Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000480061
Subject:
XM_017024335.1
Aligned Length:
1005
Identities:
833
Gaps:
171

Alignment

Query    1  ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG  74

Query   75  GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG  148

Query  149  TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT  222

Query  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT  296

Query  297  GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGGCCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGACCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA  370

Query  371  AGTCTGATCCTGAGGGTCCCGCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGACAAGAGTGAGAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  371  AGTCTGATCCTGAGGGTCCCGCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGAT----------------  428

Query  445  GGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGGGTCCTGCTGTCCCTGTGCCTTCTCG  518
                                                                                      
Sbjct  429  --------------------------------------------------------------------------  428

Query  519  AGGGAATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGAGGATCGCACTGCTCATCTTGGCCATCACTATACACA  592
                                                                                      
Sbjct  429  --------------------------------------------------------------------------  428

Query  593  ACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGCTATAGAAAAGACGGCATCTGCTACCTTTGAGAGT  666
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  -------AGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGCTATAGAAAAGACGGCATCTGCTACCTTTGAGAGT  495

Query  667  GCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCCTTGCGAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  496  GCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCCTTGCGAGG  569

Query  741  GGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCCCTGGCCGGGGTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  GGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCCCTGGCCGGGGTCT  643

Query  815  TTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCCTTTGCTGCCGGTGCCATGGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  644  TTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCCTTTGCTGCCGGTGCCATGGTC  717

Query  889  TACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCAGTGGTAATGGGAAACTGGCATCCTGGGCCTCCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  TACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCAGTGGTAATGGGAAACTGGCATCCTGGGCCTCCAT  791

Query  963  CCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTGGGC  1005
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  792  CCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTGGGC  834