Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479789
• Subject: XM_005245313.3
• Aligned Length: 1569
• Identities: 1473
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGTCGCTGGTTGCTTACGCCAGCAGCGATGAGAGCGAGCCGGATGAGGCTGAGCCCGAGCCGGAGGAAGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGCTGGTTGCTTACGCCAGCAGCGATGAGAGCGAGCCGGATGAGGCTGAGCCCGAGCCGGAGGAAGAGGA  74

Query   75  GGCGGTGGCTCCTACATCTGGGCCCGCTTTAGGGGGCTTGTTCGCTTCTCTCCCTGCGCCCAAGGGTCCGGCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCGGTGGCTCCTACATCTGGGCCCGCTTTAGGGGGCTTGTTCGCTTCTCTCCCTGCGCCCAAGGGTCCGGCCT  148

Query  149  TGCTGCCTCCGCCCCCTCAGATGCTGGCGCCAGCCTTTCCCCCGCCGCTGTTGCTTCCCCCACCCACCGGAGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGCCTCCGCCCCCTCAGATGCTGGCGCCAGCCTTTCCCCCGCCGCTGTTGCTTCCCCCACCCACCGGAGAC  222

Query  223  CCCAGGCTTCAGCCTCCTCCCCCCTTGCCCTTCGGCCTGGGAGGCTTCCCCCCACCTCCAGGCGTGAGCCCGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCAGGCTTCAGCCTCCTCCCCCCTTGCCCTTCGGCCTGGGAGGCTTCCCCCCACCTCCAGGCGTGAGCCCGGC  296

Query  297  TGAAGCGGCGGGAGTTGGGGAGGGACTGGGATTGGGGTTGCCCTCGCCCCGAGGCCCTGGCCTCAATCTGCCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGCGGCGGGAGTTGGGGAGGGACTGGGATTGGGGTTGCCCTCGCCCCGAGGCCCTGGCCTCAATCTGCCCC  370

Query  371  CTCCAATTGGCGGTGCCGGTCCCCCGCTGGGGCTTCCCAAGCCAAAGAAGAGGAAAGAGCCCGTGAAGATCGCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCAATTGGCGGTGCCGGTCCCCCGCTGGGGCTTCCCAAGCCAAAGAAGAGGAAAGAGCCCGTGAAGATCGCG  444

Query  445  GCGCCGGAGTTGCATAAGGGAGATTCAGATTCTGAGGAAGATGAACCCACAAAGAAGAAAACTATCCTTCAGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCGCCGGAGTTGCATAAGGGAGATTCAGATTCTGAGGAAGATGAACCCACAAAGAAGAAAACTATCCTTCAGGG  518

Query  519  ATCCAGTGAGGGGACTGGTTTGTCTGCCTTGCTTCCCCAACCTAAAAACCTGACTGTGAAAGAGACTAACAGGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCCAGTGAGGGGACTGGTTTGTCTGCCTTGCTTCCCCAACCTAAAAACCTGACTGTGAAAGAGACTAACAGGT  592

Query  593  TGCTCCTGCCCCATGCCTTCTCCCGCAAACCCTCGGATGGCTCCCCTGATACTAAGCCCTCCAGACTGGCTTCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTCCTGCCCCATGCCTTCTCCCGCAAACCCTCGGATGGCTCCCCTGATACTAAGCCCTCCAGACTGGCTTCT  666

Query  667  AAGACCAAGACTTCCTCTCTTGCCCCTGTTGTGGGCACCACAACCACCACTCCGTCGCCCTCTGCTATCAAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGACCAAGACTTCCTCTCTTGCCCCTGTTGTGGGCACCACAACCACCACTCCGTCGCCCTCTGCTATCAAGGC  740

Query  741  TGCTGCCAAGAGTGCTGCCCTGCAGGTGACAAAGCAGATCACGCAGGAAGAAGACGACAGTGATGAGGAAGTAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTGCCAAGAGTGCTGCCCTGCAGGTGACAAAGCAGATCACGCAGGAAGAAGACGACAGTGATGAGGAAGTAG  814

Query  815  CCCCCGAAAACTTTTTCTCCCTCCCTGAAAAGGCTGAGCCACCTGGAGTTGAGCCATACCCTTACCCCATCCCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCCGAAAACTTTTTCTCCCTCCCTGAAAAGGCTGAGCCACCTGGAGTTGAGCCATACCCTTACCCCATCCCC  888

Query  889  ACTGTCCCTGAAGAGCTGCCTCCAGGCACGGAACCAGAGCCGGCTTTCCAGGACGATGCAGCCAATGCCCCCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTGTCCCTGAAGAGCTGCCTCCAGGCACGGAACCAGAGCCGGCTTTCCAGGACGATGCAGCCAATGCCCCCCT  962

Query  963  TGAATTCAAGATGGCAGCAGGTTCAAGTGGGGCCCCTTGGATGCCTAAGCCTGGGGACGACTACAGCTACAATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAATTCAAGATGGCAGCAGGTTCAAGTGGGGCCCCTTGGATGCCTAAGCCTGGGGACGACTACAGCTACAATC  1036

Query 1037  AGTTTTCCACATATGGCGATGCCAATGCCGCTGGTGCTTATTATCAG---------------------------  1083
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct 1037  AGTTTTCCACATATGGCGATGCCAATGCCGCTGGTGCTTATTATCAGGGTCTGCAGCAACATCTGGGCCACTCG  1110

Query 1084  ---------------------------------------------------------------------GATTA  1088
                                                                                 |||||
Sbjct 1111  CCTCTAAGGGGAATCATGAGATTCCTGAACTCAAAATCTGGTAAACGAACCTGCTTTGTTCCCAGCTTTGATTA  1184

Query 1089  TTACAGTGGTGGCTACTATCCTGCACAGGACCCGGCCCTGGTCCCCCCCCAGGAAATTGCCCCAGATGCCTCCT  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTACAGTGGTGGCTACTATCCTGCACAGGACCCGGCCCTGGTCCCCCCCCAGGAAATTGCCCCAGATGCCTCCT  1258

Query 1163  TCATCGATGACGAAGCATTTAAGCGGCTGCAGGGCAAGAGGAACCGAGGGAGAGAAGAAATCAACTTTGTGGAG  1236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCATCGATGACGAAGCATTTAAGCGGCTGCAGGGCAAGAGGAACCGAGGGAGAGAAGAAATCAACTTTGTGGAG  1332

Query 1237  ATCAAAGGTGATGACCAGCTCAGTGGGGCCCAGCAATGGATGACTAAGTCATTGACAGAAGAGAAAACCATGAA  1310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCAAAGGTGATGACCAGCTCAGTGGGGCCCAGCAATGGATGACTAAGTCATTGACAGAAGAGAAAACCATGAA  1406

Query 1311  GTCATTCAGCAAAAAGAAAGGTGAGCAGCCAACAGGCCAGCAGCGGCGGAAACACCAGATCACATATCTTATTC  1384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTCATTCAGCAAAAAGAAAGGTGAGCAGCCAACAGGCCAGCAGCGGCGGAAACACCAGATCACATATCTTATTC  1480

Query 1385  ATCAGGCCAAGGAGCGGGAGCTGGAACTGAAGAACACCTGGTCAGAGAACAAGCTCAGCCGCCGTCAGACCCAA  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATCAGGCCAAGGAGCGGGAGCTGGAACTGAAGAACACCTGGTCAGAGAACAAGCTCAGCCGCCGTCAGACCCAA  1554

Query 1459  GCCAAATATGGATTC  1473
            |||||||||||||||
Sbjct 1555  GCCAAATATGGATTC  1569