Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479864
- Subject:
- XM_011243713.2
- Aligned Length:
- 1491
- Identities:
- 1145
- Gaps:
- 204
Alignment
Query 1 ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA 74
|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA 74
Query 75 TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG 148
|||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct 75 TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG 148
Query 149 ACAGAGTCGTGG------------------------------------------------------------CC 162
|..|||.|.||| ||
Sbjct 149 ATCGAGGCATGGTTGCATATGGGGCTGATGGCTTTAGGGATTTTCATGCAATAATTCCCAAATCTTTCTCTCCC 222
Query 163 AGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGC 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGC 296
Query 237 GGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTT 310
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTT 370
Query 311 TGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGG 384
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 371 TGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCGTTTGCATCGGG 444
Query 385 CCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTC 458
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 445 CCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAACCAGTGTGGGGCCTC 518
Query 459 ATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCT 532
.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 519 CTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTTCAAATGCCATCTTT 592
Query 533 GCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCATTAAAGAAGAAACT 606
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCC------------------ 648
Query 607 AATCACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAG 680
Sbjct 649 -------------------------------------------------------------------------- 648
Query 681 TAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACG 754
||.||||||.|||||||.||||.||||||.|
Sbjct 649 -------------------------------------------GGAGACAAGTGCCTGTCAGACATGCCCTATG 679
Query 755 ACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCC 828
| |||.||||.|||.||||||||| ||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 680 A---CAGTGCCAACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGGCCATCAACAATGCC 747
Query 829 ATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGT 902
|||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||||||||||.||.||
Sbjct 748 ATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCCGAGGTGGTGCCAGT 821
Query 903 CATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACA 976
|||||||.|.||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 822 CATCAGCTCCATGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCATTCAGCACAGGA-- 893
Query 977 GCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAAC 1050
|||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 894 -CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGGCCTCCCCGAGCAAC 966
Query 1051 AGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCA 1124
|||||||||||||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 967 AGCTGCCAAGACTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATCTACCTAACCAACCA 1040
Query 1125 CATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCT 1198
||||..||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|||||.|.||.||||
Sbjct 1041 CATCAACCCGCATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGTGCTGAGGGCGGCCT 1114
Query 1199 CCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACAC 1272
|.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 CAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGTACAAGTGCGAACAC 1188
Query 1273 TGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGA 1346
|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1189 TGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTTCGGGATCCCTTTGA 1262
Query 1347 GTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCT 1420
|||.||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1263 GTGTAACATGTGTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCGGGGGGAGCATCGTT 1336
Query 1421 TCCACATGAGC 1431
.||||.|||||
Sbjct 1337 ACCACCTGAGC 1347