Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000479907
• Subject: NM_003645.4
• Aligned Length: 1860
• Identities: 1701
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGCTTTCCGCCATCTACACAGTCCTGGCGGGACTGCTGTTCCTGCCGCTCCTGGTGAACCTCTGCTGCCCATA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTTTCCGCCATCTACACAGTCCTGGCGGGACTGCTGTTCCTGCCGCTCCTGGTGAACCTCTGCTGCCCATA  74

Query   75  CTTCTTCCAGGACATAGGCTACTTCTTGAAGGTGGCCGCCGTGGGCCGGAGGGTGCGCAGCTACGGGAAGCGGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTCTTCCAGGACATAGGCTACTTCTTGAAGGTGGCCGCCGTGGGCCGGAGGGTGCGCAGCTACGGGAAGCGGC  148

Query  149  GGCCGGCGCGCACCATCCTGCGGGCGTTCCTGGAGAAAGCGCGCCAGACGCCACACAAGCCTTTTCTGCTCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCGGCGCGCACCATCCTGCGGGCGTTCCTGGAGAAAGCGCGCCAGACGCCACACAAGCCTTTTCTGCTCTTC  222

Query  223  CGCGACGAGACTCTCACCTACGCGCAGGTGGACCGGCGCAGCAATCAAGTGGCCCGGGCGCTGCACGACCACCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGCGACGAGACTCTCACCTACGCGCAGGTGGACCGGCGCAGCAATCAAGTGGCCCGGGCGCTGCACGACCACCT  296

Query  297  CGGCCTGCGCCAGGGAGACTGCGTGGCGCTCCTTATGGGTAACGAGCCGGCCTACGTGTGGCTGTGGCTGGGGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGCCTGCGCCAGGGAGACTGCGTGGCGCTCCTTATGGGTAACGAGCCGGCCTACGTGTGGCTGTGGCTGGGGC  370

Query  371  TGGTGAAGCTGGGCTGTGCCATGGCGTGCCTCAATTACAACATCCGCGCGAAGTCCCTGCTGCACTGCTTCCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGTGAAGCTGGGCTGTGCCATGGCGTGCCTCAATTACAACATCCGCGCGAAGTCCCTGCTGCACTGCTTCCAG  444

Query  445  TGCTGCGGGGCGAAGGTGCTGCTGGTGTCGCCAGAACTACAAGCAGCTGTCGAAGAGATACTGCCAAGCCTTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCTGCGGGGCGAAGGTGCTGCTGGTGTCGCCAGAACTACAAGCAGCTGTCGAAGAGATACTGCCAAGCCTTAA  518

Query  519  AAAAGATGATGTGTCCATCTATTATGTGAGCAGAACTTCTAACACAGATGGGATTGACTCTTTCCTGGACAAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAAGATGATGTGTCCATCTATTATGTGAGCAGAACTTCTAACACAGATGGGATTGACTCTTTCCTGGACAAAG  592

Query  593  TGGATGAAGTATCAACTGAACCTATCCCAGAGTCATGGAGGTCTGAAGTCACTTTTTCCACTCCTGCCTTATAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGATGAAGTATCAACTGAACCTATCCCAGAGTCATGGAGGTCTGAAGTCACTTTTTCCACTCCTGCCTTATAC  666

Query  667  ATTTATACTTCTGGAACCACA-----------------------------------------------------  687
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct  667  ATTTATACTTCTGGAACCACAGGTCTTCCAAAAGCAGCCATGATCACTCATCAGCGCATATGGTATGGAACTGG  740

Query  688  --------------------------------------------------------------------------  687
                                                                                      
Sbjct  741  CCTCACTTTTGTAAGCGGATTGAAGGCAGATGATGTCATCTATATCACTCTGCCCTTTTACCACAGTGCTGCAC  814

Query  688  --------------------------------GGTGCTACTCTTGCCTTGCGGACTAAATTTTCAGCCAGCCAG  729
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TACTGATTGGCATTCACGGATGTATTGTGGCTGGTGCTACTCTTGCCTTGCGGACTAAATTTTCAGCCAGCCAG  888

Query  730  TTTTGGGATGACTGCAGAAAATACAACGTCACTGTCATTCAGTATATCGGTGAACTGCTTCGGTATTTATGCAA  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTTGGGATGACTGCAGAAAATACAACGTCACTGTCATTCAGTATATCGGTGAACTGCTTCGGTATTTATGCAA  962

Query  804  CTCACCACAGAAACCAAATGACCGTGATCATAAAGTGAGACTGGCACTGGGAAATGGCTTACGAGGAGATGTGT  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCACCACAGAAACCAAATGACCGTGATCATAAAGTGAGACTGGCACTGGGAAATGGCTTACGAGGAGATGTGT  1036

Query  878  GGAGACAATTTGTCAAGAGATTTGGGGACATATGCATCTATGAGTTCTATGCTGCCACTGAAGGCAATATTGGA  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAGACAATTTGTCAAGAGATTTGGGGACATATGCATCTATGAGTTCTATGCTGCCACTGAAGGCAATATTGGA  1110

Query  952  TTTATGAATTATGCGAGAAAAGTTGGTGCTGTTGGAAGAGTAAACTACCTACAGAAAAAAATCATAACTTATGA  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTATGAATTATGCGAGAAAAGTTGGTGCTGTTGGAAGAGTAAACTACCTACAGAAAAAAATCATAACTTATGA  1184

Query 1026  CCTGATTAAATATGATGTGGAGAAAGATGAACCTGTCCGTGATGAAAATGGATATTGCGTCAGAGTTCCCAAAG  1099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGATTAAATATGATGTGGAGAAAGATGAACCTGTCCGTGATGAAAATGGATATTGCGTCAGAGTTCCCAAAG  1258

Query 1100  GTGAAGTTGGACTTCTGGTTTGCAAAATCACACAACTTACACCATTTAATGGCTATGCTGGAGCAAAGGCTCAG  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGAAGTTGGACTTCTGGTTTGCAAAATCACACAACTTACACCATTTAATGGCTATGCTGGAGCAAAGGCTCAG  1332

Query 1174  ACAGAGAAGAAAAAACTGAGAGATGTCTTTAAGAAAGGAGACCTCTATTTCAACAGTGGAGATCTCTTAATGGT  1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACAGAGAAGAAAAAACTGAGAGATGTCTTTAAGAAAGGAGACCTCTATTTCAACAGTGGAGATCTCTTAATGGT  1406

Query 1248  TGACCATGAAAATTTCATCTATTTCCACGACAGAGTTGGAGATACATTCCGGTGGAAAGGGGAAAATGTGGCCA  1321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGACCATGAAAATTTCATCTATTTCCACGACAGAGTTGGAGATACATTCCGGTGGAAAGGGGAAAATGTGGCCA  1480

Query 1322  CCACTGAAGTTGCTGATACAGTTGGACTGGTTGATTTTGTCCAAGAAGTAAATGTTTATGGAGTGCATGTGCCA  1395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCACTGAAGTTGCTGATACAGTTGGACTGGTTGATTTTGTCCAAGAAGTAAATGTTTATGGAGTGCATGTGCCA  1554

Query 1396  GATCATGAGGGTCGCATTGGCATGGCCTCCATCAAAATGAAAGAAAACCATGAATTTGATGGAAAGAAACTCTT  1469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GATCATGAGGGTCGCATTGGCATGGCCTCCATCAAAATGAAAGAAAACCATGAATTTGATGGAAAGAAACTCTT  1628

Query 1470  TCAGCACATTGCTGATTACCTACCTAGTTATGCAAGGCCCCGGTTTCTAAGAATACAGGACACCATTGAGATCA  1543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCAGCACATTGCTGATTACCTACCTAGTTATGCAAGGCCCCGGTTTCTAAGAATACAGGACACCATTGAGATCA  1702

Query 1544  CTGGAACTTTTAAACACCGCAAAATGACCCTGGTGGAGGAGGGCTTTAACCCTGCTGTCATCAAAGATGCCTTG  1617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGGAACTTTTAAACACCGCAAAATGACCCTGGTGGAGGAGGGCTTTAACCCTGCTGTCATCAAAGATGCCTTG  1776

Query 1618  TATTTCTTGGATGACACAGCAAAAATGTATGTGCCTATGACTGAGGACATCTATAATGCCATAAGTGCTAAAAC  1691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TATTTCTTGGATGACACAGCAAAAATGTATGTGCCTATGACTGAGGACATCTATAATGCCATAAGTGCTAAAAC  1850

Query 1692  CCTGAAACTC  1701
            ||||||||||
Sbjct 1851  CCTGAAACTC  1860