Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479885
• Subject: NM_011935.3
• Aligned Length: 1395
• Identities: 1216
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGTC  5
                                                                                 |||||
Sbjct    1  ATGGATTCGGTAGAACTTTGCCTGCCTGAATCTTTTTCCCTGCACTACGAAGAAGAGCTTCTCTGCAGAATGTC  74

Query    6  AAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGA  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCCTCCAGCCCAGCCTCCCTGA  148

Query   80  CGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGC  153
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGGTCTTCCGACGCCAGTGGGAGTTACAGTTCAACCATGAATGGC  222

Query  154  CATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAA  227
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.||||
Sbjct  223  CATCAGAACGGACTGGACTCGCCACCTCTCTACCCCTCTGCTCCGATCCTGGGAGGCAGCGGGCCTGTCCGGAA  296

Query  228  ACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGC  301
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  297  ACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATCGTAGAGGATCCCCAGACCAAGTGTGAATATATGCTCAACTCCATGC  370

Query  302  CCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGC  375
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAAGAGACTGTGCTTAGTGTGTGGCGACATCGCCTCTGGGTACCACTATGGGGTTGCATCATGTGAAGCCTGC  444

Query  376  AAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCAC  449
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  AAGGCATTCTTCAAGAGGACGATTCAAGGTAACATAGAGTACAGCTGCCCAGCCACGAATGAATGTGAGATCAC  518

Query  450  AAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGG  523
            ||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAGCGCAGACGCAAATCCTGCCAGGCCTGCCGCTTCATGAAGTGTCTCAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGG  592

Query  524  TGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTG  597
            |.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCGTCTTGACAGAGTGCGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGAATAGATGCTGAGAACAGCCCATACCTG  666

Query  598  AACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCTCTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTCTCACA  671
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||.||
Sbjct  667  AACCCTCAGCTGGTGCAGCCAGCCAAAAAGCCAT---------------------ATAACAAGATTGTCTCGCA  719

Query  672  TTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCC  745
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  TTTGTTGGTGGCTGAACCAGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCC  793

Query  746  TCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTC  819
            ||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  794  TCACCACACTCTGTGACTTGGCTGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCAAAACATATTCCAGGCTTC  867

Query  820  TCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGT  893
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.||.||.||
Sbjct  868  TCCACACTGTCCCTGGCAGACCAGATGAGCCTCCTCCAGAGTGCATGGATGGAGATTCTGATCCTCGGCGTTGT  941

Query  894  ATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAAT  967
            .|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  942  GTACCGATCGCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGATGAAGACCAGTCTAAAT  1015

Query  968  TAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAA  1041
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1016  TAGCAGGCCTTCTTGACCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTGAAGAAGTACAAGAGCATGAAGCTAGAGAAG  1089

Query 1042  GAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGT  1115
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1090  GAAGAATTCGTCACCCTCAAAGCAATAGCTCTTGCTAATTCAGATTCCATGCATATAGAAGATGTGGAAGCTGT  1163

Query 1116  TCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTC  1189
            .|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1164  GCAGAAACTTCAGGATGTGTTACATGAGGCCCTGCAGGATTACGAGGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGCC  1237

Query 1190  GAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAAC  1263
            |.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1238  GTGCAGGCAAGATGCTGATGACGCTGCCGCTGCTGAGGCAGACCTCCACCAAGGCAGTCCAGCACTTCTACAAC  1311

Query 1264  ATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC  1326
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1312  ATCAAACTCGAAGGCAAAGTGCCCATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGCTGGAGGCCAAGGTC  1374