Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480180
• Subject: NM_001199327.1
• Aligned Length: 2857
• Identities: 2185
• Gaps: 641

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGTGCTGTGCGGCGCGGTCTCAGGGAAGGTGGGGCTATGGCAGCTGCTAGGGACCCTCCGGAAGTATCGCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCGAGAAGCCACCCAGCGAAAATTGCGGAGGTTTTCCGAGCTAAGAGGCAAACTTGTAGCACGTGGAGAATTCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGGACATAGTTGCAATAACAGCGGCTGATGAAAAACAGGAACTTGCTTACAACCAACAGCTGTCAGAAAAGCTG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AAAAGAAAGGAGTTACCCCTTGGAGTTCAATATCACGTTTTTGTGGATCCTGCTGGAGCCAAAATTGGAAATGG  296

Query    1  ------------------------ATG---GGAAATTATAAATCTAGACCAACCCAA-ACTTGTA---------  37
                                    |||   |||||...||.||..|||..||...|| .|||.||         
Sbjct  297  AGGATCAACACTTTGTGCCCTTCAATGTTTGGAAAAGCTATATGGAGATAAATGGAATTCTTTTACCATCTTAT  370

Query   38  ---------CTGATGAATGGAAGAAAAAAGTCAGTGAATCATATGTTATCACAATAGAAAGATTAGAAGATGAC  102
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAATTCACTCTGATGAATGGAAGAAAAAAGTCAGTGAATCATATGTTATCACAATAGAAAGATTAGAAGATGAC  444

Query  103  CTGCAGATCAAGGAAAAAGAACTGACAGAACTAAGGAATATATTTGGCTCTGATGAAGCCTTCAGTAAAGTCAA  176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCAGATCAAGGAAAAAGAACTGACAGAACTAAGGAATATATTTGGCTCTGATGAAGCCTTCAGTAAAGTCAA  518

Query  177  TTTAAATTACCGCACTGAAAATGGGCTGTCTCTACTTCATTTATGTTGCATTTGTGGAGGCAAGAAATCACATA  250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTAAATTACCGCACTGAAAATGGGCTGTCTCTACTTCATTTATGTTGCATTTGTGGAGGCAAGAAATCACATA  592

Query  251  TTCGAACTCTTATGTTGAAAGGGCTCCGCCCATCTCGACTGACAAGAAATGGATTTACAGCCTTGCATTTAGCA  324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCGAACTCTTATGTTGAAAGGGCTCCGCCCATCTCGACTGACAAGAAATGGATTTACAGCCTTGCATTTAGCA  666

Query  325  GTTTACAAGGATAATGCAGAATTGATCACTTCTCTGCTTCACAGTGGAGCTGATATACAGCAGGTTGGATACGG  398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTTTACAAGGATAATGCAGAATTGATCACTTCTCTGCTTCACAGTGGAGCTGATATACAGCAGGTTGGATACGG  740

Query  399  TGGCCTCACTGCCCTCCATATTGCTACAATAGCTGGCCACCTAGAGGCTGCTGATGTGCTGTTGCAACATGGAG  472
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGCCTCACTGCCCTCCATATTGCTACAATAGCTGGCCACCTAGAGGCTGCTGATGTGCTGTTGCAACATGGAG  814

Query  473  CTAATGTCAATATTCAAGATGCAGTTTTTTTCACTCCATTGCATATTGCAGCGTACTATGGACATGAACAGGTA  546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTAATGTCAATATTCAAGATGCAGTTTTTTTCACTCCATTGCATATTGCAGCGTACTATGGACATGAACAGGTA  888

Query  547  ACTCGCCTTCTTTTGAAATTTGGTGCTGATGTAAATGTAAGTGGTGAAGTTGGAGATAGACCCCTCCACCTAGC  620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTCGCCTTCTTTTGAAATTTGGTGCTGATGTAAATGTAAGTGGTGAAGTTGGAGATAGACCCCTCCACCTAGC  962

Query  621  ATCTGCAAAAGGATTCTTGAATATTGCAAAACTCTTGATGGAAGAAGGCAGCAAAGCAGATGTGAATGCTCAAG  694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATCTGCAAAAGGATTCTTGAATATTGCAAAACTCTTGATGGAAGAAGGCAGCAAAGCAGATGTGAATGCTCAAG  1036

Query  695  ATAATGAAGACCATGTCCCACTCCATTTCTGTTCTCGATTTGGACACCATGATATAGTTAAGTATCTGCTGCAA  768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATAATGAAGACCATGTCCCACTCCATTTCTGTTCTCGATTTGGACACCATGATATAGTTAAGTATCTGCTGCAA  1110

Query  769  AGTGATTTGGAAGTTCAACCTCATGTTGTTAATATCTATGGAGATACCCCCTTACACCTGGCATGCTACAATGG  842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTGATTTGGAAGTTCAACCTCATGTTGTTAATATCTATGGAGATACCCCCTTACACCTGGCATGCTACAATGG  1184

Query  843  CAAATTTGAAGTTGCCAAGGAAATCATCCAAATATCAGGAACAGAAAGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTG  916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAAATTTGAAGTTGCCAAGGAAATCATCCAAATATCAGGAACAGAAAGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTG  1258

Query  917  AAACAGCTTTTCATAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAGCATTGACCTAGTCAAATTTCTTCTTGATCAGAATGTC  990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAACAGCTTTTCATAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAGCATTGACCTAGTCAAATTTCTTCTTGATCAGAATGTC  1332

Query  991  ATAAACATCAACCACCAAGGAAGGGATGGGCACACTGGATTACACTCTGCTTGCTACCACGGTCACATTCGCCT  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATAAACATCAACCACCAAGGAAGGGATGGGCACACTGGATTACACTCTGCTTGCTACCACGGTCACATTCGCCT  1406

Query 1065  GGTTCAGTTCTTACTGGATAATGGAGCTGATATGAATCTAGTGGCTTGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAA  1138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTTCAGTTCTTACTGGATAATGGAGCTGATATGAATCTAGTGGCTTGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAA  1480

Query 1139  AAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAAAAAGGGCATGATGCCATTGTCACACTCCTGAAGCATTAT  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAAAAAGGGCATGATGCCATTGTCACACTCCTGAAGCATTAT  1554

Query 1213  AAGAGACCACAAGATGAATTGCCCTGTAATGAATATTCTCAGCCTGGAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTTCC  1286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGAGACCACAAGATGAATTGCCCTGTAATGAATATTCTCAGCCTGGAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTTCC  1628

Query 1287  ATCACCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAGATATTCTCCTCCTAAGAGCTGGATTGCCTT  1360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATCACCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAGATATTCTCCTCCTAAGAGCTGGATTGCCTT  1702

Query 1361  CACATTTCCATCTTCAGCTCTCAGAAATTGAGTTCCATGAGATTATTGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTATAT  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CACATTTCCATCTTCAGCTCTCAGAAATTGAGTTCCATGAGATTATTGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTATAT  1776

Query 1435  AAAGGACGATGCAGAAATAAAATAGTGGCTATAAAACGTTATCGAGCCAATACCTACTGCTCCAAGTCAGATGT  1508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAAGGACGATGCAGAAATAAAATAGTGGCTATAAAACGTTATCGAGCCAATACCTACTGCTCCAAGTCAGATGT  1850

Query 1509  GGATATGTTTTGCCGAGAGGTGTCCATTCTCTGCCAGCTCAATCATCCCTGCGTAATTCAGTTTGTGGGTGCTT  1582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGATATGTTTTGCCGAGAGGTGTCCATTCTCTGCCAGCTCAATCATCCCTGCGTAATTCAGTTTGTGGGTGCTT  1924

Query 1583  GCTTGAATGATCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACTCAATACATATCAGGGGGTTCTCTGTTCTCCCTCCTTCAT  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCTTGAATGATCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACTCAATACATATCAGGGGGTTCTCTGTTCTCCCTCCTTCAT  1998

Query 1657  GAGCAGAAGAGGATTCTTGATTTGCAGTCTAAATTAATTATTGCAGTAGATGTTGCCAAAGGCATGGAGTACCT  1730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGCAGAAGAGGATTCTTGATTTGCAGTCTAAATTAATTATTGCAGTAGATGTTGCCAAAGGCATGGAGTACCT  2072

Query 1731  TCACAACCTGACACAGCCAATTATACATCGTGACTTGAACAGTCACAATATTCTTCTCTATGAGGATGGGCATG  1804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCACAACCTGACACAGCCAATTATACATCGTGACTTGAACAGTCACAATATTCTTCTCTATGAGGATGGGCATG  2146

Query 1805  CTGTGGTGGCAGATTTTGGAGAATCAAGATTTCTACAGTCTCTGGATGAAGACAACATGACAAAACAACCTGGG  1878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTGTGGTGGCAGATTTTGGAGAATCAAGATTTCTACAGTCTCTGGATGAAGACAACATGACAAAACAACCTGGG  2220

Query 1879  AACCTCCGTTGGATGGCTCCTGAGGTGTTCACGCAGTGCACTCGGTACACCATCAAAGCAGATGTCTTCAGCTA  1952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AACCTCCGTTGGATGGCTCCTGAGGTGTTCACGCAGTGCACTCGGTACACCATCAAAGCAGATGTCTTCAGCTA  2294

Query 1953  TGCTCTGTGTCTGTGGGAAATTCTCACTGGCGAAATTCCATTCGCTCATCTCAAGCCAGCGGCTGCGGCAGCAG  2026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGCTCTGTGTCTGTGGGAAATTCTCACTGGCGAAATTCCATTCGCTCATCTCAAGCCAGCGGCTGCGGCAGCAG  2368

Query 2027  ACATGGCTTACCACCACATCAGACCTCCCATTGGCTATTCCATTCCCAAGCCCATATCATCTCTGCTGATACGA  2100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACATGGCTTACCACCACATCAGACCTCCCATTGGCTATTCCATTCCCAAGCCCATATCATCTCTGCTGATACGA  2442

Query 2101  GGGTGGAACGCATGTCCTGAAGGA------AGACCCGAATTTTCTGAAGTTGTCATGAAGTTAGAAGAGTGTCT  2168
            ||||||||||||||||||||||.|      |||||           ||||                        
Sbjct 2443  GGGTGGAACGCATGTCCTGAAGCAAAATCCAGACC-----------AAGT------------------------  2481

Query 2169  CTGCAACATTGAGCTGATGTCTCCTGCATCAAGTAACAGCAGTGGGTCTCTCTCACCTTCTTCTTCTTCTGATT  2242
                  ||||                 |.|.||                 |||||.||                
Sbjct 2482  ------CATT-----------------ACCCAG-----------------TCTCATCT----------------  2499

Query 2243  GCCTGGTGAACCGGGGAGGACCTGGCCGGAGTCATGTGGCAGCA----TTAAGAAGTCGTTTCGAATTGGAATA  2312
                 |||.||                           .|||.|    |||||||        |||        
Sbjct 2500  -----GTGTAC---------------------------ACAGAAACTCTTAAGAA--------GAA--------  2525

Query 2313  TGCTCTAAATGCAAGGTCCTATGCTGCTTTGTCCCAAAGTGCTGGACAATATTCCTCTCAAGGTCTGTCTTTGG  2386
                  ||||| |||.||       |.||||            |||                   |||...|.|
Sbjct 2526  ------AAATG-AAGATC-------GTTTTG------------GGA-------------------TGTGGATTG  2554

Query 2387  AGGAGATGAAAAGAAGTCTTCAATACACACCCATTGACAAATATGGCTATGTATCCGATCCCATGAGCTCAATG  2460
            ||.|..|.|.||||                                                            
Sbjct 2555  AGTATCTCAGAAGA------------------------------------------------------------  2568

Query 2461  CATTTTCATTCTTGCCGAAATAGTAGCAGCTTTGAGGACAGCAGC  2505
                                                         
Sbjct 2569  ---------------------------------------------  2568