Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479782
• Subject: XM_017025023.2
• Aligned Length: 1251
• Identities: 1077
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  ATGGCTGTATCACTAACAGCAGCTGAAACTCTGGCCCTTCAGGGTACACAGGGACAAGAGAAGATGATGATGAT  74
                                                                           |||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGATGATGAT  11

Query   75  GGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTGAGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGTCAAGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   12  GGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTGAGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGTCAAGAGA  85

Query  149  TCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAGGAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCAACTACGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   86  TCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAGGAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCAACTACGA  159

Query  223  GTACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAAGGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGCTGGAACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  GTACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAAGGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGCTGGAACA  233

Query  297  ATTCTTGACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTGGGTGCGGGGACATCACCCTAAGAGTGGAGAGGAGGCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  234  ATTCTTGACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTG--------------------------------------  269

Query  371  TGACTGTGCTGGAGGATTTAGAGAAAGGACTTGAACCAGAGCCGCAGGTCCCAGGCCCTGCACATGGACCTGCA  444
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  ----------------------------------------------GGTCCCAGGCCCTGCACATGGACCTGCA  297

Query  445  CAGGAAGAGCCATGGGAGAAGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCATCCAGCTCCAGCCTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298  CAGGAAGAGCCATGGGAGAAGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCATCCAGCTCCAGCCTAA  371

Query  519  GGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGTGAACAGGTATATTTACATTTTCTGTCAGTTGTTACAGAAGATGGCCCAG  592
            |||||||||||||||||||||||||                           ||||||||||||||||||||||
Sbjct  372  GGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGT---------------------------GTTGTTACAGAAGATGGCCCAG  418

Query  593  AGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACCACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGAAAAACTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419  AGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACCACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGAAAAACTT  492

Query  667  GCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGGGTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCAAAGCGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  493  GCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGGGTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCAAAGCGGA  566

Query  741  GAGACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAGATGGTTGTCATCCATAAGGAAATTCCCACAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  567  GAGACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAGATGGTTGTCATCCATAAGGAAATTCCCACAG  640

Query  815  GGAAGAAAGACCATGAATGTAGTGAATGTGGTAAAACCTTCATTTATAACTCACATCTTGTTGTCCACCAGAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  641  GGAAGAAAGACCATGAATGTAGTGAATGTGGTAAAACCTTCATTTATAACTCACATCTTGTTGTCCACCAGAGA  714

Query  889  GTTCATTCTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTAGTGACTGTGGGAAAACTTTCAAACAGAGCTCAAACCTCGGTCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  715  GTTCATTCTGGAGAGAAACCCTATAAGTGTAGTGACTGTGGGAAAACTTTCAAACAGAGCTCAAACCTCGGTCA  788

Query  963  GCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCCTTCGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGATGGGGTGCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  789  GCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACCCTTCGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAGATGGGGTGCTC  862

Query 1037  ATCTTGTTCAGCATCAGAGGATTCACTCAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGGAAGGCCTTTAGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  863  ATCTTGTTCAGCATCAGAGGATTCACTCAGGAGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGGAAGGCCTTTAGT  936

Query 1111  CAAAGCTCATATCTAAGTCAGCATCGGAGAATTCACAGTGGAGAGAAACCTTTTATATGTAAAGAATGTGGGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  937  CAAAGCTCATATCTAAGTCAGCATCGGAGAATTCACAGTGGAGAGAAACCTTTTATATGTAAAGAATGTGGGAA  1010

Query 1185  AGCTTATGGATGGTGCTCAGAGCTCATTAGACATCGGAGAGTTCATGCCAGAAAAGAGCCTTCCCAT  1251
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011  AGCTTATGGATGGTGCTCAGAGCTCATTAGACATCGGAGAGTTCATGCCAGAAAAGAGCCTTCCCAT  1077