Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479864
• Subject: XM_011243712.2
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1266
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA  74
            |||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA  74

Query   75  TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG  148
            |||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct   75  TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG  148

Query  149  ACAGAGTCGTGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT  222
            |..|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCGAGGCATGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT  222

Query  223  GGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA  296
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGAAGAATGTGCAGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA  296

Query  297  AGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA  370
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGCAGCTCGGCTTTGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA  370

Query  371  TCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAAT  444
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  371  TCGTTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAAC  444

Query  445  CAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTT  518
            |||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  445  CAGTGTGGGGCCTCCTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTT  518

Query  519  CAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCA  592
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAATGCCATCTTTGCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCA  592

Query  593  TTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTG  666
            ||||.|||||||||||.||||..||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.|||
Sbjct  593  TTAAGGAAGAAACTAACCACAACGAGATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGAGCAGAGAGGTCCCTTGTCCTG  666

Query  667  GACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTC  740
            |||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct  667  GACAGGCTGGCAAGCAATGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGAGACAAGTGCCTGTC  740

Query  741  CGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAG  814
            .||||.||||||.||   |||.||||.|||.|||||||||   ||.|||||||..|||||||||||||||||.|
Sbjct  741  AGACATGCCCTATGA---CAGTGCCAACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGG  808

Query  815  CCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCC  888
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||
Sbjct  809  CCATCAACAATGCCATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCC  882

Query  889  GAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCA  962
            ||||||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||
Sbjct  883  GAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCATGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCA  956

Query  963  CTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGG  1036
            .||.||.|||||   |||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||||||.||||
Sbjct  957  TTCAGCACAGGA---CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGG  1027

Query 1037  CGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATC  1110
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1028  CCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATC  1101

Query 1111  TACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCT  1184
            |||||.||||||||||||..||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|
Sbjct 1102  TACCTAACCAACCACATCAACCCGCATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGT  1175

Query 1185  GCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGT  1258
            ||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.|||||||||
Sbjct 1176  GCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGT  1249

Query 1259  ACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTC  1332
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1250  ACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTT  1323

Query 1333  CGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCG  1406
            ||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1324  CGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGTGTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCG  1397

Query 1407  AGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC  1431
            .||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1398  GGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC  1422