Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480061
• Subject: XM_011249239.2
• Aligned Length: 1113
• Identities: 879
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG  74
            |||||||||||..|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGCTCCAAGGTTACAGCTCCGTGGTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGCAATGACAGCAGCCGG  74

Query   75  GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG  148
            ||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct   75  GGCAGCTCTCGTGTTCATATTCTCCAGCGGGCAGAGGCGGATCTTAGACGGAAGCCTGGGCTTTGCCGCAGGGG  148

Query  149  TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT  222
            |||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  149  TCATGTTAGCGGCTTCCTACTGGTCGCTGCTTGCACCAGCGGTGGAGATGGCGACATCCTCGGGGGGCTTCGGA  222

Query  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT  296
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCAGTGGCTGTTGGCTTCACCCTGGGGGCCGCCTTTGTCTACCTGGCTGACCTCCTGAT  296

Query  297  GCCTCACTT-----------------------------------------------------------------  305
            |||||||.|                                                                 
Sbjct  297  GCCTCACCTGGTGAGTATCGACGTCCCGCTCCCCGCAGCAGACTTGCTTCTGTTTGCCTCGGTGGATCCATTCA  370

Query  306  -------GGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGGCCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGAAG  372
                   ||||||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|.|.||.|.|||||   |||||||
Sbjct  371  TACGTCAGGGTGCTACAGAAGACCCCCAGACAGCCCTGGCGCTGAACTTGGACCCTGCATTGAT---GAAGAAG  441

Query  373  TCTGATCCTGAGGGTCCC----GCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGAT--------------  428
            |||||||| .||||.|||    .|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||              
Sbjct  442  TCTGATCC-CAGGGACCCCACTTCGCTGCTCTTCCCGGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGGTAGCACTGGGC  514

Query  429  -------AGACAAGAGTGAGAATGGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGGGT  495
                   |||||||.||||||||||.||||.|||.|||||.|||||||.||||||.||||.|||..||||||  
Sbjct  515  TTCTTTCAGACAAGCGTGAGAATGGCGAGGTATACCAGAGGAAGAAGGTGGCAGCTACTGACCTCGCAGAGG--  586

Query  496  CCTGC-TGTCCCTGTGCCTTC----TCGA-----GGGA-ATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGAGG  558
               || ||.||     ||.||    ||||     |||| .||.|| .|||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  587  ---GCGTGGCC-----CCCTCAGGATCGATGCACGGGAGCTCAGG-GCAGCCTGGGGGGAGCAGCTGGAGGAGG  651

Query  559  ATCGCACTGCTCATCTTGGCCATCACTATACACAACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGC  632
            ||.||..||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  652  ATTGCTTTGCTCATCCTGGCCATCACCATACACAACATTCCAGAGGGTCTTGCTGTTGGCGTAGGATTTGGAGC  725

Query  633  TATAGAAAAGACGGCATCTGCTACCTTTGAGAGTGCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCC  706
            ..||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  726  AGTAGAAAAGACTGCATCTGCCACCTTCGAGAGTGCCAGGAATCTGGCCATTGGAATTGGGATCCAGAATTTCC  799

Query  707  CCGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCCTTGCGAGGGGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAG  780
            |.|||||||||||||||||||||||..||||.||.|||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct  800  CAGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCTCTGCGTGGAGCAGGCTTCTCTACCTGGAAAGCTTTCTGGTATGGACAG  873

Query  781  CTGAGCGGCATGGTGGAGCCCCTGGCCGGGGTCTTTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCC  854
            |||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  874  CTGAGCGGCATGGTGGAGCCCTTGGCTGGGGTCTTTGGAGCATTTGCGGTGGTACTGGCTGAGCCCATCCTGCC  947

Query  855  CTACGCTCTGGCCTTTGCTGCCGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCA  928
            |||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  948  CTATGCACTGGCCTTTGCTGCTGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGATGACATCATCCCCGAGGCCCAGATCA  1021

Query  929  GTGGTAATGGGAAACTGGCATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTG  1002
            ||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.
Sbjct 1022  GTGGCAACGGGAAGCTGGCATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTGGTGATGATGTCCCTTGATGTGGGCCTC  1095

Query 1003  GGC  1005
            |||
Sbjct 1096  GGC  1098