Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000479864
- Subject:
- XM_011515059.3
- Aligned Length:
- 1689
- Identities:
- 1401
- Gaps:
- 288
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
||
Sbjct 1 ATGGAAGGCGCCATCCTAACTTCTGCCGTGAGCAGGTGGGAGGGAAGAGAGACGAGAGATAACCTGAGGACCAT 74
Query 3 GGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGATG 76
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGATG 148
Query 77 AGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTGAC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTGAC 222
Query 151 AGAGTCGTGG------------------------------------------------------------CCAG 164
|||||||||| ||||
Sbjct 223 AGAGTCGTGGTTACATATGGGGCTGATGACTTTAGGGATTTCCATGCAATAATTCCCAAATCTTTCTCTCCCAG 296
Query 165 TAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGCGG 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGCGG 370
Query 239 AGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTG 312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTG 444
Query 313 TCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGGCC 386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGGCC 518
Query 387 CAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTCAT 460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTCAT 592
Query 461 TCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCTGC 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCTGC 666
Query 535 AACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCC-------------------- 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTTGGTAAACCTCACAAATG 740
Query 589 -------------------------------------------------------------------------- 588
Sbjct 741 TGGATATTGTGGCCGAAGCTATAAACAGCGAAGCTCTTTAGAGGAACATAAAGAGCGCTGCCACAACTACTTGG 814
Query 589 --------------------------------GTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGAC 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAAGCATGGGCCTTCCGGGCACACTGTACCCAGTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGAC 888
Query 631 CTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTC 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAAC---------- 952
Query 705 TATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGG 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 --------------------GGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGG 1006
Query 779 AGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCC 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007 AGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCC 1080
Query 853 CTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCA 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCA 1154
Query 927 CAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 CAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGC 1228
Query 1001 TCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACC 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229 TCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACC 1302
Query 1075 GAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGG 1148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 GAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGG 1376
Query 1149 GCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCC 1222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 GCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCC 1450
Query 1223 GCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCAC 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451 GCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCAC 1524
Query 1297 GTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAG 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525 GTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAG 1598
Query 1371 CCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC 1431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599 CCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC 1659