Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479864
• Subject: XM_011243714.2
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1145
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA  74
            |||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA  74

Query   75  TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG  148
            |||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct   75  TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG  148

Query  149  ACAGAGTCGTGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT  222
            |..|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCGAGGCATGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT  222

Query  223  GGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA  296
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGAAGAATGTGCAGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA  296

Query  297  AGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA  370
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGCAGCTCGGCTTTGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA  370

Query  371  TCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAAT  444
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  371  TCGTTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAAC  444

Query  445  CAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTT  518
            |||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  445  CAGTGTGGGGCCTCCTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTT  518

Query  519  CAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCA  592
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||    
Sbjct  519  CAAATGCCATCTTTGCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCC----  588

Query  593  TTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTG  666
                                                                                      
Sbjct  589  --------------------------------------------------------------------------  588

Query  667  GACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTC  740
                                                                     ||.||||||.|||||||
Sbjct  589  ---------------------------------------------------------GGAGACAAGTGCCTGTC  605

Query  741  CGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAG  814
            .||||.||||||.||   |||.||||.|||.|||||||||   ||.|||||||..|||||||||||||||||.|
Sbjct  606  AGACATGCCCTATGA---CAGTGCCAACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGG  673

Query  815  CCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCC  888
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||
Sbjct  674  CCATCAACAATGCCATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCC  747

Query  889  GAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCA  962
            ||||||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||
Sbjct  748  GAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCATGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCA  821

Query  963  CTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGG  1036
            .||.||.|||||   |||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||||||.||||
Sbjct  822  TTCAGCACAGGA---CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGG  892

Query 1037  CGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATC  1110
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  893  CCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATC  966

Query 1111  TACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCT  1184
            |||||.||||||||||||..||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|
Sbjct  967  TACCTAACCAACCACATCAACCCGCATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGT  1040

Query 1185  GCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGT  1258
            ||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.|||||||||
Sbjct 1041  GCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGT  1114

Query 1259  ACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTC  1332
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1115  ACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTT  1188

Query 1333  CGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCG  1406
            ||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1189  CGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGTGTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCG  1262

Query 1407  AGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC  1431
            .||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1263  GGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC  1287