Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480180
• Subject: NM_015978.3
• Aligned Length: 2505
• Identities: 2505
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGGAAATTATAAATCTAGACCAACCCAAACTTGTACTGATGAATGGAAGAAAAAAGTCAGTGAATCATATGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAAATTATAAATCTAGACCAACCCAAACTTGTACTGATGAATGGAAGAAAAAAGTCAGTGAATCATATGT  74

Query   75  TATCACAATAGAAAGATTAGAAGATGACCTGCAGATCAAGGAAAAAGAACTGACAGAACTAAGGAATATATTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TATCACAATAGAAAGATTAGAAGATGACCTGCAGATCAAGGAAAAAGAACTGACAGAACTAAGGAATATATTTG  148

Query  149  GCTCTGATGAAGCCTTCAGTAAAGTCAATTTAAATTACCGCACTGAAAATGGGCTGTCTCTACTTCATTTATGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTCTGATGAAGCCTTCAGTAAAGTCAATTTAAATTACCGCACTGAAAATGGGCTGTCTCTACTTCATTTATGT  222

Query  223  TGCATTTGTGGAGGCAAGAAATCACATATTCGAACTCTTATGTTGAAAGGGCTCCGCCCATCTCGACTGACAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCATTTGTGGAGGCAAGAAATCACATATTCGAACTCTTATGTTGAAAGGGCTCCGCCCATCTCGACTGACAAG  296

Query  297  AAATGGATTTACAGCCTTGCATTTAGCAGTTTACAAGGATAATGCAGAATTGATCACTTCTCTGCTTCACAGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAATGGATTTACAGCCTTGCATTTAGCAGTTTACAAGGATAATGCAGAATTGATCACTTCTCTGCTTCACAGTG  370

Query  371  GAGCTGATATACAGCAGGTTGGATACGGTGGCCTCACTGCCCTCCATATTGCTACAATAGCTGGCCACCTAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGCTGATATACAGCAGGTTGGATACGGTGGCCTCACTGCCCTCCATATTGCTACAATAGCTGGCCACCTAGAG  444

Query  445  GCTGCTGATGTGCTGTTGCAACATGGAGCTAATGTCAATATTCAAGATGCAGTTTTTTTCACTCCATTGCATAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGCTGATGTGCTGTTGCAACATGGAGCTAATGTCAATATTCAAGATGCAGTTTTTTTCACTCCATTGCATAT  518

Query  519  TGCAGCGTACTATGGACATGAACAGGTAACTCGCCTTCTTTTGAAATTTGGTGCTGATGTAAATGTAAGTGGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCAGCGTACTATGGACATGAACAGGTAACTCGCCTTCTTTTGAAATTTGGTGCTGATGTAAATGTAAGTGGTG  592

Query  593  AAGTTGGAGATAGACCCCTCCACCTAGCATCTGCAAAAGGATTCTTGAATATTGCAAAACTCTTGATGGAAGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGTTGGAGATAGACCCCTCCACCTAGCATCTGCAAAAGGATTCTTGAATATTGCAAAACTCTTGATGGAAGAA  666

Query  667  GGCAGCAAAGCAGATGTGAATGCTCAAGATAATGAAGACCATGTCCCACTCCATTTCTGTTCTCGATTTGGACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCAGCAAAGCAGATGTGAATGCTCAAGATAATGAAGACCATGTCCCACTCCATTTCTGTTCTCGATTTGGACA  740

Query  741  CCATGATATAGTTAAGTATCTGCTGCAAAGTGATTTGGAAGTTCAACCTCATGTTGTTAATATCTATGGAGATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCATGATATAGTTAAGTATCTGCTGCAAAGTGATTTGGAAGTTCAACCTCATGTTGTTAATATCTATGGAGATA  814

Query  815  CCCCCTTACACCTGGCATGCTACAATGGCAAATTTGAAGTTGCCAAGGAAATCATCCAAATATCAGGAACAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCCTTACACCTGGCATGCTACAATGGCAAATTTGAAGTTGCCAAGGAAATCATCCAAATATCAGGAACAGAA  888

Query  889  AGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTGAAACAGCTTTTCATAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAGCATTGACCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTGAAACAGCTTTTCATAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAGCATTGACCT  962

Query  963  AGTCAAATTTCTTCTTGATCAGAATGTCATAAACATCAACCACCAAGGAAGGGATGGGCACACTGGATTACACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTCAAATTTCTTCTTGATCAGAATGTCATAAACATCAACCACCAAGGAAGGGATGGGCACACTGGATTACACT  1036

Query 1037  CTGCTTGCTACCACGGTCACATTCGCCTGGTTCAGTTCTTACTGGATAATGGAGCTGATATGAATCTAGTGGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGCTTGCTACCACGGTCACATTCGCCTGGTTCAGTTCTTACTGGATAATGGAGCTGATATGAATCTAGTGGCT  1110

Query 1111  TGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAAAAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAAAAAGGGCATGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAAAAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAAAAAGGGCATGA  1184

Query 1185  TGCCATTGTCACACTCCTGAAGCATTATAAGAGACCACAAGATGAATTGCCCTGTAATGAATATTCTCAGCCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCATTGTCACACTCCTGAAGCATTATAAGAGACCACAAGATGAATTGCCCTGTAATGAATATTCTCAGCCTG  1258

Query 1259  GAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTTCCATCACCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTTCCATCACCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAGAT  1332

Query 1333  ATTCTCCTCCTAAGAGCTGGATTGCCTTCACATTTCCATCTTCAGCTCTCAGAAATTGAGTTCCATGAGATTAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTCTCCTCCTAAGAGCTGGATTGCCTTCACATTTCCATCTTCAGCTCTCAGAAATTGAGTTCCATGAGATTAT  1406

Query 1407  TGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTATATAAAGGACGATGCAGAAATAAAATAGTGGCTATAAAACGTTATCGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTATATAAAGGACGATGCAGAAATAAAATAGTGGCTATAAAACGTTATCGAG  1480

Query 1481  CCAATACCTACTGCTCCAAGTCAGATGTGGATATGTTTTGCCGAGAGGTGTCCATTCTCTGCCAGCTCAATCAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCAATACCTACTGCTCCAAGTCAGATGTGGATATGTTTTGCCGAGAGGTGTCCATTCTCTGCCAGCTCAATCAT  1554

Query 1555  CCCTGCGTAATTCAGTTTGTGGGTGCTTGCTTGAATGATCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACTCAATACATATC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCTGCGTAATTCAGTTTGTGGGTGCTTGCTTGAATGATCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACTCAATACATATC  1628

Query 1629  AGGGGGTTCTCTGTTCTCCCTCCTTCATGAGCAGAAGAGGATTCTTGATTTGCAGTCTAAATTAATTATTGCAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGGGGGTTCTCTGTTCTCCCTCCTTCATGAGCAGAAGAGGATTCTTGATTTGCAGTCTAAATTAATTATTGCAG  1702

Query 1703  TAGATGTTGCCAAAGGCATGGAGTACCTTCACAACCTGACACAGCCAATTATACATCGTGACTTGAACAGTCAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TAGATGTTGCCAAAGGCATGGAGTACCTTCACAACCTGACACAGCCAATTATACATCGTGACTTGAACAGTCAC  1776

Query 1777  AATATTCTTCTCTATGAGGATGGGCATGCTGTGGTGGCAGATTTTGGAGAATCAAGATTTCTACAGTCTCTGGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AATATTCTTCTCTATGAGGATGGGCATGCTGTGGTGGCAGATTTTGGAGAATCAAGATTTCTACAGTCTCTGGA  1850

Query 1851  TGAAGACAACATGACAAAACAACCTGGGAACCTCCGTTGGATGGCTCCTGAGGTGTTCACGCAGTGCACTCGGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGAAGACAACATGACAAAACAACCTGGGAACCTCCGTTGGATGGCTCCTGAGGTGTTCACGCAGTGCACTCGGT  1924

Query 1925  ACACCATCAAAGCAGATGTCTTCAGCTATGCTCTGTGTCTGTGGGAAATTCTCACTGGCGAAATTCCATTCGCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACACCATCAAAGCAGATGTCTTCAGCTATGCTCTGTGTCTGTGGGAAATTCTCACTGGCGAAATTCCATTCGCT  1998

Query 1999  CATCTCAAGCCAGCGGCTGCGGCAGCAGACATGGCTTACCACCACATCAGACCTCCCATTGGCTATTCCATTCC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CATCTCAAGCCAGCGGCTGCGGCAGCAGACATGGCTTACCACCACATCAGACCTCCCATTGGCTATTCCATTCC  2072

Query 2073  CAAGCCCATATCATCTCTGCTGATACGAGGGTGGAACGCATGTCCTGAAGGAAGACCCGAATTTTCTGAAGTTG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAAGCCCATATCATCTCTGCTGATACGAGGGTGGAACGCATGTCCTGAAGGAAGACCCGAATTTTCTGAAGTTG  2146

Query 2147  TCATGAAGTTAGAAGAGTGTCTCTGCAACATTGAGCTGATGTCTCCTGCATCAAGTAACAGCAGTGGGTCTCTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCATGAAGTTAGAAGAGTGTCTCTGCAACATTGAGCTGATGTCTCCTGCATCAAGTAACAGCAGTGGGTCTCTC  2220

Query 2221  TCACCTTCTTCTTCTTCTGATTGCCTGGTGAACCGGGGAGGACCTGGCCGGAGTCATGTGGCAGCATTAAGAAG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TCACCTTCTTCTTCTTCTGATTGCCTGGTGAACCGGGGAGGACCTGGCCGGAGTCATGTGGCAGCATTAAGAAG  2294

Query 2295  TCGTTTCGAATTGGAATATGCTCTAAATGCAAGGTCCTATGCTGCTTTGTCCCAAAGTGCTGGACAATATTCCT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TCGTTTCGAATTGGAATATGCTCTAAATGCAAGGTCCTATGCTGCTTTGTCCCAAAGTGCTGGACAATATTCCT  2368

Query 2369  CTCAAGGTCTGTCTTTGGAGGAGATGAAAAGAAGTCTTCAATACACACCCATTGACAAATATGGCTATGTATCC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CTCAAGGTCTGTCTTTGGAGGAGATGAAAAGAAGTCTTCAATACACACCCATTGACAAATATGGCTATGTATCC  2442

Query 2443  GATCCCATGAGCTCAATGCATTTTCATTCTTGCCGAAATAGTAGCAGCTTTGAGGACAGCAGC  2505
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GATCCCATGAGCTCAATGCATTTTCATTCTTGCCGAAATAGTAGCAGCTTTGAGGACAGCAGC  2505