Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480061
- Subject:
- XM_006534127.3
- Aligned Length:
- 1041
- Identities:
- 879
- Gaps:
- 51
Alignment
Query 1 ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG 74
|||||||||||..|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||
Sbjct 1 ATGCTCCAAGGTTACAGCTCCGTGGTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGCAATGACAGCAGCCGG 74
Query 75 GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG 148
||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 75 GGCAGCTCTCGTGTTCATATTCTCCAGCGGGCAGAGGCGGATCTTAGACGGAAGCCTGGGCTTTGCCGCAGGGG 148
Query 149 TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT 222
|||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 149 TCATGTTAGCGGCTTCCTACTGGTCGCTGCTTGCACCAGCGGTGGAGATGGCGACATCCTCGGGGGGCTTCGGA 222
Query 223 GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT 296
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCTTTGCCTTCTTCCCAGTGGCTGTTGGCTTCACCCTGGGGGCCGCCTTTGTCTACCTGGCTGACCTCCTGAT 296
Query 297 GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGGCCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA 370
|||||||.|||||||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|.|.||.|.||||| |||||
Sbjct 297 GCCTCACCTGGGTGCTACAGAAGACCCCCAGACAGCCCTGGCGCTGAACTTGGACCCTGCATTGAT---GAAGA 367
Query 371 AGTCTGATCCTGAGGGTCCC----GCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGAT------------ 428
|||||||||| .||||.||| .|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 AGTCTGATCC-CAGGGACCCCACTTCGCTGCTCTTCCCGGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGGTAGCACTGG 440
Query 429 ---------AGACAAGAGTGAGAATGGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGG 493
|||||||.||||||||||.||||.|||.|||||.|||||||.||||||.||||.|||..||||||
Sbjct 441 GCTTCTTTCAGACAAGCGTGAGAATGGCGAGGTATACCAGAGGAAGAAGGTGGCAGCTACTGACCTCGCAGAGG 514
Query 494 GTCCTGC-TGTCCCTGTGCCTTC----TCGA-----GGGA-ATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGA 556
|| ||.|| ||.|| |||| |||| .||.|| .|||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 515 -----GCGTGGCC-----CCCTCAGGATCGATGCACGGGAGCTCAGG-GCAGCCTGGGGGGAGCAGCTGGAGGA 577
Query 557 GGATCGCACTGCTCATCTTGGCCATCACTATACACAACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGG 630
||||.||..||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 578 GGATTGCTTTGCTCATCCTGGCCATCACCATACACAACATTCCAGAGGGTCTTGCTGTTGGCGTAGGATTTGGA 651
Query 631 GCTATAGAAAAGACGGCATCTGCTACCTTTGAGAGTGCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTT 704
||..||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 652 GCAGTAGAAAAGACTGCATCTGCCACCTTCGAGAGTGCCAGGAATCTGGCCATTGGAATTGGGATCCAGAATTT 725
Query 705 CCCCGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCCTTGCGAGGGGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGC 778
|||.|||||||||||||||||||||||..||||.||.|||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 726 CCCAGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCTCTGCGTGGAGCAGGCTTCTCTACCTGGAAAGCTTTCTGGTATGGAC 799
Query 779 AGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCCCTGGCCGGGGTCTTTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTG 852
|||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 800 AGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCCTTGGCTGGGGTCTTTGGAGCATTTGCGGTGGTACTGGCTGAGCCCATCCTG 873
Query 853 CCCTACGCTCTGGCCTTTGCTGCCGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGAT 926
|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 874 CCCTATGCACTGGCCTTTGCTGCTGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGATGACATCATCCCCGAGGCCCAGAT 947
Query 927 CAGTGGTAATGGGAAACTGGCATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCC 1000
||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||
Sbjct 948 CAGTGGCAACGGGAAGCTGGCATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTGGTGATGATGTCCCTTGATGTGGGCC 1021
Query 1001 TGGGC 1005
|.|||
Sbjct 1022 TCGGC 1026