Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480061
- Subject:
- XM_011249233.1
- Aligned Length:
- 1113
- Identities:
- 879
- Gaps:
- 123
Alignment
Query 1 ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG 74
|||||||||||..|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||
Sbjct 1 ATGCTCCAAGGTTACAGCTCCGTGGTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGCAATGACAGCAGCCGG 74
Query 75 GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG 148
||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 75 GGCAGCTCTCGTGTTCATATTCTCCAGCGGGCAGAGGCGGATCTTAGACGGAAGCCTGGGCTTTGCCGCAGGGG 148
Query 149 TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT 222
|||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 149 TCATGTTAGCGGCTTCCTACTGGTCGCTGCTTGCACCAGCGGTGGAGATGGCGACATCCTCGGGGGGCTTCGGA 222
Query 223 GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT 296
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCTTTGCCTTCTTCCCAGTGGCTGTTGGCTTCACCCTGGGGGCCGCCTTTGTCTACCTGGCTGACCTCCTGAT 296
Query 297 GCCTCACTT----------------------------------------------------------------- 305
|||||||.|
Sbjct 297 GCCTCACCTGGTGAGTATCGACGTCCCGCTCCCCGCAGCAGACTTGCTTCTGTTTGCCTCGGTGGATCCATTCA 370
Query 306 -------GGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGGCCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGAAG 372
||||||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|.|.||.|.||||| |||||||
Sbjct 371 TACGTCAGGGTGCTACAGAAGACCCCCAGACAGCCCTGGCGCTGAACTTGGACCCTGCATTGAT---GAAGAAG 441
Query 373 TCTGATCCTGAGGGTCCC----GCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGAT-------------- 428
|||||||| .||||.||| .|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 TCTGATCC-CAGGGACCCCACTTCGCTGCTCTTCCCGGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGGTAGCACTGGGC 514
Query 429 -------AGACAAGAGTGAGAATGGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGGGT 495
|||||||.||||||||||.||||.|||.|||||.|||||||.||||||.||||.|||..||||||
Sbjct 515 TTCTTTCAGACAAGCGTGAGAATGGCGAGGTATACCAGAGGAAGAAGGTGGCAGCTACTGACCTCGCAGAGG-- 586
Query 496 CCTGC-TGTCCCTGTGCCTTC----TCGA-----GGGA-ATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGAGG 558
|| ||.|| ||.|| |||| |||| .||.|| .|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 587 ---GCGTGGCC-----CCCTCAGGATCGATGCACGGGAGCTCAGG-GCAGCCTGGGGGGAGCAGCTGGAGGAGG 651
Query 559 ATCGCACTGCTCATCTTGGCCATCACTATACACAACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGC 632
||.||..||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 652 ATTGCTTTGCTCATCCTGGCCATCACCATACACAACATTCCAGAGGGTCTTGCTGTTGGCGTAGGATTTGGAGC 725
Query 633 TATAGAAAAGACGGCATCTGCTACCTTTGAGAGTGCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCC 706
..||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 726 AGTAGAAAAGACTGCATCTGCCACCTTCGAGAGTGCCAGGAATCTGGCCATTGGAATTGGGATCCAGAATTTCC 799
Query 707 CCGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCCTTGCGAGGGGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAG 780
|.|||||||||||||||||||||||..||||.||.|||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct 800 CAGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCTCTGCGTGGAGCAGGCTTCTCTACCTGGAAAGCTTTCTGGTATGGACAG 873
Query 781 CTGAGCGGCATGGTGGAGCCCCTGGCCGGGGTCTTTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCC 854
|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 874 CTGAGCGGCATGGTGGAGCCCTTGGCTGGGGTCTTTGGAGCATTTGCGGTGGTACTGGCTGAGCCCATCCTGCC 947
Query 855 CTACGCTCTGGCCTTTGCTGCCGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCA 928
|||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 948 CTATGCACTGGCCTTTGCTGCTGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGATGACATCATCCCCGAGGCCCAGATCA 1021
Query 929 GTGGTAATGGGAAACTGGCATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTG 1002
||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct 1022 GTGGCAACGGGAAGCTGGCATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTGGTGATGATGTCCCTTGATGTGGGCCTC 1095
Query 1003 GGC 1005
|||
Sbjct 1096 GGC 1098