Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479789
• Subject: XM_011509726.2
• Aligned Length: 1487
• Identities: 1197
• Gaps: 259

Alignment

Query    1  ATGTCGCTGGTTGCTTACGCCAGCAGCGATGAGAGCGAGCCGGATGAGGCTGAGCCCGAGCCGGAGGAAGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGCTGGTTGCTTACGCCAGCAGCGATGAGAGCGAGCCGGATGAGGCTGAGCCCGAGCCGGAGGAAGAGGA  74

Query   75  GGCGGTGGCTCCTACATCTGGGCCCGCTTTAGGGGGCTTGTTCGCTTCTCTCCCTGCGCCCAAGGGTCCGGCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCGGTGGCTCCTACATCTGGGCCCGCTTTAGGGGGCTTGTTCGCTTCTCTCCCTGCGCCCAAGGGTCCGGCCT  148

Query  149  TGCTGCCTCCGCCCCCTCAGATGCTGGCGCCAGCCTTTCCCCCGCCGCTGTTGCTTCCCCCACCCACCGGAGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGCCTCCGCCCCCTCAGATGCTGGCGCCAGCCTTTCCCCCGCCGCTGTTGCTTCCCCCACCCACCGGAGAC  222

Query  223  CCCAGGCTTCAGCCTCCTCCCCCCTTGCCCTTCGGCCTGGGAGGCTTCCCCCCACCTCCAGGCGTGAGCCCGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCAGGCTTCAGCCTCCTCCCCCCTTGCCCTTCGGCCTGGGAGGCTTCCCCCCACCTCCAGGCGTGAGCCCGGC  296

Query  297  TGAAGCGGCGGGAGTTGGGGAGGGACTGGGATTGGGGTTGCCCTCGCCCCGAGGCCCTGGCCTCAATCTGCCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGCGGCGGGAGTTGGGGAGGGACTGGGATTGGGGTTGCCCTCGCCCCGAGGCCCTGGCCTCAATCTGCCCC  370

Query  371  CTCCAATTGGCGGTGCCGGTCCCCCGCTGGGGCTTCCCAAGCCAAAGAAGAGGAAAGAGCCCGTGAAGATCGCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCAATTGGCGGTGCCGGTCCCCCGCTGGGGCTTCCCAAGCCAAAGAAGAGGAAAGAGCCCGTGAAGATCGCG  444

Query  445  GCGCCGGAGTTGCATAAGGGAGATTCAGATTCTGAGGAAGATGAACCCACAAAGAAGAAAACTATCCTTCAGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCGCCGGAGTTGCATAAGGGAGATTCAGATTCTGAGGAAGATGAACCCACAAAGAAGAAAACTATCCTTCAGGG  518

Query  519  ATCCAGTGAGGGGACTGGTTTGTCTGCCTTGCTTCCCCAACCTAAAAACCTGACTGTGAAAGAGACTAACAGGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCCAGTGAGGGGACTGGTTTGTCTGCCTTGCTTCCCCAACCTAAAAACCTGACTGTGAAAGAGACTAACAGGT  592

Query  593  TGCTCCTGCCCCATGCCTTCTCCCGCAAACCCTCGGATGGCTCCCCTGATACTAAGCCCTCCAGACTGGCTTCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTCCTGCCCCATGCCTTCTCCCGCAAACCCTCGGATGGCTCCCCTGATACTAAGCCCTCCAGACTGGCTTCT  666

Query  667  AAGACCAAGACTTCCTCTCTTGCCCCTGTTGTGGGCACCACAACCACCACTCCGTCGCCCTCTGCTATCAAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGACCAAGACTTCCTCTCTTGCCCCTGTTGTGGGCACCACAACCACCACTCCGTCGCCCTCTGCTATCAAGGC  740

Query  741  TGCTGCCAAGAGTGCTGCCCTGCAGGTGACAAAGCAGATCACGCAGGAAGAAGACGACAGTGATGAGGAAGTAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTGCCAAGAGTGCTGCCCTGCAGGTGACAAAGCAGATCACGCAGGAAGAAGACGACAGTGATGAGGAAGTAG  814

Query  815  CCCCCGAAAACTTTTTCTCCCTCCCTGAAAAGGCTGAGCCACCTGGAGTTGAGCCATACCCTTACCCCATCCCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCCGAAAACTTTTTCTCCCTCCCTGAAAAGGCTGAGCCACCTGGAGTTGAGCCATACCCTTACCCCATCCCC  888

Query  889  ACTGTCCCTGAAGAGCTGCCTCCAGGCACGGAACCAGAGCCGGCTTTCCAGGACGATGCAGCCAATGCCCCCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTGTCCCTGAAGAGCTGCCTCCAGGCACGGAACCAGAGCCGGCTTTCCAGGACGATGCAGCCAATGCCCCCCT  962

Query  963  TGAATTCAAGATGGCAGCAGGTTCAAGTGGGGCCCCTTGGATGCCTAAGCCTGGGGACGACTACAGCTACAATC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAATTCAAGATGGCAGCAGGTTCAAGTGGGGCCCCTTGGATGCCTAAGCCTGGGGACGACTACAGCTACAATC  1036

Query 1037  AGTTTTCCACATATGGCGATGCCAATGCCGCTGGTGCTTATTATCAGGATTATTACAGTGGTGGCTACTATCCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|  .|.||      ||.|| || ||
Sbjct 1037  AGTTTTCCACATATGGCGATGCCAATGCCGCTGGTGCTTATTATCAGGGT--CTGCA------GCAAC-AT-CT  1100

Query 1111  GCACAGGACCCGGCC-CTGGTCCCCCCCCA--GGAAAT--TGCCCCAGATGCCTCCT----TCATCGATGACGA  1175
            |          |||| ||    |.||.|.|  ||.|||  ||    ||||   ||||    |||         |
Sbjct 1101  G----------GGCCACT----CGCCTCTAAGGGGAATCATG----AGAT---TCCTGAACTCA---------A  1144

Query 1176  AGCATTTAAGCGGCTGCAGGGCAAGAGGAACC-GAGGGAGAGAAGAAATCAACTTTGTGGAGATCAAAGGTGAT  1248
            |  ||.|            ||.|| |.||||| |                  ||||||     ||..||.| .|
Sbjct 1145  A--ATCT------------GGTAA-ACGAACCTG------------------CTTTGT-----TCCCAGCT-TT  1179

Query 1249  GACC-AGCTCAG--TGGGGCCCAGCAATGG-ATGACTAAGTCATTGACAGAAGAGAAAACCATGAAGTCATTCA  1318
            |||| |.|| ||  ||.||..|||.||||| |||||                  |.|.|||.|...|||     
Sbjct 1180  GACCAAACT-AGAATGAGGAGCAGGAATGGCATGAC------------------GTATACCTTCTCGTC-----  1229

Query 1319  GCAAAAAGAAAGGTGAGCAGCCAACAGGCCAGCAGCGGCGGAAACACCAGATCACATATCTTATTCATCAGGCC  1392
                                    |..||..|||.||                                     
Sbjct 1230  ------------------------CCTGCTCGCATCG-------------------------------------  1242

Query 1393  AAGGAGCGGGAGCTGGAACTGAAGAACACCTGGTCAGAGAACAAGCTCAGCCGCCGTCAGACCCAAGCCAAATA  1466
                                                                                      
Sbjct 1243  --------------------------------------------------------------------------  1242

Query 1467  TGGATTC  1473
                   
Sbjct 1243  -------  1242