Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479864
• Subject: NM_001301866.1
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1012
• Gaps: 270

Alignment

Query    1  ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA  74
            |||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA  74

Query   75  TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG  148
            |||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct   75  TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG  148

Query  149  ACAGAGTCGTGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT  222
            |                                                                         
Sbjct  149  A-------------------------------------------------------------------------  149

Query  223  GGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA  296
                                                                                      
Sbjct  150  --------------------------------------------------------------------------  149

Query  297  AGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA  370
                                    |.|||||||                                         
Sbjct  150  ------------------------TCGAGGCAT-----------------------------------------  158

Query  371  TCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAAT  444
                                                             .||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  159  -------------------------------------------------GGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAAC  183

Query  445  CAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTT  518
            |||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  184  CAGTGTGGGGCCTCCTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTT  257

Query  519  CAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCA  592
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  258  CAAATGCCATCTTTGCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCA  331

Query  593  TTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTG  666
            ||||.|||||||||||.||||..||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.|||
Sbjct  332  TTAAGGAAGAAACTAACCACAACGAGATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGAGCAGAGAGGTCCCTTGTCCTG  405

Query  667  GACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTC  740
            |||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct  406  GACAGGCTGGCAAGCAATGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGAGACAAGTGCCTGTC  479

Query  741  CGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAG  814
            .||||.||||||.||   |||.||||.|||.|||||||||   ||.|||||||..|||||||||||||||||.|
Sbjct  480  AGACATGCCCTATGA---CAGTGCCAACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGG  547

Query  815  CCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCC  888
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||
Sbjct  548  CCATCAACAATGCCATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCC  621

Query  889  GAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCA  962
            ||||||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||
Sbjct  622  GAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCATGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCA  695

Query  963  CTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGG  1036
            .||.||.|||||   |||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||||||.||||
Sbjct  696  TTCAGCACAGGA---CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGG  766

Query 1037  CGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATC  1110
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  767  CCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATC  840

Query 1111  TACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCT  1184
            |||||.||||||||||||..||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|
Sbjct  841  TACCTAACCAACCACATCAACCCGCATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGT  914

Query 1185  GCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGT  1258
            ||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.|||||||||
Sbjct  915  GCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGT  988

Query 1259  ACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTC  1332
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  989  ACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTT  1062

Query 1333  CGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCG  1406
            ||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1063  CGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGTGTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCG  1136

Query 1407  AGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC  1431
            .||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1137  GGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC  1161