Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480061
- Subject:
- NM_027216.5
- Aligned Length:
- 1020
- Identities:
- 879
- Gaps:
- 30
Alignment
Query 1 ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG 74
|||||||||||..|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||
Sbjct 1 ATGCTCCAAGGTTACAGCTCCGTGGTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGCAATGACAGCAGCCGG 74
Query 75 GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG 148
||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 75 GGCAGCTCTCGTGTTCATATTCTCCAGCGGGCAGAGGCGGATCTTAGACGGAAGCCTGGGCTTTGCCGCAGGGG 148
Query 149 TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT 222
|||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 149 TCATGTTAGCGGCTTCCTACTGGTCGCTGCTTGCACCAGCGGTGGAGATGGCGACATCCTCGGGGGGCTTCGGA 222
Query 223 GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT 296
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCTTTGCCTTCTTCCCAGTGGCTGTTGGCTTCACCCTGGGGGCCGCCTTTGTCTACCTGGCTGACCTCCTGAT 296
Query 297 GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGGCCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA 370
|||||||.|||||||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|.|.||.|.||||| |||||
Sbjct 297 GCCTCACCTGGGTGCTACAGAAGACCCCCAGACAGCCCTGGCGCTGAACTTGGACCCTGCATTGAT---GAAGA 367
Query 371 AGTCTGATCCTGAGGGTCCC----GCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGACAAGAGTGA 440
|||||||||| .||||.||| .|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 368 AGTCTGATCC-CAGGGACCCCACTTCGCTGCTCTTCCCGGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGACAAGCGTGA 440
Query 441 GAATGGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGGGTCCTGC-TGTCCCTGTGCCT 513
||||||.||||.|||.|||||.|||||||.||||||.||||.|||..|||||| || ||.|| ||.
Sbjct 441 GAATGGCGAGGTATACCAGAGGAAGAAGGTGGCAGCTACTGACCTCGCAGAGG-----GCGTGGCC-----CCC 504
Query 514 TC----TCGA-----GGGA-ATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGAGGATCGCACTGCTCATCTTGG 577
|| |||| |||| .||.|| .|||||.||.||.|||||||||||||||||.||..||||||||.|||
Sbjct 505 TCAGGATCGATGCACGGGAGCTCAGG-GCAGCCTGGGGGGAGCAGCTGGAGGAGGATTGCTTTGCTCATCCTGG 577
Query 578 CCATCACTATACACAACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGCTATAGAAAAGACGGCATCT 651
|||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||..||||||||||.||||||
Sbjct 578 CCATCACCATACACAACATTCCAGAGGGTCTTGCTGTTGGCGTAGGATTTGGAGCAGTAGAAAAGACTGCATCT 651
Query 652 GCTACCTTTGAGAGTGCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAGGGCCTGGCTGTCAG 725
||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 652 GCCACCTTCGAGAGTGCCAGGAATCTGGCCATTGGAATTGGGATCCAGAATTTCCCAGAGGGCCTGGCTGTCAG 725
Query 726 CCTTCCCTTGCGAGGGGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCATGGTGGAGC 799
||||||..||||.||.|||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 726 CCTTCCTCTGCGTGGAGCAGGCTTCTCTACCTGGAAAGCTTTCTGGTATGGACAGCTGAGCGGCATGGTGGAGC 799
Query 800 CCCTGGCCGGGGTCTTTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCCTTTGCT 873
||.||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 800 CCTTGGCTGGGGTCTTTGGAGCATTTGCGGTGGTACTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTATGCACTGGCCTTTGCT 873
Query 874 GCCGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCAGTGGTAATGGGAAACTGGC 947
||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 874 GCTGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGATGACATCATCCCCGAGGCCCAGATCAGTGGCAACGGGAAGCTGGC 947
Query 948 ATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTGGGC 1005
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 948 ATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTGGTGATGATGTCCCTTGATGTGGGCCTCGGC 1005