Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479789
• Subject: XR_921868.3
• Aligned Length: 2137
• Identities: 1473
• Gaps: 664

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGCCATTAGCTGTGTGTAGTTGCCCGGGACTAGGAGCTTAAGTGAAGAGGTACGCCTTGTTCGGTGGAAATCAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCGTAGCCATGAGTTTCTGCCGGGGCTAGCCCTAGAGTACGGAGCAGGCGGACTTTTCGGTTCCCCGCCCCGCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGGTGGCGGGGCCTACTAGGCCTCCGGGCATCCCCGGTCTCAAGTAGGCCTCATCTGCCGGCAAGGGCGCCCGA  222

Query    1  ---------------ATGTCGCTGGTTGCTTACGCCAGCAGCGATGAGAGCGAGCCGGATGAGGCTGAGCCCGA  59
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACGCGGGAGGCGCCATGTCGCTGGTTGCTTACGCCAGCAGCGATGAGAGCGAGCCGGATGAGGCTGAGCCCGA  296

Query   60  GCCGGAGGAAGAGGAGGCGGTGGCTCCTACATCTGGGCCCGCTTTAGGGGGCTTGTTCGCTTCTCTCCCTGCGC  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCGGAGGAAGAGGAGGCGGTGGCTCCTACATCTGGGCCCGCTTTAGGGGGCTTGTTCGCTTCTCTCCCTGCGC  370

Query  134  CCAAGGGTCCGGCCTTGCTGCCTCCGCCCCCTCAGATGCTGGCGCCAGCCTTTCCCCCGCCGCTGTTGCTTCCC  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAAGGGTCCGGCCTTGCTGCCTCCGCCCCCTCAGATGCTGGCGCCAGCCTTTCCCCCGCCGCTGTTGCTTCCC  444

Query  208  CCACCCACCGGAGACCCCAGGCTTCAGCCTCCTCCCCCCTTGCCCTTCGGCCTGGGAGGCTTCCCCCCACCTCC  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCACCCACCGGAGACCCCAGGCTTCAGCCTCCTCCCCCCTTGCCCTTCGGCCTGGGAGGCTTCCCCCCACCTCC  518

Query  282  AGGCGTGAGCCCGGCTGAAGCGGCGGGAGTTGGGGAGGGACTGGGATTGGGGTTGCCCTCGCCCCGAGGCCCTG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGCGTGAGCCCGGCTGAAGCGGCGGGAGTTGGGGAGGGACTGGGATTGGGGTTGCCCTCGCCCCGAGGCCCTG  592

Query  356  GCCTCAATCTGCCCCCTCCAATTGGCGGTGCCGGTCCCCCGCTGGGGCTTCCCAAGCCAAAGAAGAGGAAAGAG  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCTCAATCTGCCCCCTCCAATTGGCGGTGCCGGTCCCCCGCTGGGGCTTCCCAAGCCAAAGAAGAGGAAAGAG  666

Query  430  CCCGTGAAGATCGCGGCGCCGGAGTTGCATAAGGGAGATTCAGATTCTGAGGAAGATGAACCCACAAAGAAGAA  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCGTGAAGATCGCGGCGCCGGAGTTGCATAAGGGAGATTCAGATTCTGAGGAAGATGAACCCACAAAGAAGAA  740

Query  504  AACTATCCTTCAGGGATCCAGTGAGGGGACTGGTTTGTCTGCCTTGCTTCCCCAACCTAAAAACCTGACTGTGA  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AACTATCCTTCAGGGATCCAGTGAGGGGACTGGTTTGTCTGCCTTGCTTCCCCAACCTAAAAACCTGACTGTGA  814

Query  578  AAGAGACTAACAGGTTGCTCCTGCCCCATGCCTTCTCCCGCAAACCCTCGGATGGCTCCCCTGATACTAAGCCC  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGAGACTAACAGGTTGCTCCTGCCCCATGCCTTCTCCCGCAAACCCTCGGATGGCTCCCCTGATACTAAGCCC  888

Query  652  TCCAGACTGGCTTCTAAGACCAAGACTTCCTCTCTTGCCCCTGTTGTGGGCACCACAACCACCACTCCGTCGCC  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCAGACTGGCTTCTAAGACCAAGACTTCCTCTCTTGCCCCTGTTGTGGGCACCACAACCACCACTCCGTCGCC  962

Query  726  CTCTGCTATCAAGGCTGCTGCCAAGAGTGCTGCCCTGCAGGTGACAAAGCAGATCACGCAGGAAGAAGACGACA  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCTGCTATCAAGGCTGCTGCCAAGAGTGCTGCCCTGCAGGTGACAAAGCAGATCACGCAGGAAGAAGACGACA  1036

Query  800  GTGATGAGGAAGTAGCCCCCGAAAACTTTTTCTCCCTCCCTGAAAAGGCTGAGCCACCTGGAGTTGAGCCATAC  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGATGAGGAAGTAGCCCCCGAAAACTTTTTCTCCCTCCCTGAAAAGGCTGAGCCACCTGGAGTTGAGCCATAC  1110

Query  874  CCTTACCCCATCCCCACTGTCCCTGAAGAGCTGCCTCCAGGCACGGAACCAGAGCCGGCTTTCCAGGACGATGC  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTTACCCCATCCCCACTGTCCCTGAAGAGCTGCCTCCAGGCACGGAACCAGAGCCGGCTTTCCAGGACGATGC  1184

Query  948  AGCCAATGCCCCCCTTGAATTCAAGATGGCAGCAGGTTCAAGTGGGGCCCCTTGGATGCCTAAGCCTGGGGACG  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGCCAATGCCCCCCTTGAATTCAAGATGGCAGCAGGTTCAAGTGGGGCCCCTTGGATGCCTAAGCCTGGGGACG  1258

Query 1022  ACTACAGCTACAATCAGTTTTCCACATATGGCGATGCCAATGCCGCTGGTGCTTATTATCA-------------  1082
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 1259  ACTACAGCTACAATCAGTTTTCCACATATGGCGATGCCAATGCCGCTGGTGCTTATTATCAGGGTCTGCAGCAA  1332

Query 1083  ------------------------------------------------------GGATTATTACAGTGGTGGCT  1102
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CATCTGGGCCACTCGCCTCTAAGGGGAATCATGAGATTCCTGAACTCAAAATCTGGATTATTACAGTGGTGGCT  1406

Query 1103  ACTATCCTGCACAGGACCCGGCCCTGGTCCCCCCCCAGGAAATTGCCCCAGATGCCTCCTTCATCGATGACGAA  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACTATCCTGCACAGGACCCGGCCCTGGTCCCCCCCCAGGAAATTGCCCCAGATGCCTCCTTCATCGATGACGAA  1480

Query 1177  GCATTTAAGCGGCTGCAGGGCAAGAGGAACCGAGGGAGAGAAGAAATCAACTTTGTGGAGATCAAAGGTGATGA  1250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCATTTAAGCGGCTGCAGGGCAAGAGGAACCGAGGGAGAGAAGAAATCAACTTTGTGGAGATCAAAGGTGATGA  1554

Query 1251  CCAGCTCAGTGGGGCCCAGCAATGGATGACTAAGTCATTGACAGAAGAGAAAACCATGAAGTCATTCAGCAAAA  1324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCAGCTCAGTGGGGCCCAGCAATGGATGACTAAGTCATTGACAGAAGAGAAAACCATGAAGTCATTCAGCAAAA  1628

Query 1325  AGAAAGGTGAGCAGCCAACAGGCCAGCAGCGGCGGAAACACCAGATCACATATCTTATTCATCAGGCCAAGGAG  1398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGAAAGGTGAGCAGCCAACAGGCCAGCAGCGGCGGAAACACCAGATCACATATCTTATTCATCAGGCCAAGGAG  1702

Query 1399  CGGGAGCTGGAACTGAAGAACACCTGGTCAGAGAACAAGCTCAGCCGCCGTCAGACCCAAGCCAAATATGGATT  1472
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGGGAGCTGGAACTGAAGAACACCTGGTCAGAGAACAAGCTCAGCCGCCGTCAGACCCAAGCCAAATATGGATT  1776

Query 1473  C-------------------------------------------------------------------------  1473
            |                                                                         
Sbjct 1777  CTAGGGCTCTGGAACTGATTGCTCCCAGGATCTCCTGCCAGCCCAGCTGGCCTGGCCCCCAGCTTCACCTCTGG  1850

Query 1474  --------------------------------------------------------------------------  1473
                                                                                      
Sbjct 1851  GACCCCAGCTGCTCTAAGCCCAGGATCTCTTTCCCCAAGGACCCAGCCCTCGCCTCTGCGAGAATGAACATATT  1924

Query 1474  --------------------------------------------------------------------------  1473
                                                                                      
Sbjct 1925  TGATAGATTTTTCTTAACAAGTTAGAAAATTCAGCTCCTTTCTGTCCTGGAGCTAGCAAAGACTTGTGTGATGC  1998

Query 1474  --------------------------------------------------------------------------  1473
                                                                                      
Sbjct 1999  CTCCGAAGGGGCTCTGAGTTCTGGGGTGGGAGTTTTGCTCTCTGTCAGGTGTGATAAAATGTTGAACCCTCCCC  2072

Query 1474  -----------------------------------------------------------------  1473
                                                                             
Sbjct 2073  ACCACCACTTTTTTTTTTTTAAACCAGGGATGTCTGTTGAAATAAAACATTCAGTCTGACAAACA  2137