Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480180
• Subject: NM_177066.5
• Aligned Length: 2512
• Identities: 2136
• Gaps: 17

Alignment

Query    1  ATGGGAAATTATAAATCTAGACCAACCCAAACTTGTACTGATGAATGGAAGAAAAAAGTCAGTGAATCATATGT  74
            |||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||.
Sbjct    1  ATGGGGAATTACAAATCCAGACCGACACAGACTTGTTCTGATGAATGGAAGAAGAAAGTTAGTGAATCTTATGC  74

Query   75  TATCACAATAGAAAGATTAGAAGATGACCTGCAGATCAAGGAAAAAGAACTGACAGAACTAAGGAATATATTTG  148
            |||.|.|||||||||..|.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|...|||||||||..|.||.||||
Sbjct   75  TATTATAATAGAAAGGCTGGAAGATGACCTGCAGATCAAAGAAAATGAATTTCAAGAACTAAGACACATCTTTG  148

Query  149  GCTCTGATGAAGCCTTCAGTAAAGTCAATTTAAATTACCGCACTGAAAATGGGCTGTCTCTACTTCATTTATGT  222
            |||||||.||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||...|||.|||||.|||||.||..|.||.
Sbjct  149  GCTCTGACGAAGCCTTCAGTGAAGTCAGTTTAAATTACCGCACAGAGCGTGGCCTGTCCCTACTGCACCTCTGC  222

Query  223  TGCATTTGTGGAGGCAAGAAATCACATATTCGAACTCTTATGTTGAAAGGGCTCCGCCCATCTCGACTGACAAG  296
            ||....||.||.|||||.||.||.|||||.||..|.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct  223  TGTGCCTGCGGTGGCAACAAGTCGCATATCCGTGCCCTTATGTTAAAAGGGCTCCGTCCATCCAGACTGACAAG  296

Query  297  AAATGGATTTACAGCCTTGCATTTAGCAGTTTACAAGGATAATGC--AGAATTGATCACTTCTCTGCTTCACAG  368
            ||||||.|||.||||..||||.||.||.|||||||||||||  ||  .|||.|.||||||||.|||.|.||.||
Sbjct  297  AAATGGGTTTCCAGCTCTGCACTTGGCTGTTTACAAGGATA--GCCTGGAACTTATCACTTCACTGTTGCATAG  368

Query  369  TGGAGCTGATATACAGCAGGTTGGATACGGTGGCCTCACTGCCCTCCATATTGCTACAATAGCTGGCCACCTAG  442
            .|||||.|||.|.|||||.|..|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||.||||||||||.||||.||
Sbjct  369  CGGAGCAGATGTTCAGCAAGCGGGATATGGCGGCCTCACAGCCCTCCACATCGCTGCAATAGCTGGGCACCCAG  442

Query  443  AGGCTGCTGATGTGCTGTTGCAACATGGAGCTAATGTCAATATTCAAGATGCAGTTTTTTTCACTCCATTGCAT  516
            ||||.|..||.||||||.||||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||.||.|||||.|||.||||.
Sbjct  443  AGGCCGTGGAAGTGCTGCTGCAGCATGGAGCCAATGTGAACGTTCAAGATGCAGTCTTCTTCACCCCACTGCAC  516

Query  517  ATTGCAGCGTACTATGGACATGAACAGGTAACTCGCCTTCTTTTGAAATTTGGTGCTGATGTAAATGTAAGTGG  590
            ||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||..|..|.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  517  ATCGCAGCCTATTACGGGCACGAGCAGGTAACCAGTGTCCTTTTGAAGTTTGGAGCTGATGTCAATGTAAGCGG  590

Query  591  TGAAGTTGGAGATAGACCCCTCCACCTAGCATCTGCAAAAGGATTCTTGAATATTGCAAAACTCTTGATGGAAG  664
            ||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||..||||||   .|||.||
Sbjct  591  TGAAGTTGGAGACAGGCCTCTGCACCTGGCCTCTGCAAAAGGGTTCTTCAACATTGTGAAACTC---CTGGTAG  661

Query  665  AAGGCAGCAAAGCAGATGTGAATGCTCAAGATAATGAAGACCATGTCCCACTCCATTTCTGTTCTCGATTTGGA  738
            ||||.|.||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  662  AAGGGAACAAAGCCGACGTGAACGCTCAGGACAATGAAGACCATGTCCCTCTGCACTTCTGTTCTCGATTTGGA  735

Query  739  CACCATGATATAGTTAAGTATCTGCTGCAAAGTGATTTGGAAGTTCAACCTCATGTTGTTAATATCTATGGAGA  812
            |||||..|||||||.|..||..||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||..||||.||||||||.||
Sbjct  736  CACCACAATATAGTGAGCTACTTGCTCCAGAGTGACTTGGAGGTTCAGCCTCACGTCATTAACATCTATGGTGA  809

Query  813  TACCCCCTTACACCTGGCATGCTACAATGGCAAATTTGAAGTTGCCAAGGAAATCATCCAAATATCAGGAACAG  886
            .||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||..||.|||||||.|
Sbjct  810  CACTCCTTTGCACCTGGCGTGCTACAATGGAAATTTTGAAGTTGCCAAGGAAATTGTCCACGTAACAGGAACTG  883

Query  887  AAAGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTGAAACAGCTTTTCATAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAGCATTGAC  960
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  884  AAAGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTGAGACAGCTTTTCACAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAACATTGAC  957

Query  961  CTAGTCAAATTTCTTCTTGATCAGAATGTCATAAACATCAACCACCAAGGAAGGGATGGGCACACTGGATTACA  1034
            ||.||||||||.||||||||||||||||...|.|||||.|||||.|.||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  958  CTGGTCAAATTCCTTCTTGATCAGAATGCTGTGAACATTAACCATCGAGGAAGAGATGGGCACACAGGATTACA  1031

Query 1035  CTCTGCTTGCTACCACGGTCACATTCGCCTGGTTCAGTTCTTACTGGATAATGGAGCTGATATGAATCTAGTGG  1108
            |||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1032  CTCTGCTTGCTACCATGGCCACATACGCCTGGTTCAGTTCCTACTGGATAATGGTGCAGATATGAATCTAGTTG  1105

Query 1109  CTTGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAAAAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAAAAAGGGCAT  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1106  CTTGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAAAAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAGAAAGGACAT  1179

Query 1183  GATGCCATTGTCACACTCCTGAAGCATTATAAGAGACCACAAGATGAATTGCCCTGTAATGAATATTCTCAGCC  1256
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1180  GATGCCATTGTTACACTCCTGAAGCACTATAAGAGACCCCAGGATGAGCTGCCATGTAACGAATATTCTCAGCC  1253

Query 1257  TGGAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTTCCATCACCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAG  1330
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  TGGAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTCCCATCCCCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAG  1327

Query 1331  ATATTCTCCTCCTAAGAGCTGGATTGCCTTCACATTTCCATCTTCAGCTCTCAGAAATTGAGTTCCATGAGATT  1404
            ||.||||||||||.||.||||.|||.||.||.|.|||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1328  ATGTTCTCCTCCTGAGGGCTGAATTACCCTCCCGTTTCCATCTGCAGCTCTCGGAAATTGAATTCCATGAGATT  1401

Query 1405  ATTGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTATATAAAGGACGATGCAGAAATAAAATAGTGGCTATAAAACGTTATCG  1478
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1402  ATCGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTCTATAAAGGGCGATGCAGAAATAAAATAGTGGCAATCAAACGATACCG  1475

Query 1479  AGCCAATACCTACTGCTCCAAGTCAGATGTGGATATGTTTTGCCGAGAGGTGTCCATTCTCTGCCAGCTCAATC  1552
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1476  AGCCAACACCTACTGCTCCAAGTCAGACGTGGATATGTTTTGCCGAGAAGTGTCCATCCTCTGCCAGCTCAATC  1549

Query 1553  ATCCCTGCGTAATTCAGTTTGTGGGTGCTTGCTTGAATGATCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACTCAATACATA  1626
            |.||||||||..||||||||||||||||.|||.||.||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1550  ACCCCTGCGTGGTTCAGTTTGTGGGTGCCTGCCTGGATGACCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACACAATACATT  1623

Query 1627  TCAGGGGGTTCTCTGTTCTCCCTCCTTCATGAGCAGAAGAGGATTCTTGATTTGCAGTCTAAATTAATTATTGC  1700
            |||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1624  TCAGGAGGCTCTCTGTTCTCCCTGCTTCATGAACAGAAGAGAATTCTTGACTTGCAGTCTAAATTAATCATTGC  1697

Query 1701  AGTAGATGTTGCCAAAGGCATGGAGTACCTTCACAACCTGACACAGCCAATTATACATCGTGACTTGAACAGTC  1774
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.||||.|.||||.||||||||.|||||.||.|||.|||||||||
Sbjct 1698  AGTAGACGTTGCCAAGGGCATGGAGTACCTGCACAGCTTGACCCAGCCAATCATACACCGCGACCTGAACAGTC  1771

Query 1775  ACAATATTCTTCTCTATGAGGATGGGCATGCTGTGGTGGCAGATTTTGGAGAATCAAGATTTCTACAGTCTCTG  1848
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1772  ACAATATTCTTCTCTATGAGGACGGCCATGCTGTGGTGGCAGATTTTGGAGAATCAAGATTTCTGCAGTCCCTG  1845

Query 1849  GATGAAGACAACATGACAAAACAACCTGGGAACCTCCGTTGGATGGCTCCTGAGGTGTTCACGCAGTGCACTCG  1922
            ||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1846  GATGAAGACAACATGACAAAGCAGCCAGGGAACCTGCGCTGGATGGCCCCCGAGGTGTTCACACAGTGCACGCG  1919

Query 1923  GTACACCATCAAAGCAGATGTCTTCAGCTATGCTCTGTGTCTGTGGGAAATTCTCACTGGCGAAATTCCATTCG  1996
            .|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||..|.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1920  CTACACCATCAAGGCTGATGTCTTCAGTTACGCCCTGTGTCTGTGGGAGCTCCTCACTGGAGAAATTCCATTCG  1993

Query 1997  CTCATCTCAAGCCAGCGGCTGCGGCAGCAGACATGGCTTACCACCACATCAGACCTCCCATTGGCTATTCCATT  2070
            |||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1994  CTCATCTGAAGCCAGCCGCTGCAGCAGCAGATATGGCGTACCACCACATCAGACCTCCCATCGGCTACTCCATC  2067

Query 2071  CCCAAGCCCATATCATCTCTGCTGATACGAGGGTGGAACGCATGTCCTGAAGGAAGACCCGAATTTTCTGAAGT  2144
            ||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 2068  CCCAAGCCAATCTCATCTCTGCTGATGCGGGGCTGGAATGCATGTCCCGAAGGAAGACCCGAGTTCTCTGAAGT  2141

Query 2145  TGTCATGAAGTTAGAAGAGTGTCTCTGCAACATTGAGCTGATGTCTCCTGCATCAAGTAACAGCAGTGGGTCTC  2218
            .||.|.||||.|.||.|||||.||.||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2142  CGTTAGGAAGCTGGAGGAGTGCCTGTGTAACGTGGAGCTCATGTCTCCTGCATCAAGTAACAGCAGTGGCTCTC  2215

Query 2219  TCTCACCTTCTTCTTCTTCTGATTGCCTGGTGAACCGGGGAGGACCTGGCCGGAGTCATGTGGCAGCATTAAGA  2292
            |.||||||||.|||||||||||||||||..|||.|||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.|.
Sbjct 2216  TGTCACCTTCCTCTTCTTCTGATTGCCTACTGAGCCGAGGAGGGCCTGGCCGGAGCCATGTGGCAGCTTTACGG  2289

Query 2293  AGTCGTTTCGAATTGGAATATGCTCTAAATGCAAGGTCCTATGCTGCTTTGTCCCAAAGTGCTGG-----ACAA  2361
            ||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||..|||..|.|.|.|||||||..||     |||.
Sbjct 2290  AGTCGTTTTGAGTTGGAATACGCCCTAAATGCAAGGTCCTACACTGGGTGGCCTCAAAGTGTCGGGACACACAC  2363

Query 2362  TATTCCTCTCAAGGTCTGTCTTTGGAGGAGATGAAAAGAAGTCTTCAATACACACCCATTGACAAATATGGCTA  2435
            ||.|||     |||.||||||||||||||.|||||.|||.||...||.||..||.|..||||||||||||||||
Sbjct 2364  TAATCC-----AGGCCTGTCTTTGGAGGAAATGAACAGAGGTGCCCAGTATTCAGCTGTTGACAAATATGGCTA  2432

Query 2436  TGTATCCGATCCCATGAGCTCAATGCATTTTCATTCTTGCCGAAATAGTAGCAGCTTTGAGGACAGCAGC  2505
            .||.||.||||||||||||.|.|||||..|.||.||..||||.||.|||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct 2433  CGTGTCTGATCCCATGAGCCCGATGCACCTCCACTCCCGCCGGAACAGTGGCAGCTTTGAGGACGGCAAC  2502