Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479745
- Subject:
- XM_017020323.2
- Aligned Length:
- 2722
- Identities:
- 1781
- Gaps:
- 938
Alignment
Query 1 ATGGCGACCCCGGACCAGAAGTCGCCGAACGTTCTGCTGCAGAACCTGTGCTGCAGGATCCTGGGCAGGAGCGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AGCTGATGTAGCCCAGCAGTTCCAGTATGCTGTGCGGGTGATTGGCAGCAACTTCGCCCCAACTGTTGAAAGAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGAATTTTTAGTAGCTGAAAAAATCAAGAAAGAGCTTATTCGACAACGAAGAGAAGCAGATGCTGCATTATTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TCAGAACTCCACAGAAAACTTCATTCACAGGGAGTTTTGAAAAATAAATGGTCAATACTCTACCTCTTGCTGAG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCTCAGTGAGGACCCACGCAGGCAGCCAAGCAAGGTTTCTAGCTATGCTACGTTATTTGCTCAGGCCTTACCAA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GAGATGCCCACTCAACCCCTTACTACTATGCCAGGCCTCAGACCCTTCCCCTGAGCTACCAAGATCGGAGTGCC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CAGTCAGCCCAGAGCTCCGGCAGCGTGGGCAGCAGTGGCATCAGCAGCATTGGCCTGTGTGCCCTCAGTGGCCC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CGCGCCTGCGCCACAATCTCTCCTCCCAGGACAGTCTAATCAAGCTCCAGGAGTAGGAGATTGCCTTCGACAGC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 AGTTGGGGTCACGACTCGCATGGACTTTAACTGCAAATCAGCCTTCTTCACAAGCCACTACCTCAAAAGGTGTC 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 CCCAGTGCTGTGTCTCGCAACATGACAAGGTCCAGGAGAGAAGGGGATACGGGTGGTACTATGGAAATTACAGA 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------ATGACAAGGTCCAGGAGAGAAGGGGATACGGGTGGTACTATGGAAATTACAGA 53
Query 741 AGCAGCTCTGGTAAGGGACATTTTGTACGTCTTTCAGGGCATAGATGGCAAAAACATCAAAATGAACAACACTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 54 AGCAGCTCTGGTAAGGGACATTTTGTACGTCTTTCAGGGCATAGATGGCAAAAACATCAAAATGAACAACACTG 127
Query 815 AAAATTGTTACAAAGTAGAAGGAAAGGCAAATCTAAGTAGGTCTTTGAGAGACACAGCAGTCAGGCTTTCTGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 128 AAAATTGTTACAAAGTAGAAGGAAAGGCAAATCTAAGTAGGTCTTTGAGAGACACAGCAGTCAGGCTTTCTGAG 201
Query 889 TTGGGATGGTTGCATAATAAAATCAGAAGATACACGGACCAGAGGAGCCTGGACCGCTCATTCGGACTCGTCGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 202 TTGGGATGGTTGCATAATAAAATCAGAAGATACACGGACCAGAGGAGCCTGGACCGCTCATTCGGACTCGTCGG 275
Query 963 GCAGAGCTTTTGTGCTGCCTTGCACCAGGAACTCAGAGAATACTATCGATTGCTCTCTGTTTTACATTCTCAGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 GCAGAGCTTTTGTGCTGCCTTGCACCAGGAACTCAGAGAATACTATCGATTGCTCTCTGTTTTACATTCTCAGC 349
Query 1037 TACAACTAGAGGATGACCAGGGTGTGAATTTGGGACTTGAGAGTAGTTTAACACTTCGGCGCCTCCTGGTTTGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 TACAACTAGAGGATGACCAGGGTGTGAATTTGGGACTTGAGAGTAGTTTAACACTTCGGCGCCTCCTGGTTTGG 423
Query 1111 ACCTATGATCCCAAAATACGACTGAAGACCCTTGCGGCCCTAGTGGACCACTGCCAAGGAAGGAAAGGAGGTGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 424 ACCTATGATCCCAAAATACGACTGAAGACCCTTGCGGCCCTAGTGGACCACTGCCAAGGAAGGAAAGGAGGTGA 497
Query 1185 GCTGGCCTCAGCTGTCCACGCCTACACAAAAACAGGAGACCCGTACATGCGGTCTCTGGTGCAGCACATCCTCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 498 GCTGGCCTCAGCTGTCCACGCCTACACAAAAACAGGAGACCCGTACATGCGGTCTCTGGTGCAGCACATCCTCA 571
Query 1259 GCCTCGTGTCTCATCCTGTTTTGAGCTTCCTGTACCGCTGGATATATGATGGGGAGCTTGAGGACACTTACCAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 572 GCCTCGTGTCTCATCCTGTTTTGAGCTTCCTGTACCGCTGGATATATGATGGGGAGCTTGAGGACACTTACCAC 645
Query 1333 GAATTTTTTGTAGCATCAGATCCAACAGTTAAAACAGATCGACTGTGGCACGACAAGTATACTTTGAGGAAATC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 646 GAATTTTTTGTAGCATCAGATCCAACAGTTAAAACAGATCGACTGTGGCACGACAAGTATACTTTGAGGAAATC 719
Query 1407 GATGATTCCTTCGTTTATGACGATGGATCAGTCTAGGAAGGTCCTTTTGATAGGAAAATCAATAAATTTCTTGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GATGATTCCTTCGTTTATGACGATGGATCAGTCTAGGAAGGTCCTTTTGATAGGAAAATCAATAAATTTCTTGC 793
Query 1481 ACCAAGTTTGTCATGATCAGACTCCCACTACAAAGATGATAGCTGTGACCAAGTCTGCAGAGTCACCCCAGGAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 794 ACCAAGTTTGTCATGATCAGACTCCCACTACAAAGATGATAGCTGTGACCAAGTCTGCAGAGTCACCCCAGGAC 867
Query 1555 GCTGCAGACCTATTCACAGACTTGGAAAATGCATTTCAGGGGAAGATTGATGCTGCTTATTTTGAGACCAGCAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 868 GCTGCAGACCTATTCACAGACTTGGAAAATGCATTTCAGGGGAAGATTGATGCTGCTTATTTTGAGACCAGCAA 941
Query 1629 ATACCTGTTGGATGTTCTCAATAAAAAGTACAGCTTGCTGGACCACATGCAGGCAATGAGGCGGTACCTGCTTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 942 ATACCTGTTGGATGTTCTCAATAAAAAGTACAGCTTGCTGGACCACATGCAGGCAATGAGGCGGTACCTGCTTC 1015
Query 1703 TTGGTCAAGGAGACTTTATAAGGCACTTAATGGACTTGCTAAAACCAGAACTTGTCCGTCCAGCTACGACTTTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016 TTGGTCAAGGAGACTTTATAAGGCACTTAATGGACTTGCTAAAACCAGAACTTGTCCGTCCAGCTACGACTTTG 1089
Query 1777 TATCAGCATAACTTGACTGGAATTCTAGAAACCGCTGTCAGAGCCACCAACGCACAGTTTGACAGTCCTGAGAT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090 TATCAGCATAACTTGACTGGAATTCTAGAAACCGCTGTCAGAGCCACCAACGCACAGTTTGACAGTCCTGAGAT 1163
Query 1851 CCTGCGAAGGCTGGACGTGCGGCTGCTGGAGGTCTCTCCAGGTGACACTGGATGGGATGTCTTCAGCCTCGATT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 CCTGCGAAGGCTGGACGTGCGGCTGCTGGAGGTCTCTCCAGGTGACACTGGATGGGATGTCTTCAGCCTCGATT 1237
Query 1925 ATCATGTTGACGGACCAATTGCAACTGTGTTTACTCGAGAATGTATGAGCCACTACCTAAGAGTATTTAACTTC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238 ATCATGTTGACGGACCAATTGCAACTGTGTTTACTCGAGAATGTATGAGCCACTACCTAAGAGTATTTAACTTC 1311
Query 1999 CTCTGGAGGGCGAAGCGGATGGAATACATCCTCACTGACATACGGAAGGGACACATGTGCAATGCAAAGCTCCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 CTCTGGAGGGCGAAGCGGATGGAATACATCCTCACTGACATACGGAAGGGACACATGTGCAATGCAAAGCTCCT 1385
Query 2073 GAGAAACATGCCAGAGTTCTCCGGGGTGCTGCACCAGTGTCACATTTTGGCCTCTGAGATGGTCCATTTCATTC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 GAGAAACATGCCAGAGTTCTCCGGGGTGCTGCACCAGTGTCACATTTTGGCCTCTGAGATGGTCCATTTCATTC 1459
Query 2147 ATCAGATGCAGTATTACATCACATTTGAGGTGCTTGAATGTTCTTGGGATGAGCTTTGGAACAAAGTCCAGCAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460 ATCAGATGCAGTATTACATCACATTTGAGGTGCTTGAATGTTCTTGGGATGAGCTTTGGAACAAAGTCCAGCAG 1533
Query 2221 GCCCAGGATTTGGATCACATCATTGCTGCACACGAGGTGTTCTTAGACACCATCATCTCCCGCTGCCTGCTGGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534 GCCCAGGATTTGGATCACATCATTGCTGCACACGAGGTGTTCTTAGACACCATCATCTCCCGCTGCCTGCTGGA 1607
Query 2295 CAGTGACTCCAGGGCACTTTTAAATCAACTTAGAGCTGTGTTTGATCAAATTATTGAACTTCAGAATGCTCAAG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 CAGTGACTCCAGGGCACTTTTAAATCAACTTAGAGCTGTGTTTGATCAAATTATTGAACTTCAGAATGCTCAAG 1681
Query 2369 ATGCAATATACAGAGCTGCTCTGGAAGAATTGCAGAGACGATTACAGTTTGAAGAGAAAAAGAAACAGCGTGAA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682 ATGCAATATACAGAGCTGCTCTGGAAGAATTGCAGAGACGATTACAGTTTGAAGAGAAAAAGAAACAGCGTGAA 1755
Query 2443 ATTGAG-----GTTGAGATGTG---------------------------------------------------C 2460
|||||| ||.|.|| ||| .
Sbjct 1756 ATTGAGGGCCAGTGGGGA-GTGACGGCAGCAGAGGAAGAGGAGGAAAATAAGAGGATTGGAGAATTTAAAGAAT 1828
Query 2461 CTATAC--------TGC-----GTT------------------------------------------------- 2472
|||||| ||| |||
Sbjct 1829 CTATACCAAAAATGTGCTCACAGTTGCGAATATTGACCCATTTCTACCAGGGTATCGTGCAGCAGTTTTTGGTG 1902
Query 2473 -------------------------------------------------------------------------- 2472
Sbjct 1903 TTACTGACGACCAGCTCTGACGAGAGTCTTCGGTTTCTTAGCTTCAGGCTGGACTTCAACGAGCATTACAAAGC 1976
Query 2473 ---------------------------------------------------------- 2472
Sbjct 1977 CAGGGAGCCCAGGCTCCGTGTGTCTCTGGGTACCAGGGGGCGGCGCAGCTCCCACACG 2034