Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480061
• Subject: NM_001166503.1
• Aligned Length: 1041
• Identities: 879
• Gaps: 51

Alignment

Query    1  ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG  74
            |||||||||||..|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGCTCCAAGGTTACAGCTCCGTGGTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGCAATGACAGCAGCCGG  74

Query   75  GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG  148
            ||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct   75  GGCAGCTCTCGTGTTCATATTCTCCAGCGGGCAGAGGCGGATCTTAGACGGAAGCCTGGGCTTTGCCGCAGGGG  148

Query  149  TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT  222
            |||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  149  TCATGTTAGCGGCTTCCTACTGGTCGCTGCTTGCACCAGCGGTGGAGATGGCGACATCCTCGGGGGGCTTCGGA  222

Query  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT  296
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCAGTGGCTGTTGGCTTCACCCTGGGGGCCGCCTTTGTCTACCTGGCTGACCTCCTGAT  296

Query  297  GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGGCCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA  370
            |||||||.|||||||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|.|.||.|.|||||   |||||
Sbjct  297  GCCTCACCTGGGTGCTACAGAAGACCCCCAGACAGCCCTGGCGCTGAACTTGGACCCTGCATTGAT---GAAGA  367

Query  371  AGTCTGATCCTGAGGGTCCC----GCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGAT------------  428
            |||||||||| .||||.|||    .|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||            
Sbjct  368  AGTCTGATCC-CAGGGACCCCACTTCGCTGCTCTTCCCGGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGGTAGCACTGG  440

Query  429  ---------AGACAAGAGTGAGAATGGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGG  493
                     |||||||.||||||||||.||||.|||.|||||.|||||||.||||||.||||.|||..||||||
Sbjct  441  GCTTCTTTCAGACAAGCGTGAGAATGGCGAGGTATACCAGAGGAAGAAGGTGGCAGCTACTGACCTCGCAGAGG  514

Query  494  GTCCTGC-TGTCCCTGTGCCTTC----TCGA-----GGGA-ATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGA  556
                 || ||.||     ||.||    ||||     |||| .||.|| .|||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct  515  -----GCGTGGCC-----CCCTCAGGATCGATGCACGGGAGCTCAGG-GCAGCCTGGGGGGAGCAGCTGGAGGA  577

Query  557  GGATCGCACTGCTCATCTTGGCCATCACTATACACAACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGG  630
            ||||.||..||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct  578  GGATTGCTTTGCTCATCCTGGCCATCACCATACACAACATTCCAGAGGGTCTTGCTGTTGGCGTAGGATTTGGA  651

Query  631  GCTATAGAAAAGACGGCATCTGCTACCTTTGAGAGTGCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTT  704
            ||..||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  652  GCAGTAGAAAAGACTGCATCTGCCACCTTCGAGAGTGCCAGGAATCTGGCCATTGGAATTGGGATCCAGAATTT  725

Query  705  CCCCGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCCTTGCGAGGGGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGC  778
            |||.|||||||||||||||||||||||..||||.||.|||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct  726  CCCAGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCTCTGCGTGGAGCAGGCTTCTCTACCTGGAAAGCTTTCTGGTATGGAC  799

Query  779  AGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCCCTGGCCGGGGTCTTTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTG  852
            |||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  800  AGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCCTTGGCTGGGGTCTTTGGAGCATTTGCGGTGGTACTGGCTGAGCCCATCCTG  873

Query  853  CCCTACGCTCTGGCCTTTGCTGCCGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGAT  926
            |||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  874  CCCTATGCACTGGCCTTTGCTGCTGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGATGACATCATCCCCGAGGCCCAGAT  947

Query  927  CAGTGGTAATGGGAAACTGGCATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCC  1000
            ||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||
Sbjct  948  CAGTGGCAACGGGAAGCTGGCATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTGGTGATGATGTCCCTTGATGTGGGCC  1021

Query 1001  TGGGC  1005
            |.|||
Sbjct 1022  TCGGC  1026