Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479789
• Subject: XM_005245314.2
• Aligned Length: 1473
• Identities: 1377
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGTCGCTGGTTGCTTACGCCAGCAGCGATGAGAGCGAGCCGGATGAGGCTGAGCCCGAGCCGGAGGAAGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGCTGGTTGCTTACGCCAGCAGCGATGAGAGCGAGCCGGATGAGGCTGAGCCCGAGCCGGAGGAAGAGGA  74

Query   75  GGCGGTGGCTCCTACATCTGGGCCCGCTTTAGGGGGCTTGTTCGCTTCTCTCCCTGCGCCCAAGGGTCCGGCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCGGTGGCTCCTACATCTGGGCCCGCTTTAGGGGGCTTGTTCGCTTCTCTCCCTGCGCCCAAGGGTCCGGCCT  148

Query  149  TGCTGCCTCCGCCCCCTCAGATGCTGGCGCCAGCCTTTCCCCCGCCGCTGTTGCTTCCCCCACCCACCGGAGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGCCTCCGCCCCCTCAGATGCTGGCGCCAGCCTTTCCCCCGCCGCTGTTGCTTCCCCCACCCACCGGAGAC  222

Query  223  CCCAGGCTTCAGCCTCCTCCCCCCTTGCCCTTCGGCCTGGGAGGCTTCCCCCCACCTCCAGGCGTGAGCCCGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCAGGCTTCAGCCTCCTCCCCCCTTGCCCTTCGGCCTGGGAGGCTTCCCCCCACCTCCAGGCGTGAGCCCGGC  296

Query  297  TGAAGCGGCGGGAGTTGGGGAGGGACTGGGATTGGGGTTGCCCTCGCCCCGAGGCCCTGGCCTCAATCTGCCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGCGGCGGGAGTTGGGGAGGGACTGGGATTGGGGTTGCCCTCGCCCCGAGGCCCTGGCCTCAATCTGCCCC  370

Query  371  CTCCAATTGGCGGTGCCGGTCCCCCGCTGGGGCTTCCCAAGCCAAAGAAGAGGAAAGAGCCCGTGAAGATCGCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCAATTGGCGGTGCCGGTCCCCCGCTGGGGCTTCCCAAGCCAAAGAAGAGGAAAGAGCCCGTGAAGATCGCG  444

Query  445  GCGCCGGAGTTGCATAAGGGAGATTCAGATTCTGAGGAAGATGAACCCACAAAGAAGAAAACTATCCTTCAGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCGCCGGAGTTGCATAAGGGAGATTCAGATTCTGAGGAAGATGAACCCACAAAGAAGAAAACTATCCTTCAGGG  518

Query  519  ATCCAGTGAGGGGACTGGTTTGTCTGCCTTGCTTCCCCAACCTAAAAACCTGACTGTGAAAGAGACTAACAGGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCCAGTGAGGGGACTGGTTTGTCTGCCTTGCTTCCCCAACCTAAAAACCTGACTGTGAAAGAGACTAACAGGT  592

Query  593  TGCTCCTGCCCCATGCCTTCTCCCGCAAACCCTCGGATGGCTCCCCTGATACTAAGCCCTCCAGACTGGCTTCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTCCTGCCCCATGCCTTCTCCCGCAAACCCTCGGATGGCTCCCCTGATACTAAGCCCTCCAGACTGGCTTCT  666

Query  667  AAGACCAAGACTTCCTCTCTTGCCCCTGTTGTGGGCACCACAACCACCACTCCGTCGCCCTCTGCTATCAAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGACCAAGACTTCCTCTCTTGCCCCTGTTGTGGGCACCACAACCACCACTCCGTCGCCCTCTGCTATCAAGGC  740

Query  741  TGCTGCCAAGAGTGCTGCCCTGCAGGTGACAAAGCAGATCACGCAGGAAGAAGACGACAGTGATGAGGAAGTAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTGCCAAGAGTGCTGCCCTGCAGGTGACAAAGCAGATCACGCAGGAAGAAGACGACAGTGATGAGGAAGTAG  814

Query  815  CCCCCGAAAACTTTTTCTCCCTCCCTGAAAAGGCTGAGCCACCTGGAGTTGAGCCATACCCTTACCCCATCCCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCCGAAAACTTTTTCTCCCTCCCTGAAAAGGCTGAGCCACCTGGAGTTGAGCCATACCCTTACCCCATCCCC  888

Query  889  ACTGTCCCTGAAGAGCTGCCTCCAGGCACGGAACCAGAGCCGGCTTTCCAGGACGATGCAGCCAATGCCCCCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTGTCCCTGAAGAGCTGCCTCCAGGCACGGAACCAGAGCCGGCTTTCCAGGACGATGCAGCCAATGCCCCCCT  962

Query  963  TGAATTCAAGATGGCAGCAGGTTCAAGTGGGGCCCCTTGGATGCCTAAGCCTGGGGACGACTACAGCTACAATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAATTCAAGATGGCAGCAGGTTCAAGTGGGGCCCCTTGGATGCCTAAGCCTGGGGACGACTACAGCTACAATC  1036

Query 1037  AGTTTTCCACATATGGCGATGCCAATGCCGCTGGTGCTTATTATCAGGATTATTACAGTGGTGGCTACTATCCT  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct 1037  AGTTTTCCACATATGGCGATGCCAATGCCGCTGGTGCTTATTATCAG---------------------------  1083

Query 1111  GCACAGGACCCGGCCCTGGTCCCCCCCCAGGAAATTGCCCCAGATGCCTCCTTCATCGATGACGAAGCATTTAA  1184
                                                                                 |||||
Sbjct 1084  ---------------------------------------------------------------------TTTAA  1088

Query 1185  GCGGCTGCAGGGCAAGAGGAACCGAGGGAGAGAAGAAATCAACTTTGTGGAGATCAAAGGTGATGACCAGCTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  GCGGCTGCAGGGCAAGAGGAACCGAGGGAGAGAAGAAATCAACTTTGTGGAGATCAAAGGTGATGACCAGCTCA  1162

Query 1259  GTGGGGCCCAGCAATGGATGACTAAGTCATTGACAGAAGAGAAAACCATGAAGTCATTCAGCAAAAAGAAAGGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  GTGGGGCCCAGCAATGGATGACTAAGTCATTGACAGAAGAGAAAACCATGAAGTCATTCAGCAAAAAGAAAGGT  1236

Query 1333  GAGCAGCCAACAGGCCAGCAGCGGCGGAAACACCAGATCACATATCTTATTCATCAGGCCAAGGAGCGGGAGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  GAGCAGCCAACAGGCCAGCAGCGGCGGAAACACCAGATCACATATCTTATTCATCAGGCCAAGGAGCGGGAGCT  1310

Query 1407  GGAACTGAAGAACACCTGGTCAGAGAACAAGCTCAGCCGCCGTCAGACCCAAGCCAAATATGGATTC  1473
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  GGAACTGAAGAACACCTGGTCAGAGAACAAGCTCAGCCGCCGTCAGACCCAAGCCAAATATGGATTC  1377