Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479864
- Subject:
- XM_011243705.1
- Aligned Length:
- 1662
- Identities:
- 1266
- Gaps:
- 240
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACAT 26
|||||||..|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGAGCCAGCCACAGGCCTGCAAAGCAGGAGATAACCTGAAGACAATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACAT 74
Query 27 GTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGATGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCC 100
|||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|||
Sbjct 75 GTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGATGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCC 148
Query 101 CCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTGACAGAGTCGTGG-------------- 160
|.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.||||||||||||..|||.|.|||
Sbjct 149 CTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTGATCGAGGCATGGTTGCATATGGGGCT 222
Query 161 ----------------------------------------------CCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAG 188
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GATGGCTTTAGGGATTTTCATGCAATAATTCCCAAATCTTTCTCTCCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAG 296
Query 189 TGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCT 262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGCAGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCT 370
Query 263 CGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTT 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTT 444
Query 337 CCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAG 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCGTTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAG 518
Query 411 AAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCC 484
|||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 519 AAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAACCAGTGTGGGGCCTCCTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGC 592
Query 485 GGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGAC 558
||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTTCAAATGCCATCTTTGCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGAC 666
Query 559 GCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCC-------------------------------------------- 588
||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTTGGTAAGCCTCACAAATGTGGATATTGTGGCCGGAGCTATAA 740
Query 589 -------------------------------------------------------------------------- 588
Sbjct 741 ACAGCGAAGCTCTTTAGAGGAGCATAAAGAGCGATGCCACAACTACTTGGAAAGCATGGGCCTTCCGGGCATGT 814
Query 589 -----GTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCT 657
||||||||.|||||||||||.||||..||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct 815 ACCCAGTCATTAAGGAAGAAACTAACCACAACGAGATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGAGCAGAGAGGTCC 888
Query 658 CTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAA 731
||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 CTTGTCCTGGACAGGCTGGCAAGCAATGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGAGACAA 962
Query 732 GGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGA 805
|.|||||||.||||.||||||.|| |||.||||.|||.||||||||| ||.|||||||..||||||||||
Sbjct 963 GTGCCTGTCAGACATGCCCTATGA---CAGTGCCAACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGA 1030
Query 806 TGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCG 879
|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.
Sbjct 1031 TGGACCAGGCCATCAACAATGCCATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCC 1104
Query 880 GGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCG 953
||..|.|||||||||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||
Sbjct 1105 GGTAGCTCCGAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCATGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACG 1178
Query 954 CTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGG 1027
.||||||||.||.||.||||| |||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||
Sbjct 1179 GTCCAACCATTCAGCACAGGA---CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGG 1249
Query 1028 AGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGC 1101
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||
Sbjct 1250 AGCGAGAGGCCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGC 1323
Query 1102 GGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGC 1175
||.||.||||||||.||||||||||||..||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1324 GGCCTTATCTACCTAACCAACCACATCAACCCGCATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGC 1397
Query 1176 CTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGA 1249
||||||..|||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.
Sbjct 1398 CTACGAGGTGCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGC 1471
Query 1250 TGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGC 1323
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1472 TGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGC 1545
Query 1324 CACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCA 1397
||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||
Sbjct 1546 CATGGCTTTCGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGTGTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCA 1619
Query 1398 CATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC 1431
.||.|||||.||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1620 TATCACGCGGGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC 1653