTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  763  ACGCCTCCTGCCAACGGGACAGACAGTATAATGGCAAATAGAGGAAGCGGGGCAGCCGGCAGCTCCCAGACTGG  836

Query  963  AGATGCTCTGGGGAAAGCACTTGCTTCGATCTATTCTCCAGATCACACTAACAACAGCTTTTCATCAAACCCTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837  AGATGCTCTGGGGAAAGCACTTGCTTCGATCTATTCTCCAGATCACACTAACAACAGCTTTTCATCAAACCCTT  910

Query 1037  CAACTCCTGTTGGCTCTCCTCCATCTCTCTCAGCAGGCACAGCTGTTTGGTCTAGAAATGGAGGACAGGCCTCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  911  CAACTCCTGTTGGCTCTCCTCCATCTCTCTCAGCAGGCACAGCTGTTTGGTCTAGAAATGGAGGACAGGCCTCA  984

Query 1111  TCGTCTCCTAATTATGAAGGACCCTTACACTCTTTGCAAAGCCGAATTGAAGATCGTTTAGAAAGACTGGATGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  985  TCGTCTCCTAATTATGAAGGACCCTTACACTCTTTGCAAAGCCGAATTGAAGATCGTTTAGAAAGACTGGATGA  1058

Query 1185  TGCTATTCATGTTCTCCGGAACCATGCAGTGGGCCCATCCACAGCTATGCCTGGTGGTCATGGGGACATGCATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1059  TGCTATTCATGTTCTCCGGAACCATGCAGTGGGCCCATCCACAGCTATGCCTGGTGGTCATGGGGACATGCATG  1132

Query 1259  GAATCATTGGACCTTCTCATAATGGAGCCATGGGTGGTCTGGGCTCAGGGTATGGAACCGGCCTTCTTTCAGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133  GAATCATTGGACCTTCTCATAATGGAGCCATGGGTGGTCTGGGCTCAGGGTATGGAACCGGCCTTCTTTCAGCC  1206

Query 1333  AACAGACATTCACTCATGGTGGGGACCCATCGTGAAGATGGCGTGGCCCTGAGAGGCAGCCATTCTCTTCTGCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1207  AACAGACATTCACTCATGGTGGGGACCCATCGTGAAGATGGCGTGGCCCTGAGAGGCAGCCATTCTCTTCTGCC  1280

Query 1407  AAACCAGGTTCCGGTTCCACAGCTTCCTGTCCAGTCTGCGACTTCCCCTGACCTGAACCCACCCCAGGACCCTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281  AAACCAGGTTCCGGTTCCACAGCTTCCTGTCCAGTCTGCGACTTCCCCTGACCTGAACCCACCCCAGGACCCTT  1354

Query 1481  ACAGAGGCATGCCACCAGGACTACAGGGGCAGAGTGTCTCCTCTGGCAGCTCTGAGATCAAATCCGATGACGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355  ACAGAGGCATGCCACCAGGACTACAGGGGCAGAGTGTCTCCTCTGGCAGCTCTGAGATCAAATCCGATGACGAG  1428

Query 1555  GGTGATGAGAACCTGCAAGACACGAAATCTTCGGAGGACAAGAAATTAGATGACGACAAGAAGGATATCAAATC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429  GGTGATGAGAACCTGCAAGACACGAAATCTTCGGAGGACAAGAAATTAGATGACGACAAGAAGGATATCAAATC  1502

Query 1629  AATTACTAGCAATAATGACGATGAGGACCTGACACCAGAGCAGAAGGCAGAGCGTGAGAAGGAGCGGAGGATGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503  AATTACTAGCAATAATGACGATGAGGACCTGACACCAGAGCAGAAGGCAGAGCGTGAGAAGGAGCGGAGGATGG  1576

Query 1703  CCAACAATGCCCGAGAGCGTCTGCGGGTCCGTGACATCAACGAGGCTTTCGAAGAGCTCGGCCGCATGGTGCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577  CCAACAATGCCCGAGAGCGTCTGCGGGTCCGTGACATCAACGAGGCTTTCAAAGAGCTCGGCCGCATGGTGCAG  1650

Query 1777  CTCCACCTCAAGAGTGACAAGCCCCAGACCAAGCTCCTGATCCTCCACCAGGCGGTGGCCGTCATCCTCAGTCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651  CTCCACCTCAAGAGTGACAAGCCCCAGACCAAGCTCCTGATCCTCCACCAGGCGGTGGCCGTCATCCTCAGTCT  1724

Query 1851  GGAGCAGCAAGTCCGAGAAAGGAATCTGAATCCGAAAGCTGCGTGTCTGAAAAGAAGGGAGGAAGAGAAGGTGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1725  GGAGCAGCAAGTCCGAGAAAGGAATCTGAATCCGAAAGCTGCGTGTCTGAAAAGAAGGGAGGAAGAGAAGGTGT  1798

Query 1925  CCTCGGAGCCTCCCCCTCTCTCCTTGGCCGGCCCACACCCTGGAATGGGAGACGCATCGAATCACATGGGACAG  1998
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799  CCTCAGAGCCTCCCCCTCTCTCCTTGGCCGGCCCACACCCTGGAATGGGAGACGCATCGAATCACATGGGACAG  1872

Query 1999  ATG  2001
            |||
Sbjct 1873  ATG  1875