Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479782
• Subject: XM_011524006.3
• Aligned Length: 1251
• Identities: 1188
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGGCTGTATCACTAACAGCAGCTGAAACTCTGGCCCTTCAGGGTACACAGGGACAAGAGAAGATGATGATGAT  74
                                                                           |||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGATGATGAT  11

Query   75  GGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTGAGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGTCAAGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   12  GGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTGAGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGTCAAGAGA  85

Query  149  TCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAGGAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCAACTACGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   86  TCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAGGAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCAACTACGA  159

Query  223  GTACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAAGGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGCTGGAACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  GTACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAAGGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGCTGGAACA  233

Query  297  ATTCTTGACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTGGGTGCGGGGACATCACCCTAAGAGTGGAGAGGAGGCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  234  ATTCTTGACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTGGGTGCGGGGACATCACCCTAAGAGTGGAGAGGAGGCTG  307

Query  371  TGACTGTGCTGGAGGATTTAGAGAAAGGACTTGAACCAGAGCCGCAGGTCCCAGGCCCTGCACATGGACCTGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  308  TGACTGTGCTGGAGGATTTAGAGAAAGGACTTGAACCAGAGCCGCAGGTCCCAGGCCCTGCACATGGACCTGCA  381

Query  445  CAGGAAGAGCCATGGGAGAAGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCATCCAGCTCCAGCCTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  382  CAGGAAGAGCCATGGGAGAAGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCATCCAGCTCCAGCCTAA  455

Query  519  GGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGTGAACAGGTATATTTACATTTTCTGTCAGTTGTTACAGAAGATGGCCCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  456  GGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGTGAACAGGTATATTTACATTTTCTGTCAGTTGTTACAGAAGATGGCCCAG  529

Query  593  AGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACCACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGAAAAACTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  530  AGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACCACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGAAAAACTT  603

Query  667  GCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGGGTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCAAAGCGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  604  GCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGGGTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCAAAGCGGA  677

Query  741  GAGACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAGATGGTTGTCATCCATAAGGAAATTCCCACAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  678  GAGACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAGATGGTTGTCATCCATAAGGAAATTCCCACAG  751

Query  815  GGAAGAAAGACCATGAATGTAGTGAATGTGGTAAAACCTTCATTTATAACTCACATCTTGTTGTCCACCAGAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  752  GGAAGAAAGACCATGAATGTAGTGAATGTGGTAAAACCTTCATTTATAACTCACATCTTGTTGTCCACCAGAGA  825

Query  889  GTTCATTCTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTAGTGACTGTGGGAAAACTTTCAAACAGAGCTCAAACCTCGGTCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  826  GTTCATTCTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTAGTGACTGTGGGAAAACTTTCAAACAGAGCTCAAACCTCGGTCA  899

Query  963  GCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCCTTCGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGATGGGGTGCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  900  GCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCCTTCGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGATGGGGTGCTC  973

Query 1037  ATCTTGTTCAGCATCAGAGGATTCACTCAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGGAAGGCCTTTAGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  974  ATCTTGTTCAGCATCAGAGGATTCACTCAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGGAAGGCCTTTAGT  1047

Query 1111  CAAAGCTCATATCTAAGTCAGCATCGGAGAATTCACAGTGGAGAGAAACCTTTTATATGTAAAGAATGTGGGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048  CAAAGCTCATATCTAAGTCAGCATCGGAGAATTCACAGTGGAGAGAAACCTTTTATATGTAAAGAATGTGGGAA  1121

Query 1185  AGCTTATGGATGGTGCTCAGAGCTCATTAGACATCGGAGAGTTCATGCCAGAAAAGAGCCTTCCCAT  1251
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1122  AGCTTATGGATGGTGCTCAGAGCTCATTAGACATCGGAGAGTTCATGCCAGAAAAGAGCCTTCCCAT  1188