Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480061
• Subject: XM_011249230.1
• Aligned Length: 1092
• Identities: 879
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG  74
            |||||||||||..|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGCTCCAAGGTTACAGCTCCGTGGTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGCAATGACAGCAGCCGG  74

Query   75  GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG  148
            ||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct   75  GGCAGCTCTCGTGTTCATATTCTCCAGCGGGCAGAGGCGGATCTTAGACGGAAGCCTGGGCTTTGCCGCAGGGG  148

Query  149  TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT  222
            |||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  149  TCATGTTAGCGGCTTCCTACTGGTCGCTGCTTGCACCAGCGGTGGAGATGGCGACATCCTCGGGGGGCTTCGGA  222

Query  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT  296
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCAGTGGCTGTTGGCTTCACCCTGGGGGCCGCCTTTGTCTACCTGGCTGACCTCCTGAT  296

Query  297  GCCTCACTT-----------------------------------------------------------------  305
            |||||||.|                                                                 
Sbjct  297  GCCTCACCTGGTGAGTATCGACGTCCCGCTCCCCGCAGCAGACTTGCTTCTGTTTGCCTCGGTGGATCCATTCA  370

Query  306  -------GGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGGCCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGAAG  372
                   ||||||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|.|.||.|.|||||   |||||||
Sbjct  371  TACGTCAGGGTGCTACAGAAGACCCCCAGACAGCCCTGGCGCTGAACTTGGACCCTGCATTGAT---GAAGAAG  441

Query  373  TCTGATCCTGAGGGTCCC----GCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGACAAGAGTGAGA  442
            |||||||| .||||.|||    .|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  442  TCTGATCC-CAGGGACCCCACTTCGCTGCTCTTCCCGGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGACAAGCGTGAGA  514

Query  443  ATGGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGGGTCCTGC-TGTCCCTGTGCCTTC  515
            ||||.||||.|||.|||||.|||||||.||||||.||||.|||..||||||     || ||.||     ||.||
Sbjct  515  ATGGCGAGGTATACCAGAGGAAGAAGGTGGCAGCTACTGACCTCGCAGAGG-----GCGTGGCC-----CCCTC  578

Query  516  ----TCGA-----GGGA-ATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGAGGATCGCACTGCTCATCTTGGCC  579
                ||||     |||| .||.|| .|||||.||.||.|||||||||||||||||.||..||||||||.|||||
Sbjct  579  AGGATCGATGCACGGGAGCTCAGG-GCAGCCTGGGGGGAGCAGCTGGAGGAGGATTGCTTTGCTCATCCTGGCC  651

Query  580  ATCACTATACACAACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGCTATAGAAAAGACGGCATCTGC  653
            |||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||..||||||||||.||||||||
Sbjct  652  ATCACCATACACAACATTCCAGAGGGTCTTGCTGTTGGCGTAGGATTTGGAGCAGTAGAAAAGACTGCATCTGC  725

Query  654  TACCTTTGAGAGTGCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAGGGCCTGGCTGTCAGCC  727
            .|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  726  CACCTTCGAGAGTGCCAGGAATCTGGCCATTGGAATTGGGATCCAGAATTTCCCAGAGGGCCTGGCTGTCAGCC  799

Query  728  TTCCCTTGCGAGGGGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCC  801
            ||||..||||.||.|||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  800  TTCCTCTGCGTGGAGCAGGCTTCTCTACCTGGAAAGCTTTCTGGTATGGACAGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCC  873

Query  802  CTGGCCGGGGTCTTTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCCTTTGCTGC  875
            .||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  874  TTGGCTGGGGTCTTTGGAGCATTTGCGGTGGTACTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTATGCACTGGCCTTTGCTGC  947

Query  876  CGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCAGTGGTAATGGGAAACTGGCAT  949
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  948  TGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGATGACATCATCCCCGAGGCCCAGATCAGTGGCAACGGGAAGCTGGCAT  1021

Query  950  CCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTGGGC  1005
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 1022  CCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTGGTGATGATGTCCCTTGATGTGGGCCTCGGC  1077